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Une nouvelle méthode éclaire les défauts cardiaques

Des chercheurs ont développé une méthode pour analyser la structure du cœur et les variations du flux sanguin.

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Les Malformations cardiaques congénitales (MCC) sont les malformations de naissance les plus courantes chez les bébés. Elles touchent environ 1 nouveau-né sur 100 aux États-Unis. Malgré leur fréquence, seule une petite partie peut être liée à des facteurs génétiques ou environnementaux. Les scientifiques réalisent que des problèmes dans la formation du cœur et des vaisseaux sanguins peuvent entraîner ces défauts.

Des chercheurs ont découvert qu'en manipulant le flux sanguin dans les cœurs en développement d'organismes modèles, ils peuvent créer des malformations cardiaques ressemblant à celles trouvées chez les humains. Ça suggère que le flux sanguin anormal joue un rôle important dans le développement et le fonctionnement du cœur. Un facteur clé qui influence le développement cardiaque est la contrainte de cisaillement, qui est la force du flux sanguin contre les parois des vaisseaux sanguins. Des études ont montré que cette contrainte influence différents aspects du développement cardiaque via des mécanismes sensibles aux changements physiques.

Défis de la mesure du flux sanguin

Bien qu'on sache que la contrainte de cisaillement est essentielle pour le développement cardiaque, la mesure précise dans les embryons est compliquée. La petite taille et la délicatesse des cœurs embryonnaires, combinées à leur action de pompage continue, rendent difficile la capture de mesures précises du flux sanguin et de la contrainte de cisaillement. À cause de ça, les chercheurs n'ont pas pu étudier directement comment les variations dans le flux sanguin pourraient impacter le développement du cœur et des vaisseaux sanguins.

Pour résoudre ce problème, les scientifiques utilisent des Modèles informatiques pour simuler le flux sanguin et analyser les forces agissant à l'intérieur du cœur. Ces simulations informatiques, connues sous le nom de dynamique des fluides computationnelle (CFD), offrent des alternatives aux mesures directes. Cependant, il manque des méthodes claires pour créer des modèles anatomiques détaillés des cœurs embryonnaires à utiliser dans ces simulations.

Dans cette étude, les chercheurs visent à créer une méthode qui permet une simulation détaillée de la dynamique du flux sanguin dans les cœurs embryonnaires. En rassemblant et analysant des données précises d'un groupe d'embryons, ils peuvent mieux comprendre comment les variations dans leur structure peuvent entraîner des différences dans le flux sanguin et le développement de défauts.

Morphométrie et besoin de nouvelles méthodes

Créer des modèles tridimensionnels précis des embryons présente des défis. Les méthodes d'imagerie traditionnelles ne fournissent souvent pas de données impartiales pour comprendre les différences géométriques parmi les spécimens. Il n'y a pas d'approche standard pour quantifier les formes et les tailles des embryons, ce qui complique l'analyse systématique des différences.

Cependant, des chercheurs dans d'autres domaines, comme la paléontologie et l'anthropologie, ont utilisé une approche statistique connue sous le nom de morphométrie pour analyser des données tridimensionnelles. Cette méthode examine la forme et la taille des spécimens, en utilisant des mesures comme les longueurs et les angles. La Morphométrie géométrique, qui a évolué à partir de la morphométrie traditionnelle, permet aux scientifiques d'étudier des structures plus complexes en se concentrant sur des points de référence spécifiques, ou des repères, à travers plusieurs spécimens.

Bien que la morphométrie géométrique ait été utilisée dans certaines études biologiques, elle n'a pas encore été largement adoptée en biologie du développement, notamment dans la recherche sur le cœur. Dans cette étude, les chercheurs décident d'utiliser cette méthode pour analyser les formes cardiaques d'un groupe de poussins embryonnaires, cherchant à mettre en évidence les variations naturelles et la sensibilité de la méthode aux différences géométriques.

Pourquoi des embryons de poulet ?

Les embryons de poulet sont un modèle utile pour étudier le développement cardiaque parce qu'ils partagent des similarités de développement avec les cœurs humains et sont faciles à manipuler pour la recherche. Des études précédentes ont déjà modélisé des embryons de poulet en utilisant des techniques CFD, mais beaucoup de ces études se sont basées sur des géométries simplifiées qui ne capturent pas pleinement les variations individuelles parmi les embryons.

En reconstruisant les caractéristiques anatomiques uniques de chaque embryon de poulet, les chercheurs peuvent étudier comment ces variations affectent le flux sanguin local et la contrainte de cisaillement. Les arches aortiques - les principaux vaisseaux sanguins reliant le cœur au reste du corps - sont particulièrement importantes, car c'est là que de nombreuses malformations cardiaques congénitales se produisent. Comprendre comment le sang circule à travers ces zones est crucial pour traiter les défauts cardiaques.

Développement d'une nouvelle méthode d'analyse

L'objectif de cette étude est de créer une nouvelle méthode qui capture efficacement la variation de l'anatomie cardiaque et le flux sanguin qui en résulte. Les chercheurs conçoivent un pipeline qui combine des techniques d'imagerie avancées avec des simulations numériques du flux sanguin.

La première étape consiste à marquer les vaisseaux sanguins dans les embryons de poulet avec un colorant fluorescent, permettant aux chercheurs de visualiser les détails complexes des structures vasculaires. Ce tissu marqué est ensuite nettoyé de la matière de fond pour améliorer la qualité de l'imagerie. Les embryons sont ensuite imager avec une technique appelée microscopie à fluorescence par plan lumineux, qui capture des images de haute résolution tout en minimisant les effets indésirables comme le photoblanchiment.

