Simple Science

Ciencia de vanguardia explicada de forma sencilla

# Ciencias de la Salud# Pediatría

Nuevas perspectivas sobre la displasia broncopulmonar y la ferroptosis

La investigación revela genes clave que conectan la DBA y la ferroptosis en bebés prematuros.

― 7 minilectura


Vinculando los genes delVinculando los genes delBPD y la ferroptosis.los tratamientos para la BPD.Identificar genes clave podría mejorar
Tabla de contenidos

La Displasia broncopulmonar, o DBP, es una enfermedad pulmonar a largo plazo que afecta principalmente a bebés prematuros. Ocurre cuando los pulmones no están completamente desarrollados y se dañan, a menudo debido al uso de oxígeno o ventilación mecánica. Los bebés nacidos más temprano y los que tienen pesos al nacer más bajos tienen más probabilidades de desarrollar DBP. Desafortunadamente, muchos bebés con DBP no responden bien a los tratamientos actuales, lo que lleva a problemas pulmonares graves y duraderos como el enfisema, la hipertensión pulmonar y problemas de crecimiento y desarrollo.

Por qué es Importante la DBP

La DBP es más que un problema médico; también representa una carga emocional y financiera pesada para las familias. Los bebés con esta condición a menudo enfrentan desafíos de salud continuos que requieren atención extensa. Entender cómo se desarrolla la DBP podría ayudar a los médicos a encontrar mejores tratamientos, lo cual es crucial para mejorar la vida de los niños afectados.

¿Qué es la Ferroptosis?

La ferroptosis es un tipo de muerte celular recién descubierto que es diferente de otras formas como la apoptosis (muerte celular programada) y la necrosis (lesión celular). Este proceso ocurre cuando hay demasiado hierro y grasas dañadas en las células, lo que lleva a la producción de moléculas dañinas. Estas moléculas causan estrés en la célula, provocando su muerte. La ferroptosis está relacionada con varias enfermedades, incluyendo ciertos cánceres y problemas del corazón.

Estudios recientes han mostrado que la ferroptosis podría desempeñar un papel en las lesiones pulmonares relacionadas con niveles altos de oxígeno. Si podemos controlar la ferroptosis, podríamos desarrollar nuevos tratamientos para la DBP.

Enfoque de Investigación

En nuestra investigación, usamos técnicas informáticas avanzadas para encontrar genes relacionados con la ferroptosis que difieren entre niños sanos y aquellos con DBP. Al identificar estos genes, esperamos encontrar nuevas formas de diagnosticar y tratar la DBP.

Recolección de Datos

Recopilamos datos de una base de datos genética pública. Filtramos los datos para enfocarnos en estudios que involucren a la DBP y humanos. Después de reducirlo, terminamos con muestras de sangre de 294 niños: 112 sanos y 182 con DBP. También reunimos información sobre genes vinculados a la ferroptosis para guiar nuestra investigación.

Encontrando Genes Expresados de Forma Diferencial (DEGs)

Analizamos los datos genéticos recopilados para encontrar DEGs, que son genes que se expresan de manera diferente en niños con DBP en comparación con niños sanos. Establecimos criterios específicos para nuestro análisis, lo que nos ayudó a crear representaciones visuales de nuestros hallazgos.

Construyendo Redes Genéticas

Exploramos más la expresión genética a través de un método llamado Análisis de Redes de Co-Expresión Génica Ponderada (WGCNA). Esto nos ayudó a agrupar genes que trabajan juntos. Al analizar estos grupos, pudimos conectar ciertos genes con la DBP.

Identificando Genes Clave

Para encontrar genes clave asociados con la DBP, buscamos genes que aparecieran tanto en nuestro análisis de DEG como en la lista de genes relacionados con la ferroptosis. Terminamos con seis genes principales que parecen jugar papeles cruciales en la enfermedad.

Evaluando Funciones Biológicas

Luego, examinamos qué roles podrían tener nuestros genes clave en la DBP. Estudiamos las funciones biológicas en las que están involucrados estos genes. Esto incluyó observar cómo interactúan con otros procesos biológicos y vías que podrían afectar la enfermedad.

Interacción con el Sistema Inmunológico

Dado que el sistema inmunológico juega un papel importante en la DBP, evaluamos cómo nuestros genes clave se relacionan con diferentes tipos de células inmunes. Nuestro análisis mostró que ocurren cambios en los tipos de células inmunes en niños con DBP, y algunos de nuestros genes principales se correlacionaron con estos cambios.

Pruebas de Laboratorio

Para validar nuestros hallazgos, realizamos experimentos de laboratorio utilizando un tipo específico de célula pulmonar. Exponemos estas células a altos niveles de oxígeno para simular condiciones similares a la DBP y medimos la expresión de nuestros genes clave. Los resultados coincidieron con nuestros análisis previos.

El Rol de los Genes Clave

  1. ACSL1: Este gen es importante para el metabolismo de grasas y podría ayudar a reducir los niveles de grasas dañinas que contribuyen a la muerte celular. Nuestro estudio encontró niveles más bajos de ACSL1 en muestras de DBP, sugiriendo su papel en la enfermedad.

