Comprendre la dynamique de l'actine dans l'endocytose médiée par la clathrine
Un aperçu de comment l'actine influence l'absorption de matériel cellulaire.
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Table des matières
Les cellules, c'est comme des petites usines qui ont toujours besoin d'absorber des trucs de leur environnement. Un moyen super important qu'elles ont pour faire ça, c'est un processus qui s'appelle l'Endocytose médiée par la clathrine (CME). Ce processus permet aux cellules de créer des petites structures en forme de bulle appelées Vésicules qui transportent des matériaux de l'extérieur de la cellule vers son intérieur.
L'assemblage des vésicules endocytotiques
Dans la CME, plein de protéines se regroupent rapidement pour remodeler la membrane extérieure de la cellule en une vésicule. C'est un effort coordonné où différentes protéines bossent ensemble pour former et pincer ces petites structures. Dans certains organismes simples comme les levures, un réseau spécial fait de fibres de protéines appelé Actine est super crucial pour ça. Ce réseau d'actine aide à générer la force nécessaire pour résister à la pression interne de la cellule.
Malgré beaucoup de recherches sur la façon dont ces protéines agissent pendant l'endocytose, il y a encore plein de choses à découvrir sur la mécanique globale du processus. Des études utilisant des techniques d'imagerie avancées ont montré le moment précis où différentes protéines et aspects du réseau d'actine entrent en jeu pendant la CME.
Le rôle de l'actine dans l'endocytose
L'actine est essentielle pour la CME car elle fournit la force mécanique requise pour déformer la membrane cellulaire. Cette protéine peut s'assembler et se désassembler rapidement, ce qui est fondamental pour maintenir la nature dynamique du processus endocytaire. Les chercheurs ont trouvé que le réseau d'actine près des sites endocytotiques peut changer rapidement. Les molécules qui se lient à l'actine semblent aussi échanger rapidement, permettant aux structures d'actine de se former et de se reformer selon les besoins lors de la production de vésicules.
Des expériences récentes ont montré que la durée de vie de ces structures d'actine est assez courte, généralement autour de 20 secondes. Cependant, certaines protéines qui s'associent à l'actine ont tendance à rester là seulement 1 à 2 secondes. Ce turnover rapide est vital car il permet à la cellule de s'adapter rapidement en absorbant des matériaux.
Simuler la dynamique de l'actine
Pour mieux comprendre comment fonctionnent les dynamiques de l'actine dans ce contexte, les chercheurs ont utilisé des simulations informatiques pour reproduire le comportement de l'actine et d'autres composants biochimiques pendant la CME. Les simulations ont montré que pour correspondre au comportement observé de l'actine, le taux de dégradation des filaments d'actine doit être beaucoup plus rapide que ce qu'on pensait traditionnellement.
Fait intéressant, les simulations ont démontré que retirer des parties du réseau d'actine pouvait aussi mener à un turnover plus rapide des protéines associées à l'actine, mettant en avant la complexité des dynamiques dans le processus endocytaire.
Temps de séjour
Comprendre lesUne partie importante de cette recherche s'est concentrée sur la mesure de combien de temps les protéines restent attachées aux filaments d'actine pendant la CME, ce qu'on appelle leur "temps de séjour". On a découvert que les temps de séjour suivaient un schéma unique, où beaucoup de protéines avaient leurs temps de séjour regroupés autour de certaines valeurs, indiquant qu'elles passent seulement un court moment liées à l'actine.
Cependant, les schémas de temps de séjour pour différentes protéines n'étaient pas tous les mêmes. Par exemple, le comportement d'une protéine spécifique liant l'actine appelée fimbrine montrait deux pics distincts de temps de séjour, suggérant une interaction plus complexe.
Analyser les doubles pics de fimbrine
La présence de deux pics distincts dans le temps de séjour de la fimbrine a suscité la curiosité. Les chercheurs ont voulu déterminer si cela était dû à la participation de la fimbrine à divers processus cellulaires en dehors de la CME. Cependant, une analyse plus poussée a indiqué que ces pics sont présents peu importe l'emplacement de la fimbrine dans la cellule, confirmant qu'ils sont liés à son rôle pendant l'endocytose.
Le turnover rapide de la fimbrine suggère aussi qu'elle est influencée par les forces mécaniques en jeu pendant la CME. Le premier pic s'aligne avec le comportement typique d'autres protéines associées à l'actine, tandis que le second, plus rapide, indique que la fimbrine se détache des filaments d'actine plus rapidement lorsqu'elle est sous tension.
Modéliser les dynamiques
En modélisant les interactions de la fimbrine avec les filaments d'actine, les chercheurs ont démontré que les forces en jeu dans le réseau d'actine pouvaient affecter combien de temps la fimbrine reste attachée. Lorsque la dynamique de liaison de la fimbrine a été simulée dans des conditions tenant compte du stress mécanique, les deux pics dans sa distribution de temps de séjour sont apparus naturellement.
Ce comportement a fourni des aperçus sur l'importance de la force pour déterminer comment les protéines interagissent avec le cytosquelette. Comprendre ces dynamiques aide à clarifier comment les cellules peuvent efficacement et rapidement absorber des matériaux.
Implications pour la fonction cellulaire
Les découvertes sur les dynamiques de l'actine et les interactions protéiques pendant la CME ont des implications plus larges. Les taux de turnover élevés de l'actine et des protéines qui s'y lient suggèrent que les cellules peuvent changer rapidement de comportement en réponse à différentes conditions environnementales.
De plus, l'interaction entre les forces mécaniques et les dynamiques de liaison des protéines peut permettre aux cellules de mieux s'adapter à divers tâches au-delà de l'endocytose, comme le mouvement et la division cellulaire.
Conclusion
En résumé, le processus d'absorption de matériaux par l'endocytose médiée par la clathrine est super complexe et implique plein de protéines, surtout l'actine. Le turnover rapide de l'actine et les interactions dynamiques avec d'autres protéines permettent aux cellules de fonctionner efficacement. Explorer ces mécanismes continuera d'approfondir notre compréhension du comportement cellulaire et pourrait fournir des idées sur comment influencer ces processus dans divers contextes biologiques. En apprenant plus sur les dynamiques de processus cellulaires comme la CME, on peut mieux apprécier les systèmes intriqués qui maintiennent la vie au niveau cellulaire.
Titre: Fast actin disassembly and fimbrin mechanosensitivity support rapid turnover during clathrin-mediated endocytosis
Résumé: The actin cytoskeleton is central to force production in numerous cellular processes in eukaryotic cells. During clathrin-mediated endocytosis (CME), a dynamic actin meshwork is required to deform the membrane against high membrane tension or turgor pressure. Previous experimental work from our lab showed that several endocytic proteins, including actin and actin-interacting proteins, turn over several times during the formation of a vesicle during CME in yeast, and their dwell time distributions were reminiscent of Gamma distributions with a peak around 1 s (Lacy et al., 2019). However, the distribution for the filament crosslinking protein fimbrin contains a second peak around 0.5 s. To better understand the nature of these dwell time distributions, we developed a stochastic model for the dynamics of actin and its binding partners. Our model demonstrates that very fast actin filament disassembly is necessary to reproduce experimental dwell time distributions. Our model also predicts that actin-binding proteins bind rapidly to nascent filaments and filaments are fully decorated. Last, our model predicts that fimbrin detachment from actin endocytic structures is mechanosensitive to explain the extra peak observed in the dwell time distribution.
Auteurs: Julien Berro, S. I. Mousavi, M. M. Lacy, X. Li
Dernière mise à jour: 2024-09-23 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.11.25.517735
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.11.25.517735.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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