La double nature des amyloïdes : des aides ou des freins ?
Les amyloïdes peuvent nuire mais aussi aider dans les processus de pigmentation.
Haruaki Yanagisawa, Harumi Arai, Hideyuki Miyazawa, Masahide Kikkawa, Toshiyuki Oda
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Table des matières
- La maturation des amyloïdes PMEL
- La mutation G175S et ses effets
- Découverte des structures des amyloïdes PMEL
- Techniques utilisées pour observer les amyloïdes PMEL
- Caractéristiques de deux formes polymorphiques
- Le rôle du domaine CAF
- Investigation de la polymérisation des amyloïdes PMEL
- La sécrétion d'amyloïdes par les cellules
- Investigation de la structure des mélanosomes
- L'impact sur la maturation des mélanosomes
- Implications pour le syndrome de dispersion pigmentaire (PDS)
- Comprendre la fonction des différents domaines PMEL
- Défis dans l'étude des amyloïdes PMEL
- Directions futures
- Dernières réflexions
- Source originale
- Liens de référence
Les Amyloïdes sont des collections de protéines qui peuvent s'accumuler dans le corps. Bien qu'on les considère souvent comme des fauteurs de troubles liés à des maladies comme Alzheimer, certains amyloïdes font en fait des choses bien. Ils jouent des rôles importants dans les fonctions corporelles normales, comme aider certaines cellules à créer des pigments de couleur.
Un exemple intéressant est une protéine appelée PMEL. Cette protéine est fabriquée dans certaines cellules de la peau qui produisent du pigment. PMEL peut former des fibres amyloïdes qui aident à organiser le dépôt de Mélanine, le pigment qui donne de la couleur à notre peau, nos cheveux et nos yeux. Donc, même si les amyloïdes ont une mauvaise réputation, ils peuvent aussi être des alliés dans le corps.
La maturation des amyloïdes PMEL
PMEL passe par une série d'étapes pendant sa maturation. Ce processus se déroule à l'intérieur de structures spécialisées dans les cellules appelées Mélanosomes. Ces mélanosomes ont quatre étapes : I, II, III et IV. À l'étape II, PMEL commence à former des structures fibreuses essentielles pour passer à l'étape III, où la mélanine commence à s'accumuler.
Malgré l'importance de ces fibres, la forme et la structure exactes des amyloïdes PMEL ont été difficiles à déterminer. Des parties de la protéine connues sous le nom de domaine formateur d'amyloïdes central (CAF) et le domaine répétitif (RPT) ont été liées à la formation d'amyloïdes, mais les manières spécifiques dont elles contribuent n'ont pas été complètement comprises.
Il y a aussi des preuves que des sucres attachés au domaine RPT pourraient modifier la structure des fibres amyloïdes.
La mutation G175S et ses effets
Dans certains cas, des changements (ou mutations) dans le gène PMEL peuvent causer des problèmes, comme le syndrome de dispersion pigmentaire (PDS). C'est quand des granules colorés sont libérés dans l'œil, ce qui peut causer des problèmes comme une pression accrue dans l'œil et même une perte de vision. Environ 15-20 % des personnes atteintes de PDS finissent avec une condition grave appelée glaucome pigmentaire.
Une mutation spécifique dans PMEL s'appelle Gly175Ser (ou G175S pour faire court). Ce changement pourrait perturber comment PMEL forme des amyloïdes. Cependant, les chercheurs essaient encore de comprendre exactement ce que cette mutation fait au niveau moléculaire.
Découverte des structures des amyloïdes PMEL
Récemment, les chercheurs ont réussi à examiner de près les amyloïdes PMEL, révélant deux formes différentes (ou polymorphes) présentes dans les amyloïdes PMEL normaux. Ils ont aussi constaté que la mutation G175S entraîne des changements structurels dans ces amyloïdes. Essentiellement, cette mutation provoque une précipitation de la production d'amyloïdes au sein des mélanosomes, éclairant ce qui ne va pas dans le PDS.
Techniques utilisées pour observer les amyloïdes PMEL
Pour étudier ces amyloïdes, les scientifiques les ont recueillis à partir d'un type cellulaire spécifique connu sous le nom de ligne cellulaire de mélanome humain HMV-II. Ils ont utilisé des méthodes d'imagerie avancées, comme la cryo-microscopie électronique (cryo-EM), pour visualiser les structures. Grâce à ce processus, ils ont découvert des fibres amyloïdes épaisses et fines, qui représentent différents types de structures fabriquées par PMEL.
