Nuevas ideas sobre la resistencia a los antibióticos en las bacterias de la TB
La investigación descubre mecanismos de tolerancia a antibióticos en las bacterias que causan tuberculosis.
Babak Javid, J. Wu, S. Chaudhuri, S. C. Feid, M. Pan, Q. Kawaji, G. Liu
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Tabla de contenidos
La tolerancia a los antibióticos es cuando las bacterias pueden sobrevivir incluso con la presencia de antibióticos. Algunas bacterias son más susceptibles a los antibióticos debido a su genética, pero aún así pueden resistir ser eliminadas por estos medicamentos. Esto es importante porque dificulta el tratamiento de infecciones.
Un grupo de bacterias que son conocidas por ser resistentes es Mycobacterium tuberculosis, que causa la tuberculosis (TB). Se ha descubierto una nueva forma de tolerancia a los antibióticos en estas bacterias, que involucra su reacción al antibiótico Rifampicina. Esta tolerancia se llama resistencia fenotípica específica a la ARN polimerasa (RSPR). A diferencia de algunas bacterias que entran en un estado parecido al sueño para evitar antibióticos, las bacterias con RSPR pueden seguir creciendo incluso cuando se exponen a altos niveles de rifampicina que normalmente las matarían.
Cómo Funciona RSPR
Los investigadores identificaron que dos procesos principales ayudan a Mycobacterium tuberculosis a desarrollar RSPR. Uno de estos procesos implica un error en cómo las bacterias construyen proteínas. Normalmente, las bacterias tienen un equipo específico para unir bloques de construcción a sus máquinas de hacer proteínas. Sin embargo, Mycobacterium tuberculosis no tiene ciertas proteínas necesarias para hacer esto correctamente. En vez de eso, usa un método alternativo que a veces provoca errores al añadir bloques de construcción, especialmente alrededor de la glutamina y la asparagina.
Cuando confunden uno por otro, puede llevar a una situación donde una parte crítica del objetivo para la rifampicina se cambia. Este pequeño cambio permite que las bacterias sobrevivan incluso cuando se utiliza el antibiótico.
Buscando Formas de Contraatacar
Dándose cuenta de esto, los investigadores creyeron que si podían encontrar formas de interferir con cómo Mycobacterium tuberculosis comete estos errores, podrían aumentar la efectividad de la rifampicina. Descubrieron un compuesto llamado kasugamicina que mostró promesas en reducir estos errores y mejorar los efectos de la rifampicina. Sin embargo, querían encontrar más compuestos que pudieran ayudar.
Para lograr esto, revisaron sistemáticamente una gran colección de compuestos sintéticos para ver si alguno podía disminuir los errores que comete Mycobacterium tuberculosis. Desarrollaron un sistema especial para rastrear qué tan bien funcionaban estos compuestos. El objetivo era encontrar compuestos que pudieran ayudar al antibiótico a luchar contra las bacterias de manera más efectiva sin causar más problemas.
La Búsqueda de Nuevos Compuestos
Durante el proceso de selección, los investigadores encontraron varios compuestos que parecían funcionar bien. Entre ellos había una serie de compuestos conocidos como benzo[d]isoxazole-4,7-diones. Los mejores de estos compuestos resultaron disminuir el proceso de mala adaptación y también mejorar la efectividad de la rifampicina contra Mycobacterium tuberculosis.
Los investigadores continuaron refinando los compuestos, buscando aquellos que pudieran funcionar incluso mejor sin ser dañinos por sí mismos. Crearon análogos de los compuestos originales y los probaron, resultando en algunos candidatos prometedores que eran más efectivos que los descubrimientos iniciales.
Determinando Cómo Funcionan los Compuestos
Con el candidato más prometedor identificado, el siguiente paso era averiguar exactamente cómo funcionaban estos compuestos. Los investigadores utilizaron una técnica que les permitió ver a qué proteínas se unían los compuestos dentro de las bacterias. El objetivo era clarificar qué partes de las bacterias eran afectadas por los compuestos.
A través de este proceso, encontraron que una proteína específica llamada S5 de la subunidad ribosómica 30S era un objetivo clave para su compuesto. Esta proteína juega un papel vital en ayudar a las bacterias a producir proteínas al interactuar con sus instrucciones genéticas. Al interferir con la función de S5, los compuestos podían llevar a menos errores en la construcción de proteínas, haciendo que las bacterias sean más susceptibles a los antibióticos.
