Nouvelles idées sur les glycoprotéines du virus de l'herpès
Des recherches montrent des mécanismes cruciaux derrière l'entrée et la fusion du virus de l'herpès.
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Table des matières
- Comprendre l'entrée et la fusion des herpesvirus
- Explorer la structure de la glycoprotéine B d'EBV
- Nouvelles découvertes sur la stabilisation de la glycoprotéine B
- Le rôle du domaine V dans la glycoprotéine B
- Concevoir de nouvelles protéines de fusion pour une stabilité accrue
- Observations des changements conformational dans la glycoprotéine B
- Application générale des techniques de stabilisation à d'autres herpesvirus
- Perspectives structurelles des études Cryo-EM
- Mécanismes des Anticorps neutralisants contre la glycoprotéine B
- Implications pour le développement futur de vaccins
- Conclusion
- Source originale
Les herpesvirus sont des virus courants qui touchent plein de gens à travers le monde. Ils peuvent causer des problèmes de santé graves, comme le cancer et des soucis neurologiques. Parmi les différents types d'herpesvirus, le virus d'Epstein Barr (EBV) est notable car il est lié à environ 1,3 % à 1,9 % de tous les cancers humains et a un lien fort avec la sclérose en plaques. Un autre herpesvirus, le cytomégalovirus (CMV), est une grande cause de perte d'audition chez les nouveau-nés, ce qui peut entraîner des handicaps durables. Chez les personnes âgées, les virus de l'herpès simplex (HSV1 et HSV2) et le virus varicelle-zona (VZV)-le virus qui cause la varicelle et le zona-sont liés à la démence.
Avec une telle gamme d'infections par les herpesvirus, des méthodes de prévention efficaces comme les vaccins sont urgemment nécessaires. Cependant, la plupart des herpesvirus n'ont pas de vaccins disponibles. La seule exception est le vaccin vivant atténué pour le VZV, qui peut réduire considérablement les cas de varicelle et de zona. Récemment, un nouveau vaccin sous-unitaire a montré des promesses pour réduire les cas de zona.
Comprendre l'entrée et la fusion des herpesvirus
Les herpesvirus pénètrent dans les cellules humaines en utilisant des protéines spécifiques à leur surface. Les principales protéines impliquées sont connues sous le nom de glycoprotéines, en particulier la glycoprotéine H (gH) et la glycoprotéine L (gL), qui travaillent ensemble en paire. Ces protéines se fixent aux récepteurs sur les cellules de l'hôte pour permettre au virus d'entrer.
Une fois que le virus se lie au récepteur, gH/gL déclenche une autre protéine appelée glycoprotéine B (gB) pour subir des changements qui favorisent la fusion des membranes du virus et de la cellule. Comprendre comment ces protéines fonctionnent ensemble est crucial car cela peut nous aider à concevoir des vaccins et thérapies efficaces.
Il y a beaucoup de lacunes dans notre compréhension de comment ces protéines permettent aux herpesvirus d'entrer dans les cellules humaines. Par exemple, bien que les chercheurs aient noté que gH/gL interagit avec les récepteurs de la cellule hôte, le comportement de la plupart des anticorps qui ciblent gB reste largement flou.
Explorer la structure de la glycoprotéine B d'EBV
Un domaine clé de recherche concerne la structure de la glycoprotéine B (gB) d'EBV, qui n'a pas été bien étudiée comparée à d'autres herpesvirus. Une forme stable de gB est nécessaire pour aider les chercheurs à mieux comprendre comment elle cause des infections et à développer des vaccins.
Des études récentes ont réussi à stabiliser la structure de la protéine gB d'EBV dans son état de pré-fusion, qui est la forme qu'elle prend avant que le virus n'entre dans une cellule hôte. Cela a été réalisé en utilisant de nouvelles techniques qui combinent biologie structurelle et méthodes d'apprentissage automatique. Ces avancées permettent aux scientifiques d'identifier les changements dans gB qui se produisent lorsque le virus se lie aux cellules hôtes.
Nouvelles découvertes sur la stabilisation de la glycoprotéine B
Les chercheurs se sont concentrés sur la compréhension et la stabilisation des différents domaines de gB, en particulier les interactions entre ses diverses parties. Un domaine clé est la suppression d'une boucle spécifique reliant deux domaines, DII et DIII. Cette boucle est significative car elle peut affecter la stabilité de la structure de gB. Lorsque la boucle est retirée, la structure a subi un changement inattendu vers un état de post-fusion.
Pour contrer cela, d'autres suppressions ont été faites pour stabiliser l'état de pré-fusion de gB. Les scientifiques ont expérimenté différents designs, y compris l'introduction de liaisons disulfure-des liaisons chimiques spéciales qui peuvent aider à stabiliser les structures protéiques.
Le rôle du domaine V dans la glycoprotéine B
En plus de ces modifications, les scientifiques ont également ciblé le domaine V de gB pour la stabilisation. Ils ont utilisé des approches de conception assistée par ordinateur pour développer un nouveau motif de trimerisation, connu sous le nom de oP3h, qui joue un rôle dans la garantie que le domaine V reste dans l'état de pré-fusion désiré. Ils ont testé diverses configurations pour trouver le meilleur moyen de garder gB stable.
Lorsque ces changements ont été effectués, ils ont observé une amélioration de la stabilité dans la conformation de pré-fusion de gB, leur permettant de visualiser les interactions entre les différents domaines.
Concevoir de nouvelles protéines de fusion pour une stabilité accrue
Pour solidifier davantage la stabilité de gB, les chercheurs ont conçu de nouvelles protéines de fusion. Ils se sont concentrés sur l'insertion de motifs trimériques spéciaux dans gB pour aider à maintenir sa structure. L'objectif était de garder la forme de pré-fusion intacte et de comprendre comment gB interagit avec d'autres protéines importantes lors de la fusion.