  2. GALNT14: Este gen está involucrado en la modificación de proteínas. Estudios sugieren que niveles más bajos de GALNT14 podrían promover la muerte celular, lo que también observamos en modelos de DBP.

  3. WIPI1: Este gen es importante para un proceso llamado autofagia, que ayuda a limpiar células dañadas. Niveles más bajos de WIPI1 en nuestras pruebas indican que podría estar vinculado a la muerte celular en la DBP.

  4. MAPK14: Este gen ayuda a regular la inflamación y las respuestas al estrés. Observar sus cambios durante nuestras pruebas sugiere que juega un papel complejo en la DBP.

  5. PROK2: Este gen está involucrado en el desarrollo de vasos sanguíneos y respuestas inmunológicas. Sus niveles afectan cómo el cuerpo responde al estrés, indicando un posible vínculo con la DBP.

  6. CREB5: Este gen ayuda a controlar varios procesos biológicos, incluido el metabolismo y las respuestas inmunológicas. Su regulación también puede influir en el desarrollo de la DBP.

Conectando la DBP con el Sistema Inmunológico

Además de estudiar genes individuales, examinamos el entorno inmunológico de los niños con DBP. Encontramos alteraciones en los tipos y cantidades de células inmunes presentes. Ciertas células inmunes aumentaron, mientras que otras disminuyeron. Este desequilibrio puede contribuir a los problemas pulmonares continuos que presentan estos bebés.

Conclusión: Mirando Hacia Adelante

Nuestra investigación destaca seis genes clave relacionados con la ferroptosis que podrían ser importantes para entender y tratar la DBP. Al explorar más sus roles e interacciones, esperamos descubrir nuevas vías y estrategias de tratamiento que podrían mejorar los resultados para los bebés con esta condición desafiante.

Consideraciones Adicionales

Si bien nuestros hallazgos son prometedores, hay limitaciones. Solo analizamos un conjunto de datos y nuestros experimentos se realizaron en entornos de laboratorio. Estudios futuros deberían incluir datos más diversos y considerar pruebas en escenarios del mundo real para asegurar que nuestros hallazgos se traduzcan efectivamente en la práctica clínica.

Resumen

La DBP es una enfermedad grave que afecta a muchos bebés prematuros, causando problemas de salud duraderos. Investigaciones recientes la han vinculado a la ferroptosis, una forma específica de muerte celular. Al identificar genes clave involucrados y explorar sus roles, esperamos descubrir mejores enfoques para tratar y manejar esta condición. Comprender estas conexiones profundiza nuestra visión sobre las complejidades de la DBP y abre el camino hacia nuevas intervenciones que pueden mejorar significativamente la calidad de vida de los bebés afectados y sus familias.

Fuente original

Título: Bioinformatics analyses and experimental validation of ferroptosis-related genes in bronchopulmonary dysplasia pathogenesis

Resumen: ObjectiveWe aimed to study the involvement of ferroptosis in the pathogenesis of bronchopulmonary dysplasia (BPD) by conducting bioinformatics analyses and identifying and validating the associated ferroptosis-related genes to explore new directions for treating BPD. MethodsThe dataset GSE32472 on BPD was downloaded from the public genome database. Using R language, differentially expressed genes (DEGs) between the BPD and normal group were screened. In the present study, we adopted weighted gene correlation network analysis (WGCNA) for identifying BPD-related gene modules and ferroptosis-related genes were extracted from FerrDb. Their results were intersected to obtain the hub genes. After that, to explore the hub gene-related signaling pathways, the hub genes were exposed to gene ontology enrichment analysis. With the purpose of verifying the mRNA expression of the hub genes, a single-gene gene set enrichment analysis and quantitative reverse transcription polymerase chain reaction were conducted. Immune cell infiltration in BPD was analyzed using the CIBERSORT inverse fold product algorithm. ResultsA total of 606 DEGs were screened. WGCNA provided the BPD-related gene module darkgreen4. The intersection of DEGs, intramodular genes, and ferroptosis-related genes revealed six ferroptosis-associated hub genes (ACSL1, GALNT14, WIPI1, MAPK14, PROK2, and CREB5). Receiver operating characteristic curve analysis demonstrated that the hub genes screened for BPD were of good diagnostic significance. According to the results of immune infiltration analysis, the proportions of a cluster of differentiation (CD)8, CD4 naive, and memory resting T cells and M2 macrophage were elevated in the normal group, and the proportions of M0 macrophage, resting mast cell, and neutrophils were increased in the BPD group. ConclusionsA total of six ferroptosis-associated hub genes in BPD were identified in this study, and they may be potential new therapeutic targets for BPD.

Autores: Shibing Xi, Y. Luo, Z. Zhang, T. Li

Última actualización: 2023-09-11 00:00:00

Idioma: English

Fuente URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.04.23295026

Fuente PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.09.04.23295026.full.pdf

Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.

Gracias a medrxiv por el uso de su interoperabilidad de acceso abierto.

Más de autores

Artículos similares