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# Biologie # Neurosciences

Une nouvelle approche pour étudier le cerveau humain

Des chercheurs utilisent des tissus humains pour étudier les maladies du cerveau de manière plus efficace.

JP McGinnis, Joshua Ortiz-Guzman, Sai Mallannagari, Maria Camila Guevara, Benjamin D. W. Belfort, Suyang Bao, Snigdha Srivastava, Maria Morkas, Emily Ji, Kalman A. Katlowitz, Angela Addison, Evelyne K. Tantry, Melissa M. Blessing, Carrie A. Mohila, Nisha Gadgil, Samuel G. McClugage III, David F. Bauer, William E. Whitehead, Guillermo Aldave, Omar Tanweer, Naser Jaleel, Ali Jalali, Akash J. Patel, Sameer A. Sheth, Howard L. Weiner, Shankar Gopinath, Ganesh Rao, Akdes Serin Harmanci, Daniel Curry, Benjamin R. Arenkiel

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Table des matières

Quand il s'agit d'étudier le cerveau humain, les chercheurs se heurtent souvent à un mur. La plupart du temps, ils doivent se fier à des modèles animaux pour apprendre sur les maladies du cerveau, mais ces études ne se traduisent pas toujours bien chez les humains. C'est un peu comme essayer d'apprendre à faire du vélo en regardant un hamster dans une roue : c'est mignon, mais ce n'est pas vraiment la même expérience. C'est pour ça qu'il y a une pression croissante pour utiliser des modèles basés sur l'humain afin de mieux comprendre comment fonctionne le cerveau, surtout pour les maladies neurologiques difficiles.

Un développement excitant dans ce domaine, c'est l'utilisation des Organoïdes Cérébraux. Pense à eux comme des cerveaux miniatures cultivés en laboratoire. Ils donnent aux scientifiques la chance d'étudier les cellules cérébrales humaines dans un cadre plus pertinent. Malheureusement, les versions actuelles de ces organoïdes ressemblent parfois plus au cerveau d'un embryon qu'à celui d'un adulte. Ça peut rendre difficile l'application de ce qu'ils apprennent aux conditions humaines réelles.

Voici le modèle de coupe organotypique du cerveau humain. Ce modèle permet aux chercheurs de garder de vrais morceaux de tissu cérébral humain en vie en dehors du corps (dans un labo, pas dans le repaire d'un scientifique fou). En faisant cela, ils peuvent étudier comment ces tissus réagissent à différents traitements ou interventions au fil du temps. Idéalement, ces tranches maintiendraient leurs caractéristiques originales, donc les chercheurs auraient une image plus précise de leur comportement chez une personne vivante.

Pourquoi du Tissu Humain ?

Utiliser du tissu cérébral humain, c'est un changement radical. En l'étudiant directement, les chercheurs peuvent mieux comprendre comment différents types de cellules dans le cerveau collaborent. C'est crucial pour des maladies comme les tumeurs, l'épilepsie, et d'autres troubles neurologiques. L'objectif ultime est d'améliorer les traitements et de rendre les essais cliniques plus prédictifs et pertinents.

Cependant, même si l'utilisation de tissu humain offre de nombreux avantages, ça vient aussi avec des défis. Tous les patients en chirurgie ne peuvent pas fournir d'échantillons de tissu, et les types de maladies étudiées sont limités à celles qui nécessitent une intervention chirurgicale. Pourtant, le potentiel pour de nouvelles découvertes en vaut la peine.

Le Processus d'Étude

Dans une étude récente, les chercheurs ont collecté des échantillons de tissu cérébral de patients subissant une chirurgie. Le processus était simple : obtenir le consentement du patient (ou de leurs soignants), puis collecter tout tissu cérébral qui n'était pas nécessaire pour le diagnostic. Les échantillons ont été rapidement refroidis et envoyés au labo pour un traitement ultérieur.

Une fois au labo, le tissu cérébral a été soigneusement découpé en tranches et placé dans des milieux de culture spécifiques. Ces tranches ont été traitées comme des invités VIP, recevant des soins quotidiens pour les garder en vie et en bonne santé.