Les chercheurs ont découvert que les fibres épaisses forment une structure plus organisée qui aide au dépôt de mélanine. Cependant, les fibres fines pourraient être moins stables et représenter une phase précoce de la formation des amyloïdes PMEL.
Caractéristiques de deux formes polymorphiques
L'analyse des amyloïdes PMEL a montré deux formes distinctes.
- Polymorphe 1 : Cette forme a une structure hélicoïdale à deux démarrages, ce qui signifie qu'elle se tord d'une manière unique qui renforce la solidité de l'amyloïde.
- Polymorphe 2 : Cette variation forme une hélice à un démarrage avec des différences notables dans sa structure. Un aspect intéressant du Polymorphe 2 est qu'il a une cavité centrale, tandis que le Polymorphe 1 n'en a pas. Cette cavité pourrait être importante pour les interactions avec la mélanine ou d'autres substances à l'intérieur du mélanosome.
Le rôle du domaine CAF
Des études supplémentaires se sont concentrées sur une partie spécifique de la protéine PMEL connue sous le nom de domaine CAF, qui est cruciale pour la formation des fibrilles amyloïdes. Fait intéressant, bien que les chercheurs aient pu reproduire les structures des amyloïdes PMEL en laboratoire, ils ont constaté que la mutation G175S provoquait des changements significatifs dans la manière dont ces structures se compactaient.
Dans les fibres G175S, le premier feuillet β était divisé en trois petites parties, affectant la forme globale et la stabilité de l'amyloïde. Il y avait aussi une liaison supplémentaire formée entre deux acides aminés dans la version G175S de la protéine, ce qui pourrait aider à maintenir la structure, malgré les changements qu'elle a introduits.
Investigation de la polymérisation des amyloïdes PMEL
Pour comprendre comment se forment les amyloïdes PMEL, les chercheurs ont mis en place des expériences pour tester le domaine CAF des PMEL normaux et G175S. Ils ont découvert que lorsque les protéines étaient mélangées dans un cadre de laboratoire, la variante G175S formait des fibrilles amyloïdes beaucoup plus rapidement que la version normale. Cela correspondait aux observations d'une production d'amyloïdes plus rapide à l'intérieur des cellules.
En outre, lors des tests en laboratoire, les fibres G175S se sont révélées non seulement plus épaisses mais aussi plus nombreuses.
La sécrétion d'amyloïdes par les cellules
Sur la base de leurs recherches, les scientifiques ont étudié combien d'amyloïdes étaient libérés par des cellules exprimant soit le PMEL normal, soit le PMEL G175S. Les cellules G175S ont libéré environ 70 % d'amyloïdes en plus que les cellules PMEL normales. Cela pourrait indiquer que les changements de structure causés par la mutation G175S entraînent une plus grande quantité d'amyloïdes s'échappant des cellules.
Fait intéressant, même avec tous ces changements, la structure globale des mélanosomes—où le PMEL est produit—est restée inchangée. C'est comme si la mutation G175S avait turbo-chargé l'usine mais n'avait pas changé l'usine elle-même.
Investigation de la structure des mélanosomes
Pour vérifier si la mutation G175S avait modifié l'apparence physique et l'arrangement des mélanosomes, les scientifiques ont utilisé des techniques d'imagerie avancées. Ils ont examiné les mélanosomes provenant de cellules exprimant soit PMEL normal soit G175S et n'ont trouvé aucune différence significative en termes de taille ou de structure globale.
Cela suggère qu'alors que la mutation G175S augmente la formation d'amyloïdes et entraîne une sécrétion accrue, elle ne perturbe pas la manière dont les mélanosomes sont construits. C'est comme si le four à pizza devenait plus chaud, mais que la pizza elle-même ne changeait pas de forme.
L'impact sur la maturation des mélanosomes
Les chercheurs ont également étudié si la mutation G175S influençait le développement des mélanosomes à travers leurs étapes. Ils ont mesuré combien de mélanosomes étaient dans différentes étapes de développement et ont découvert que la mutation G175S entraînait plus de mélanosomes atteignant l'étape III—où la mélanine commence à s'accumuler—tandis que l'étape II était moins courante.