Ce nouveau design de protéine de fusion a réussi à maintenir la stabilité conformational de gB, permettant aux chercheurs de l'imager plus clairement. Dans les expériences, les scientifiques ont découvert que les designs optimisés permettaient des structures qui ressemblaient de près à l'état de pré-fusion trouvé dans d'autres protéines apparentées.
Observations des changements conformational dans la glycoprotéine B
À travers leur travail, les chercheurs ont noté des changements conformational importants dans la structure de gB. La position des différents domaines peut changer en réponse à la liaison et peut jouer un rôle dans la façon dont le virus fusionne avec la membrane cellulaire de l'hôte.
Les résultats ont suggéré que les hypothèses précédentes sur les mécanismes de fusion pourraient devoir être réévaluées. Plus précisément, il a été proposé que le retournement de certains domaines peut se produire plus tard que ce qui était pensé, et que maintenir la stabilité du domaine V pourrait prévenir d'autres domaines de se retourner prématurément.
Application générale des techniques de stabilisation à d'autres herpesvirus
Les méthodes développées pour stabiliser gB d'EBV ont des implications au-delà de ce virus. Des techniques similaires pourraient fonctionner avec d'autres herpesvirus comme le CMV, HHV6B, HSV1, et VZV, indiquant que les mécanismes sous-jacents de fusion pourraient être similaires entre les types d'herpesvirus.
Les chercheurs ont testé ces stratégies de stabilisation sur diverses protéines virales, et les résultats ont montré que des propriétés de pré-fusion similaires étaient atteintes. Cela indique une approche généralisable qui pourrait aider au développement de vaccins non seulement pour l'EBV mais aussi pour d'autres herpesvirus.
Perspectives structurelles des études Cryo-EM
La cryo-microscopie électronique (Cryo-EM) a joué un rôle essentiel dans cette recherche. Elle a permis aux scientifiques de visualiser précisément les structures de gB et d'observer les effets des mutations et des suppressions sur sa stabilité. L'imagerie haute résolution a révélé que plusieurs caractéristiques structurelles clés s'alignaient bien avec la forme de pré-fusion de gB.
Les données collectées ont suggéré que certaines mutations pourraient être utilisées efficacement pour stabiliser les protéines à travers diverses familles d'herpesvirus. L'observation de la façon dont différents domaines se comportaient dans diverses configurations a également souligné l'importance de l'intégrité structurelle pour une entrée et une fusion virales efficaces.
Anticorps neutralisants contre la glycoprotéine B
Mécanismes desLa recherche a également fourni des perspectives sur la façon dont les anticorps neutralisants pourraient agir contre gB. Comprendre les mécanismes derrière ces anticorps est essentiel pour développer de nouvelles thérapies. Les premières découvertes ont suggéré que certains anticorps pourraient bloquer des interactions importantes nécessaires pour l'entrée virale, tandis que d'autres pourraient favoriser des changements dans la structure de gB.
En analysant les structures de gB lié aux anticorps, les chercheurs pouvaient mieux prédire quelles régions de gB identifient les anticorps et déterminer comment ces interactions influencent la capacité du virus à infecter les cellules.
Implications pour le développement futur de vaccins
Les résultats globaux de cette recherche soulignent l'importance de stabiliser la forme de pré-fusion de gB pour le développement de vaccins. Les nouvelles mutations identifiées et les perspectives structurelles peuvent aider les scientifiques à concevoir des vaccins efficaces qui exploitent la réponse immunitaire du corps contre les herpesvirus.
Étant donné la haute prévalence des infections causées par ces virus, développer des vaccins efficaces pourrait réduire considérablement les problèmes de santé. Cette recherche fournit un cadre pour de futurs travaux axés sur les vaccins contre les herpesvirus et pourrait conduire à des interventions de santé publique efficaces.
Conclusion
Le chemin pour comprendre les herpesvirus et leurs interactions avec les cellules humaines est complexe mais essentiel. Grâce à l'ingénierie avancée des protéines, à la biologie structurelle et aux efforts de recherche collaboratifs, des avancées significatives ont été réalisées dans la stabilisation de la glycoprotéine B des herpesvirus. Ces résultats améliorent non seulement notre compréhension de l'entrée virale mais ouvrent également la voie à l'élaboration de vaccins efficaces et d'interventions thérapeutiques contre ces pathogènes répandus. À mesure que les chercheurs continuent d'explorer la dynamique conformational des protéines de herpesvirus, le potentiel de nouvelles stratégies vaccinales grandit, promettant d'avoir un impact positif sur la santé publique.
Titre: Computational design of prefusion-stabilized Herpesvirus gB trimers
Résumé: In the absence of effective vaccines, human-infecting members of the Herpesvirus family cause considerable morbidity and mortality worldwide. Herpesvirus infection relies on receptor engagement by a gH/gL glycoprotein complex which induces large-scale conformational changes of the gB glycoprotein to mediate fusion of the viral and host membranes and infection. The instability of all herpesvirus gBs have hindered biochemical and functional studies, thereby limiting our understanding of the infection mechanisms of these pathogens and preventing vaccine design. Here, we computationally stabilized and structurally characterized the Epstein-Barr virus prefusion gB ectodomain trimer, providing an atomic-level description of this key therapeutic target. We show that this stabilization strategy is broadly applicable to other herpesvirus gB trimers and identified conformational intermediates supporting a previously unanticipated mechanism of gB-mediated fusion. These findings provide a blueprint to develop vaccine candidates for these pathogens with major public health burden.
Auteurs: David Veesler, M. McCallum
Dernière mise à jour: 2024-10-24 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.23.619923
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.23.619923.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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