Une fois les images collectées, les chercheurs segmentent le cœur et les structures vasculaires pour analyse. Ce processus implique d'identifier et de délimiter les régions spécifiques d'intérêt, comme les arches aortiques et le tractus de sortie du cœur. Après la segmentation, des techniques avancées sont utilisées pour analyser les formes et les tailles des structures en comparaison les unes avec les autres.

Utilisation de la morphométrie géométrique

Les chercheurs appliquent la morphométrie géométrique pour évaluer les variations anatomiques à travers le groupe d'embryons. En plaçant des repères sur les structures, ils peuvent comparer les similarités et les différences géométriques parmi les spécimens. Les variations sont examinées à l'aide d'une méthode appelée analyse de Procrustes, qui quantifie les différences entre les formes en comparant les positions de leurs repères après les avoir alignés.

À travers cette analyse, les chercheurs peuvent visualiser comment l'anatomie des différents embryons diffère de manière significative. Les résultats indiquent que certaines caractéristiques structurelles présentent plus de variations que d'autres, offrant un aperçu des parties du cœur qui sont plus susceptibles d'être affectées par des défauts congénitaux.

Comprendre la dynamique du flux sanguin

Pour étudier la dynamique du flux sanguin, les chercheurs utilisent les données d'imagerie pour créer des modèles informatiques détaillés des cœurs des embryons de poulet. Le flux sanguin est modélisé comme un fluide se déplaçant à travers ces structures complexes, et des simulations sont effectuées pour observer comment les variations anatomiques affectent les schémas de contrainte de cisaillement.

La géométrie des vaisseaux sanguins, comme la forme et la taille des arches aortiques, joue un rôle crucial dans la détermination de la façon dont le sang circule dans le cœur. Les chercheurs trouvent que l'arche aortique centrale a tendance à connaître les niveaux de contrainte de cisaillement les plus élevés, même si elle est plus courte que les arches voisines. Cette découverte suggère que d'autres facteurs, au-delà de la seule taille des artères, influencent comment le sang circule et où le stress est concentré.

Les modèles informatiques permettent aux chercheurs de visualiser et de quantifier en temps réel la dynamique du flux sanguin, offrant une image plus claire de la manière dont chaque caractéristique anatomique contribue à la fonction globale du cœur. Avec la possibilité d'examiner différentes configurations anatomiques, les chercheurs peuvent mieux comprendre comment des changements spécifiques pourraient conduire à des défauts congénitaux.

Implications pour la recherche future

Le nouveau pipeline développé dans cette étude ouvre la voie à de nombreuses possibilités de recherche futures. En utilisant des techniques d'imagerie avancées et de modélisation informatique, les chercheurs peuvent maintenant étudier comment des facteurs génétiques ou d'autres interventions pourraient affecter le développement cardiaque en temps réel. Cela permet des études à haut débit pouvant inclure un plus grand nombre d'embryons, augmentant ainsi la puissance statistique des résultats.

De plus, ces méthodes pourraient être adaptées pour enquêter sur comment différents facteurs environnementaux pourraient jouer un rôle dans le développement cardiaque et la formation de défauts. En combinant la manipulation génétique avec cette approche d'imagerie et de modélisation, les chercheurs peuvent découvrir de nouvelles idées sur les périodes critiques durant lesquelles le développement du cœur est le plus susceptible d'être perturbé.

Conclusion

Les malformations cardiaques congénitales représentent un défi de santé significatif qui touche de nombreux nouveau-nés. Comprendre l'interaction complexe entre l'anatomie et le flux sanguin durant le développement du cœur est crucial pour développer de meilleures stratégies de prévention et de traitement. Les méthodes développées dans cette étude offrent un moyen puissant d'évaluer ces facteurs chez les poussins embryonnaires.

Grâce à la combinaison de techniques d'imagerie avancées, d'analyse géométrique et de modélisation informatique, les chercheurs peuvent désormais examiner comment les variations de la structure cardiaque sont liées à la dynamique du flux sanguin et au risque de défauts congénitaux. Les résultats de cette recherche contribueront à une compréhension plus profonde du développement cardiaque et pourraient potentiellement mener à des avancées révolutionnaires dans la science médicale.

Source originale

Titre: A Combined Computational Fluid Dynamics Modeling and Geometric Morphometrics Methods Approach to Quantifying Hemodynamic and Anatomical Features of Embryonic Chick Heart Anatomies Reconstructed from Light Sheet Fluorescence Microscopy Imaging

Résumé: Although congenital heart defects occur in approximately 1% of newborns in the US annually, their pathogenesis remains largely unknown. Less than a third of congenital heart defects are traced a known genetic or environmental cause. It has been demonstrated that hemodynamic forces such as wall shear stress are critical for heart development. However, measuring these hemodynamic factors in vivo is infeasible due to physical limitations, such as the small size and constant motion of the embryonic heart. An alternative approach is to recapitulate the hemodynamic environment by simulating blood flow and calculating the resulting hemodynamic forces through computational fluid dynamics modeling. We use computational fluid dynamics modeling to quantify hemodynamics in a cohort of cell-accurate embryonic chick heart anatomies reconstructed using light sheet fluorescent microscopy. Additionally, we perform a quantitative analysis on geometric features using geometric morphometric methods. Together, the high-resolution but accessible imaging technique of light sheet fluorescence microscopy to reconstruct the anatomies paired with computational fluid dynamics modeling and geometric morphometrics methods produces a fast and accessible pipeline for quantitative hemodynamic and anatomical analysis in embryonic heart development.

Auteurs: Michael Bressan, K. Giesbrecht, B. Griffith

Dernière mise à jour: 2024-10-12 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.08.611246

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.08.611246.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

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