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# Biologia# Neurociência

Mudanças na Expressão Gênica em Processos de Memória

Este estudo investiga como a expressão gênica no hipocampo afeta a retenção da memória.

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A memória é um processo complexo que envolve diferentes partes do cérebro trabalhando juntas. Uma área chave envolvida na formação e recuperação da memória é o Hipocampo. Dentro dessa região, várias redes de neurônios interagem para apoiar as memórias. Essas redes são moldadas por experiências e podem mudar com base no que aprendemos. Estudos recentes destacaram a importância de genes específicos na formação da memória, mas ainda há muito a se descobrir sobre como esses genes trabalham juntos no cérebro.

Memória e o Hipocampo

O hipocampo é fundamental para codificar e recordar memórias, especialmente aquelas que envolvem navegação espacial. Isso significa que, quando aprendemos a navegar em um espaço físico, o hipocampo processa as informações e nos ajuda a lembrar disso para usar no futuro. Diferentes partes do hipocampo, como o Giro Dentado e as regiões CA, têm papéis únicos em lidar com tarefas de memória.

Atividade Neuronal e Memória

Quando formamos uma memória, um grupo específico de neurônios no hipocampo se torna ativo. Esses neurônios, conhecidos como conjuntos neuronais, são pensados como portadores das informações necessárias para aquela memória. A atividade desses neurônios é influenciada pelas conexões que têm entre si, que podem mudar com base em nossas experiências. Essa adaptabilidade é conhecida como plasticidade sináptica. Alterações na Expressão Gênica, ou a maneira como os genes são ativados ou desativados, desempenham um papel importante em como essas conexões são feitas e fortalecidas.

Objetivos da Pesquisa

Esse estudo tem como objetivo entender como os conjuntos neuronais associados à memória no hipocampo mudam após o aprendizado. Ao observar a expressão gênica em diferentes partes do hipocampo, a pesquisa espera esclarecer os mecanismos subjacentes que suportam a memória. Isso inclui examinar como vários genes são expressos em resposta a tarefas de memória e como essa expressão varia nas diferentes partes do hipocampo.

Métodos

Para explorar essas questões, foi usada uma combinação de técnicas, incluindo sequenciamento de RNA em massa e Transcriptômica Espacial. Esses métodos permitem que os pesquisadores analisem a atividade gênica em detalhes e vejam como muda dependendo se um animal foi treinado em uma tarefa de memória.

Desenho Experimental

Neste estudo, camundongos adultos foram treinados em uma tarefa de memória específica chamada evitação do lugar ativo. Durante essa tarefa, os camundongos aprenderam a evitar uma área específica onde receberiam um choque leve. O processo de aprendizado envolveu diferentes tentativas, após as quais sua memória foi testada. Depois disso, os pesquisadores coletaram amostras de tecido cerebral dos camundongos para analisar a expressão gênica.

Sequenciamento de RNA em Massa

Os pesquisadores usaram sequenciamento de RNA em massa para olhar a expressão gênica em diferentes partes do hipocampo após a tarefa de memória. Esse método permite uma visão ampla de quantos genes estão ativados ou desativados em resposta ao Treinamento. Eles se concentraram em três regiões principais: o Giro Dentado, CA3 e CA1. Comparando camundongos treinados e não treinados, os pesquisadores identificaram mudanças significativas na expressão gênica.

Transcriptômica Espacial

Para obter uma compreensão mais detalhada, foi utilizada a transcriptômica espacial. Essa técnica ajuda a identificar onde genes específicos estão ativos dentro do hipocampo. Ao mapear a expressão de genes em seções de tecido, os pesquisadores puderam ver quais partes do hipocampo estavam envolvidas em processos relacionados à memória.

Desempenho de Memória em Camundongos

Ao olhar como os camundongos se saíram na tarefa de memória, os camundongos treinados mostraram uma redução no número de choques recebidos e tempos mais longos antes de reingressar na zona de choque durante os testes. Isso indica que eles foram capazes de aprender e lembrar de evitar essa parte da arena.

Efeitos do Treinamento na Expressão Gênica

Após o treinamento, os pesquisadores encontraram vários genes que eram expressos de maneira diferente no hipocampo de camundongos treinados em comparação com os não treinados. Essa diferença na expressão gênica sugere que o treinamento tem um impacto significativo nos processos moleculares envolvidos na memória.

Descobertas Chave sobre a Expressão Gênica

O estudo identificou milhares de genes diferencialmente expressos em várias regiões do hipocampo. Muitos desses genes estavam associados à sinalização de neurotransmissores, que é crucial para a comunicação entre neurônios.

  1. Análise de Expressão Gênica Diferencial A análise mostrou que genes específicos relacionados à função sináptica estavam enriquecidos em camundongos treinados, especialmente nas regiões CA1 e CA3. Isso sugere que essas áreas estão particularmente envolvidas no processamento da memória.

  2. Sobreposição de Genes Uma sobreposição significativa na expressão gênica foi encontrada entre as regiões CA1 e CA3, indicando que essas áreas podem trabalhar juntas durante tarefas de memória.

  3. Funções Distintas das Regiões Enquanto isso, o Giro Dentado apresentou padrões de expressão gênica diferentes, insinuando que ele desempenha um papel único na formação da memória, potencialmente relacionado à criação de novos neurônios e apoiando a neurogênese.

Distribuição Espacial da Expressão Gênica

A transcriptômica espacial revelou padrões distintos de expressão gênica em todo o hipocampo. A análise mostrou que áreas envolvidas na função da memória não apenas mudaram seus níveis de expressão gênica, mas também exibiram perfis únicos dependendo se os camundongos foram treinados ou não.