En termes simples, la mutation G175S a accéléré le processus de maturation des mélanosomes et les a préparés à produire de la mélanine.
Implications pour le syndrome de dispersion pigmentaire (PDS)
Les résultats de cette recherche ont des implications importantes pour comprendre le PDS, qui implique la libération de granules pigmentaires. Les changements structurels et la formation d'amyloïdes plus rapides associés à la mutation G175S pourraient contribuer à la sécrétion excessive de granules de mélanine dans l'œil, entraînant des problèmes comme une pression accrue dans l'œil et un risque de glaucome.
En résumé, les résultats suggèrent que bien que les amyloïdes PMEL soient généralement utiles pour maintenir la pigmentation, la mutation G175S peut les transformer en fauteurs de troubles.
Comprendre la fonction des différents domaines PMEL
Bien que la plupart des recherches se soient concentrées sur le domaine CAF, il est important de se rappeler qu'une autre section de PMEL—le domaine RPT—joue aussi un rôle crucial. On sait que le domaine RPT est fortement modifié par des sucres, ce qui peut aider à stabiliser les parties qui contribuent au dépôt de mélanine.
Cependant, en raison des méthodes utilisées pour isoler les amyloïdes, les chercheurs n'ont pas pu déterminer dans quelle mesure le domaine RPT ajoutait à la structure des amyloïdes.
Défis dans l'étude des amyloïdes PMEL
Étudier les amyloïdes PMEL n'est pas sans ses luttes. Leur organisation enchevêtrée au sein des mélanosomes rend difficile l'isolement de fibres individuelles pour l'étude. La recherche a montré que les amyloïdes peuvent s'organiser en structures complexes, ce qui indique que les analyser dans leurs contextes naturels nécessitera des solutions créatives.
Directions futures
Cette recherche jette les bases pour en apprendre davantage sur PMEL et comment certaines mutations impactent sa fonction et sa structure. Les travaux futurs pourraient se concentrer sur l'examen d'autres mutations PMEL, explorer comment le domaine RPT contribue à la structure globale des amyloïdes, et élaborer des stratégies pour contrer les problèmes qui surviennent avec une formation accélérée d'amyloïdes dans le PDS.
Dernières réflexions
En conclusion, cette étude a apporté une nouvelle clarté sur les caractéristiques structurelles des amyloïdes PMEL et a souligné les impacts significatifs de la mutation G175S. Bien que les amyloïdes puissent être vus comme des vilains dans certaines maladies, cette recherche met en lumière leur rôle dans la pigmentation et souligne la relation complexe entre la structure des protéines, leur fonction et la maladie.
Et qui aurait cru que quelque chose d'aussi apparemment ennuyeux qu'une protéine puisse être lié à la fois à une pigmentation colorée et à des problèmes oculaires graves ? La science est vraiment pleine de surprises !
Source originale
Titre: Cryo-EM of PMEL Amyloids Reveals Pathogenic Mechanism of Pigment Dispersion Syndrome
Résumé: PMEL amyloids provide a vital scaffold for melanin deposition in melanosomes, playing a central role in pigmentation. Despite their importance, the high-resolution structure of PMEL amyloids has remained elusive. Here, we determined near-atomic resolution structures of wild-type PMEL amyloids using cryo-electron microscopy, revealing two distinct polymorphic forms with unique structural features. We further examined the pathogenic G175S mutation linked to pigment dispersion syndrome (PDS). Structural analysis showed that the G175S mutation introduces an additional hydrogen bond, stabilizing a novel fibril conformation. In vitro assays demonstrated a fourfold increase in polymerization efficiency for the G175S mutant compared to the wild-type. This enhanced polymerization correlated with a [~]70% increase in secreted amyloids in G175S-expressing cells without detectable changes in melanosome morphology or number. These findings suggest that the G175S mutation promotes amyloidogenesis within melanosomes, increasing amyloid load and contributing to PDS pathophysiology. This study provides insights into the molecular basis of PMEL amyloid formation in both physiological and pathological contexts, offering new perspectives on their structural diversity and dysregulation in pigmentation disorders.
Auteurs: Haruaki Yanagisawa, Harumi Arai, Hideyuki Miyazawa, Masahide Kikkawa, Toshiyuki Oda
Dernière mise à jour: 2024-12-12 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.09.627633
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.09.627633.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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