Bacterias al Rescate: Combatiendo el Olor a Escatole
Descubre cómo ciertas bacterias descomponen el skatole, reduciendo los olores desagradables en el ambiente.
S.J. Galaz, B. Saavedra, A. Zúñiga, F. González-Toro, R. Donoso
― 8 minilectura
Tabla de contenidos
- De Triptófano a Skatole
- El Olor de la Skatole
- Intentos de Eliminar la Skatole
- El Papel de Rhodococcus ruber R1
- La Búsqueda de la Anilina
- El Descubrimiento de Grupos de Genes
- ¿Cómo Funciona R. ruber R1?
- El Papel de los Genes Skt
- Un Poco de Competencia
- ¿Qué Viene Después para la Investigación de Rhodococcus?
- Conclusión
- Fuente original
La skatole, también conocida como 3-metilindol, es un compuesto famoso por su olor horrible. Si alguna vez has estado cerca de una granja o de un lugar que procesa desechos animales, probablemente lo has olfateado. Este compuesto es producido por organismos diminutos, específicamente microorganismos, durante la descomposición de una sustancia llamada triptófano, que forma parte de muchas proteínas. El triptófano se encuentra en alimentos como el pavo, el chocolate y los plátanos. Así que, la próxima vez que te comas un plátano, recuerda que una pequeña parte de eso podría llevar a la producción de skatole en algún lugar del mundo animal.
De Triptófano a Skatole
El viaje del triptófano a la skatole es todo un proceso. Comienza cuando el triptófano se altera mediante varias reacciones químicas que dan como resultado la formación de ácido indol-3-acético (IAA). Esta transformación ocurre en los intestinos de los mamíferos, gracias al arduo trabajo de los microorganismos. Después, entra en juego una enzima llamada descarboxilasa de indoleacetato, que separa el IAA, y finalmente produce skatole.
Estos pequeños microorganismos producen skatole no solo en los intestinos humanos, sino también en los intestinos de muchos animales. Por lo general, puedes encontrar altas cantidades de skatole en el estiércol de cerdos, granjas de ganado y otros entornos agrícolas. De hecho, los investigadores han detectado skatole en aguas residuales a concentraciones tan altas como 700 μg/L, ¡que es un buen montón de olor!
El Olor de la Skatole
Ahora hablemos del olor. El aroma de la skatole a menudo se compara con el de las heces. ¡Nadie quiere admitir que le gusta ese tipo de aroma! El umbral en el que los humanos pueden empezar a oler la skatole es de alrededor de 0.327 nanogramos por litro — eso es increíblemente bajo, ¡solo un pequeño indicio puede invadir tu nariz!
Mucha gente no lo sabe, pero demasiado skatole en el ambiente puede causar problemas de salud. Los animales pueden sufrir de condiciones como edema pulmonar bovino agudo cuando están expuestos a altos niveles de skatole. Incluso los humanos pueden experimentar problemas relacionados con la descomposición de alimentos en sus intestinos debido a un exceso de skatole.
Intentos de Eliminar la Skatole
Se han intentado varios métodos para deshacerse de los olores de skatole del ambiente. Se han investigado técnicas como el lavado químico, la adsorción o la biofiltración. Lamentablemente, hasta ahora ninguno de estos métodos ha tenido éxito sin causar más problemas ambientales. ¡Esto demuestra lo complicado que puede ser el skatole!
El Papel de Rhodococcus ruber R1
Una atención especial se centra en una cepa específica de bacterias llamada Rhodococcus ruber R1. Esta bacteria es particularmente interesante porque puede usar la skatole como su única fuente de alimento. Prosperan al descomponer la skatole, lo que podría ayudar a limpiar ambientes donde la skatole es un problema.
Estudios recientes se centraron en cómo R. ruber R1 descompone la skatole, descubriendo un grupo genético compuesto por catorce genes específicos que trabajan juntos en este proceso. Entre estos genes hay uno que ayuda a convertir la skatole en otro compuesto llamado anilina. De alguna manera, R. ruber R1 es como una mini planta de reciclaje, convirtiendo la maloliente skatole en algo menos apestoso.
La Búsqueda de la Anilina
La anilina es un producto intermedio formado a medida que R. ruber R1 digiere la skatole. En términos simples, piensa en la skatole como un bloque de Lego apestoso que se puede desarmar y reconstruir en algo más. Las bacterias convierten la skatole en anilina y luego siguen trabajando en eso, transformándola eventualmente en catecol.
¡El catecol es mucho menos apestoso que la skatole! Los investigadores se emocionaron al descubrir que R. ruber R1 también podía descomponer la anilina, mejorando su potencial para la biorremediación, que es un término elegante para limpiar el ambiente usando organismos vivos.
El Descubrimiento de Grupos de Genes
Los científicos descubrieron un grupo de genes llamado el grupo skt, que juega un papel significativo en la descomposición de la skatole. Este grupo incluye genes que ayudan a producir enzimas esenciales para el proceso de digestión. Algunos de estos genes ayudan a convertir la skatole en anilina, mientras que otros ayudan a convertir la anilina en catecol.
Cuando se observó la secuencia genética de R. ruber R1, los investigadores notaron que algunos de los genes estaban estrechamente relacionados con los que se encuentran en otras bacterias conocidas por descomponer compuestos similares. Esto sugiere que las bacterias podrían estar trabajando juntas en el gran mundo microbiano para enfrentar desafíos ambientales.