Implicaciones para el Tratamiento
Estos descubrimientos tienen una promesa significativa para mejorar el tratamiento de la tuberculosis. El tratamiento estándar normalmente dura seis meses, pero con la introducción de nuevos compuestos que pueden aumentar el efecto de la rifampicina, los tiempos de tratamiento podrían potencialmente reducirse.
Esta línea de investigación es vital no solo para abordar la TB, sino también para entender cómo las bacterias resisten los tratamientos antibióticos en general. Al encontrar formas de reducir esta tolerancia, los profesionales médicos podrían desarrollar tratamientos más efectivos que ayuden a eliminar infecciones resistentes.
Direcciones Futuras
De cara al futuro, hay mucho por explorar. Entender exactamente cómo interactúan las proteínas ribosómicas con los antibióticos y cómo se puede manipular la traducción bacteriana es un aspecto crucial de la investigación futura. Este conocimiento puede llevar al desarrollo de nuevas estrategias para combatir las bacterias resistentes a los antibióticos.
Además, los métodos desarrollados para buscar e identificar compuestos pueden aplicarse a otras infecciones bacterianas, ampliando el impacto potencial de esta investigación. Al continuar investigando estas áreas, los investigadores pueden contribuir a la lucha contra la resistencia a los antibióticos, una creciente amenaza para la salud global.
Conclusión
La tolerancia a los antibióticos es un problema desafiante, especialmente con bacterias como Mycobacterium tuberculosis. Al descubrir nuevos mecanismos de resistencia e identificar compuestos que puedan contrarrestar estos procesos, hay esperanza para tratamientos mejorados. Esta investigación continua subraya la importancia de entender la biología bacteriana y el potencial de soluciones innovadoras en la lucha contra enfermedades infecciosas.
Reconocer cómo ciertas proteínas y procesos dentro de las bacterias pueden ser objetivo ofrece un camino para abordar uno de los problemas más apremiantes de la medicina moderna: la resistencia a los antibióticos. Cada paso adelante en este ámbito nos acerca a tratamientos más efectivos que podrían salvar vidas y mejorar los resultados de salud en todo el mundo.
Título: Medicinal chemistry of benzoisoxazole-4,7-dione analogues identifies the ribosomal small subunit as a target for specific mycobacterial translational fidelity
Resumen: Mycobacteria have high rates of error in the translation of glutamine and asparagine codons due to a two-step indirect tRNA aminoacylation pathway involving the essential amidotransferase GatCAB. This specific mycobacterial mistranslation is both necessary and sufficient for tolerance to the antibiotic rifampicin. Furthermore, we identified the natural product kasugamycin as a small molecule that could decrease this type of translational error, and potentiate rifampicin-mediated killing of mycobacteria, but whether other small molecules can decrease this specific type of mistranslation is unknown. We screened a library of synthetic small molecules using a pathway-specific whole-cell screen in a reporter strain of Mycobacterium smegmatis for their ability to decrease specific mycobacterial mistranslation. We synthesized 110 analogs of a parent hit compound and analyzed their bioactivity. To identify the cellular target of the compounds, we biotinylated active and inactive analogs and performed pull-down and mass-spectrometry of bound cellular proteins. We identified benzo[d]isoxazole-4,7-diones as a class of small molecules able to decrease mycobacterial mistranslation. Of the 110 analogs synthesized, we identified 10 with superior potency to the parent compound and analyzed the compounds to infer structure-activity relationships. Pull-down and mass spectrometry of bound cellular proteins identified RpS5 as a potential target of active compounds. Our study identified synthetic small molecules able to decrease mycobacterial mistranslation and confirmed that the small ribosomal subunit can be targeted to decrease mistranslation rates arising from physiologically mischarged tRNAs. Targeting mistranslation may be a potentially attractive means of targeting antibiotic-tolerant bacteria.
Autores: Babak Javid, J. Wu, S. Chaudhuri, S. C. Feid, M. Pan, Q. Kawaji, G. Liu
Última actualización: 2024-10-21 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.20.619312
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.20.619312.full.pdf
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