Après deux semaines de culture, les chercheurs étaient prêts à analyser les échantillons en utilisant le séquençage RNA à noyau unique. Cette méthode leur a permis d'examiner les niveaux d'expression génique pour différents types de cellules au sein du tissu. Le but était de voir dans quelle mesure ces types cellulaires maintenaient leurs caractéristiques uniques au fil du temps. S'ils se comportaient de façon similaire à ce qu'ils feraient dans un vrai cerveau vivant, ça indiquerait que le modèle était effectivement efficace.

Un Coup d'Œil Sous le Capot

Alors, qu'est-ce que les chercheurs ont vraiment trouvé pendant leur analyse ? Ils ont examiné différents types de cellules, comme les Neurones, les Astrocytes (cellules de soutien) et les cellules tumorales, pour voir comment leurs Profils d'expression génique ont changé du jour zéro (juste après la chirurgie) au jour quatorze (après deux semaines en culture).

Résultats et Conclusions

Les résultats étaient prometteurs. La plupart des types cellulaires ont montré des corrélations relativement élevées entre leurs expressions au jour zéro et au jour quatorze. Cela signifie que les cellules ont maintenu leur identité pendant la période de deux semaines, faisant du modèle de coupe organotypique un bon candidat pour étudier les maladies cérébrales.

  1. Astrocytes : Ces cellules de soutien ont montré des résultats variables. Dans certains échantillons, elles ont bien maintenu leur identité, mais dans d'autres, moins.

  2. Cellules Endothéliales : Ces cellules, qui font partie des vaisseaux sanguins, ont très bien préservé leurs caractéristiques au fil du temps.

  3. Neurones : Les résultats étaient mitigés. Bien que certains types de neurones aient maintenu leurs profils correctement, d'autres ont montré un déclin notoire.

  4. Cellules Tumorales : Étonnamment, les cellules tumorales provenant d'échantillons de glioblastome et de médulloblastome ont exceptionnellement bien maintenu leurs profils d'expression génique. Cela suggère que le système de modélisation a du potentiel pour comprendre comment ces cancers agressifs se comportent.

En comparant les données du jour zéro et du jour quatorze, les chercheurs ont pu voir ce qui avait changé et ce qui était resté le même. C'est comme regarder une photo avant-après, sauf qu'au lieu d'une nouvelle coupe de cheveux, il s'agit de la manière dont les cellules cérébrales ont conservé leurs caractéristiques uniques au fil du temps.

Création d'une Base de Référence

Un des résultats clés de cette recherche était d'établir une base de référence sur le comportement des cellules cérébrales en dehors du corps. C'est crucial pour les futures études. Si les chercheurs peuvent comprendre combien de temps différents types de cellules peuvent conserver leurs identités, ils peuvent commencer à ajuster les conditions de culture pour améliorer la préservation. Plus les modèles sont fidèles à la biologie humaine réelle, plus ils seront utiles pour tester de nouvelles thérapies.

L'Importance de la Collaboration

L'accès au tissu cérébral humain reste un défi. Beaucoup de labos n'ont pas la capacité d'obtenir régulièrement de tels échantillons. C'est pourquoi la collaboration est cruciale. En travaillant ensemble, les chercheurs peuvent rassembler leurs ressources et leurs connaissances pour tirer parti de ce modèle précieux. Les neurochirurgiens, en particulier, sont dans une position unique pour diriger ces études, puisqu'ils sont souvent ceux qui réalisent les chirurgies.

Directions Futures

Alors que les chercheurs continuent d'explorer ce modèle, il y a plein de pistes à examiner. Par exemple, ils pourraient voir comment différents types de maladies cérébrales affectent la préservation cellulaire. Ce modèle pourrait-il aider les chercheurs à comprendre comment les gliomes de bas grade ou d'autres types de tumeurs spécifiques se comportent ? Ou comment cela pourrait-il s'appliquer aux malformations vasculaires ou à l'épilepsie ? Ces questions ne sont que le début.