Agrupamento da Expressão Gênica

Os dados espaciais destacaram clusters de expressão gênica correspondendo ao layout anatômico do hipocampo. Esses clusters fornecem insights sobre como diferentes populações de neurônios podem interagir e contribuir para a memória.

  1. Clusters em Camundongos Treinados Em camundongos treinados, vários clusters foram identificados que correspondiam a genes associados à produção de energia e plasticidade sináptica.

  2. Clusters em Camundongos Não Treinados Em contraste, camundongos não treinados mostraram uma distribuição diferente da expressão gênica, enfatizando como o treinamento afeta não apenas quais genes são ativados, mas também onde no cérebro esses genes são expressos.

Genes Imediatos (IEGs) na Memória

Os genes imediatos (IEGs) desempenham um papel crucial na formação de memórias. Eles são rapidamente expressos em resposta à atividade neuronal e servem como marcadores para neurônios ativados. Neste estudo, IEGs como Arc, Egr1 e c-Jun foram analisados para entender seus papéis específicos na memória.

Padrões de Expressão dos IEGs

O estudo descobriu que os IEGs foram expressos de maneira mais robusta em camundongos treinados em comparação com os não treinados. As regiões que expressavam esses genes não eram uniformes, indicando que diferentes IEGs podem estar envolvidos em diferentes aspectos do processamento da memória.

  1. Neurônios que Expressam Arc O gene Arc, conhecido por seu papel na plasticidade sináptica, foi mapeado na transcriptômica espacial. Foi encontrado que neurônios que expressam Arc em camundongos treinados estavam enriquecidos com genes associados à memória e aprendizado, sugerindo seu papel central na formação da memória.

  2. Expressão de Egr1 e c-Jun Egr1 e c-Jun, dois outros IEGs, também foram estudados quanto a seus níveis de expressão e associação com tarefas de memória. Egr1 foi ligado à organização e plasticidade sináptica, enquanto c-Jun foi associado à resposta ao estresse e ao desenvolvimento neuronal.

Validação das Descobertas

Para validar os dados de expressão gênica, análises de RT-qPCR direcionadas foram realizadas. Os resultados mostraram uma importante upregulação em certos genes nas regiões DG, CA3 e CA1, confirmando a expressão diferencial encontrada nos dados de sequenciamento de RNA.

Discussão

Os dados coletivos deste estudo enfatizam a relação intrincada entre a recuperação da memória e as mudanças na expressão gênica no hipocampo. Diferentes regiões do hipocampo respondem de maneira única ao treinamento, como evidenciado pelos perfis de atividade gênica observados.

Funções Regionais na Memória

As descobertas apoiam a ideia de que o hipocampo não é uma estrutura uniforme; na verdade, consiste em regiões que têm funções especializadas nos processos de memória. As regiões CA1 e CA3 estão intimamente ligadas em suas funções, sugerindo um esforço colaborativo durante tarefas de memória, enquanto o Giro Dentado parece ser fundamental para gerar novos neurônios e apoiar a formação da memória.

Implicações para Pesquisas Futuras

Essa pesquisa abre caminhos para novos estudos explorando como essas mudanças moleculares podem impactar a memória em vários contextos, incluindo estresse, envelhecimento e distúrbios neurológicos. Compreender os fundamentos moleculares da memória pode eventualmente levar a melhores intervenções para doenças relacionadas à memória.

Conclusão

Em resumo, este estudo destaca a natureza dinâmica da expressão gênica no hipocampo durante a recuperação da memória. Ao empregar técnicas inovadoras como sequenciamento de RNA em massa e transcriptômica espacial, a pesquisa fornece insights valiosos sobre os processos moleculares que estão por trás da formação e recuperação da memória, preparando o terreno para futuras explorações na neurociência cognitiva.

Fonte original

Título: Spatially Resolved Transcriptomic Signatures of Hippocampal Subregions and Arc-Expressing Ensembles in Active Place Avoidance Memory

Resumo: The rodent hippocampus is a spatially organized neuronal network that supports the formation of spatial and episodic memories. We conducted bulk RNA sequencing and spatial transcriptomics experiments to measure gene expression changes in the dorsal hippocampus following the recall of active place avoidance (APA) memory. Through bulk RNA sequencing, we examined the gene expression changes following memory recall across the functionally distinct subregions of the dorsal hippocampus. We found that recall induced differentially expressed genes (DEGs) in the CA1 and CA3 hippocampal subregions were enriched with genes involved in synaptic transmission and synaptic plasticity, while DEGs in the dentate gyrus (DG) were enriched with genes involved in energy balance and ribosomal function. Through spatial transcriptomics, we examined gene expression changes following memory recall across an array of spots encompassing putative memory-associated neuronal ensembles marked by the expression of the IEGs Arc, Egr1, and c-Jun. Within samples from both trained and untrained mice, the subpopulations of spatial transcriptomic spots marked by these IEGs were transcriptomically and spatially distinct from one another. DEGs detected between Arc+ and Arc-spots exclusively in the trained mouse were enriched in several memory-related gene ontology terms, including "regulation of synaptic plasticity" and "memory." Our results suggest that APA memory recall is supported by regionalized transcriptomic profiles separating the CA1 and CA3 from the DG, transcriptionally and spatially distinct IEG expressing spatial transcriptomic spots, and biological processes related to synaptic plasticity as a defining the difference between Arc+ and Arc-spatial transcriptomic spots.

Autores: Juan Marcos Alarcon, I. P. Vingan, S. Phatarpekar, V. S. K. Tung, A. I. Hernandez, O. V. Evgrafov

Última atualização: 2024-02-16 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.30.573225

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.30.573225.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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