¿Cómo Funciona R. ruber R1?
Para entender cómo funciona R. ruber R1, los investigadores cultivaron esta bacteria en un ambiente de laboratorio con skatole como su única fuente de alimento. Monitorizaron el proceso de transformación, notando cómo los niveles de skatole disminuían a medida que las bacterias prosperaban y producían subproductos. Utilizando una técnica llamada cromatografía líquida de alta resolución (HPLC), los científicos midieron los productos de descomposición para confirmar la presencia de anilina.
Curiosamente, los científicos también descubrieron que cuando introducían anilina en el ambiente, las bacterias parecían emocionarse y trabajaban más duro para descomponerla. Esto mostró que la skatole funciona como un impulso motivacional para que R. ruber R1 aborde su siguiente objetivo, que es la anilina.
El Papel de los Genes Skt
Los genes skt responsables de descomponer la skatole fueron estudiados a fondo. Cuando se alimentó a R. ruber R1 con skatole, la expresión de estos genes se disparó. La presencia de skatole activó estos genes, mostrando una clara conexión entre la disponibilidad de alimento y la actividad genética en la bacteria.
Los investigadores investigaron más y revelaron que dos de los genes skt, SktA y SktB, son particularmente cruciales para descomponer la anilina. Trabajan juntos como una máquina bien engrasada, asegurando que el proceso de descomposición funcione sin problemas.
Un Poco de Competencia
R. ruber R1 no fue el único jugador en el juego. Otras bacterias, como algunas cepas de Pseudomonas y Acinetobacter, también se encontraron descomponiendo la skatole y compuestos relacionados. Esta competencia amistosa entre microorganismos muestra la forma en que la naturaleza aborda el desorden en diferentes entornos.
Los investigadores notaron que aunque R. ruber R1 es bueno descomponiendo la skatole, también juega un papel en la degradación de otros compuestos como la anilina y sus derivados. Esto podría hacer de R. ruber R1 un valioso aliado en la limpieza de entornos afectados por la skatole, ya sea de actividades agrícolas o de tratamiento de desechos.
¿Qué Viene Después para la Investigación de Rhodococcus?
Los hallazgos relacionados con R. ruber R1 y sus capacidades de degradación de skatole tienen un gran potencial para resolver algunos de los problemas de contaminación vinculados a la ganadería y la gestión de desechos. El uso de cepas bacterianas para esfuerzos de biorremediación es un campo en crecimiento, mostrando que la naturaleza tiene sus propias formas de lidiar con los desordenes creados por el hombre.
Al identificar los genes exactos involucrados en la descomposición de skatole y anilina, los científicos ahora pueden obtener información sobre cómo aprovechar estas bacterias eficazmente para estrategias de limpieza ambiental. Ya sea mejorando el crecimiento de estos microorganismos beneficiosos en áreas afectadas o ingenierándolos para descomponer contaminantes de manera más efectiva, el futuro parece prometedor.
Conclusión
En resumen, la skatole es un compuesto maloliente que representa un desafío ambiental significativo, especialmente en contextos relacionados con el ganado. Sin embargo, la naturaleza tiene un arma secreta: las bacterias como R. ruber R1 que pueden descomponer esta molestia apestosa. Estas bacterias no solo degradan la skatole, sino que también allanan el camino para la descomposición de compuestos intermedios como la anilina.
La investigación continua sobre la maquinaria genética detrás de estos procesos es crucial para desarrollar soluciones ecológicas para la gestión de la contaminación. Al comprender y utilizar estos procesos microbianos, ¡podríamos lograr mantener nuestros entornos un poco más limpios y menos apestosos!
¡Imagina un mundo donde los olores de skatole sean cosa del pasado! Eso sería un gran logro aromático, ¿no?
Título: Aniline Dioxygenase in Rhodococcus ruber R1: Insights into Skatole Degradation
Resumen: Skatole is an aromatic heterocyclic compound with a strong offensive odor, produced by microorganisms during the anaerobic breakdown of tryptophan. Skatole accumulation is linked to environmental and health issues. Despite its persistence and harmful effects, skatoles biodegradation by microorganisms is poorly understood. We have recently isolated a gram-positive bacterium, Rhodococcus ruber R1, which uses skatole as its sole carbon and energy source. Here we report an operon consisting of 14 genes encoding aromatic oxygenase systems involved in skatole degradation in Rhodococcus ruber R1. Cells growing on skatole accumulate aniline transiently, indicating its role as an intermediate in the degradation pathway. We characterize six genes in this cluster that encode for an aniline dioxygenase, which converts aniline to catechol and is only activated in the presence of skatole. This gene cluster was successfully introduced into a heterologous strain enabling the full degradation of aniline and its derivatives. Phylogenetic analysis of aniline dioxygenase present in R1 strain reveals a widespread distribution of this system among bacteria, in contrast to the full skatole cluster, which is restricted to a few genera. These findings advance our understanding of the skatole degradation pathway and highlight R1s potential for bioremediation of skatole, aniline, and related contaminants.
Autores: S.J. Galaz, B. Saavedra, A. Zúñiga, F. González-Toro, R. Donoso
Última actualización: 2024-12-29 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.29.630347
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.29.630347.full.pdf
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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