Amélioration des Conditions de Culture

Les scientifiques sont optimistes que l'amélioration de la qualité des conditions de culture mènera à des résultats encore meilleurs. Certains chercheurs se concentrent sur l'utilisation du liquide céphalorachidien humain (LCR) comme milieu pour garder les tissus en vie plus longtemps. En intégrant un environnement plus naturel, ils espèrent améliorer les taux de survie cellulaire et maintenir une fidélité encore plus grande.

Conclusion

Le modèle de culture de coupures organotypiques du cerveau humain représente un pas en avant significatif dans la recherche sur le cerveau. En utilisant du tissu humain réel, les chercheurs peuvent étudier les complexités du cerveau humain d'une manière que les modèles animaux traditionnels ne peuvent tout simplement pas égaler.

Les données sont claires : le tissu cérébral peut maintenir ses profils d'expression génique ex vivo, ce qui pourrait signifier des résultats plus fiables pour les essais cliniques et de meilleures thérapies pour les patients. L'avenir semble prometteur pour ce domaine de recherche, et qui sait ? Peut-être qu'un jour, nous pourrons développer non seulement des traitements, mais de vraies solutions aux plus grands défis du cerveau.

Alors, même si les modèles animaux ont leur place, il est temps d'adopter cette approche centrée sur l'humain. Après tout, qui de mieux pour étudier le cerveau humain que... eh bien, des humains ?

Source originale

Titre: Cell type transcriptional identities are maintained in cultured ex vivo human brain tissue

Résumé: It is becoming more broadly accepted that human-based models are needed to better understand the complexities of the human nervous system and its diseases. The recently developed human brain organotypic culture model is one highly promising model that requires the involvement of neurosurgeons and neurosurgical patients. Studies have investigated the electrophysiological properties of neurons in such ex vivo human tissues, but the maintenance of other cell types within explanted brain remains largely unknown. Here, using single-nucleus RNA sequencing, we systematically evaluate the transcriptional identities of the various cell types found in six patient samples after fourteen days in culture (83,501 nuclei from day 0 samples and 45,738 nuclei from day 14 samples). We used two pediatric temporal lobectomy samples, an adult frontal cortex sample, two IDH wild-type glioblastoma samples, and one medulloblastoma sample. We found remarkably high correlations of day 14 transcriptional identities to day 0 tissue, especially in tumor cells (r = 0.90 to 0.93), though microglia (r = 0.86), oligodendrocytes (r = 0.80), pericytes (r = 0.77), endothelial cells (r = 0.78), and fibroblasts (r = 0.76) showed strong preservation of their transcriptional profiles as well. Astrocytes and excitatory neurons showed more moderate preservation (r = 0.66 and 0.47, respectively). Because the main difficulty with organotypic brain cultures is the acquisition of human tissue, which is readily available to neurosurgeons, this model is easily accessible to neurosurgeon-scientists and neurosurgeons affiliated with research laboratories. Broad uptake of this more representative model should prompt advances in our understanding of many uniquely human diseases, lead to more reliable clinical trial performance, and ultimately yield better therapies for our patients.

Auteurs: JP McGinnis, Joshua Ortiz-Guzman, Sai Mallannagari, Maria Camila Guevara, Benjamin D. W. Belfort, Suyang Bao, Snigdha Srivastava, Maria Morkas, Emily Ji, Kalman A. Katlowitz, Angela Addison, Evelyne K. Tantry, Melissa M. Blessing, Carrie A. Mohila, Nisha Gadgil, Samuel G. McClugage III, David F. Bauer, William E. Whitehead, Guillermo Aldave, Omar Tanweer, Naser Jaleel, Ali Jalali, Akash J. Patel, Sameer A. Sheth, Howard L. Weiner, Shankar Gopinath, Ganesh Rao, Akdes Serin Harmanci, Daniel Curry, Benjamin R. Arenkiel

Dernière mise à jour: 2024-12-20 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.19.629223

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.19.629223.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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