ミトコンドリアストレス応答:重要な経路が明らかにされた
研究がストレス下におけるISRのミトコンドリア健康への役割を探る。
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ミトコンドリアは私たちの細胞の中にある小さな構造で、エネルギーの生産や脂肪の管理、細胞死の信号の制御に重要な役割を果たしてるんだ。これらのタスクを効率的に行うために、ミトコンドリアはそのタンパク質のバランスを保つ必要がある。これをミトコンドリアプロテオスタシスって呼ぶんだけど、これはミトコンドリアにある多くのタンパク質を輸入、折りたたみ、分解する役割を持ついろんなタンパク質によって維持されてるんだ。もし遺伝子の変化や環境要因、加齢によってバランスが崩れると、ミトコンドリアに問題が起きちゃう。この機能不全は、がんや代謝障害、神経系に影響を与える病気など、いろんな病気と関連してる。だから、ストレスに対してミトコンドリアプロテオスタシスがどう管理されてるのかを理解するのがめっちゃ大事なんだ。
ストレス信号とミトコンドリアプロテオスタシス
細胞がストレスを受けると、ミトコンドリアプロテオスタシスを管理するためにいくつかのシグナル経路が活性化されることがある。その中の一つがミトコンドリア未折りたたみタンパク質応答(UPRmt)っていうやつで、これが注目を集めてる。最初はC. elegansっていう小さなワームで発見されたけど、哺乳類の細胞にも存在してるよ。この細胞では、UPRmtが統合ストレス応答(ISR)と呼ばれるもっと広いストレス応答ネットワークと相互作用するんだ。ISRには、感染、アミノ酸不足、タンパク質の生産や処理に関与する細胞構造である小胞体の問題など、いろんなストレスに反応する4つの重要なタンパク質が含まれてる。
これらのストレス応答タンパク質が活性化されると、新しいタンパク質の生産が一時的に停止されながら、ATF4みたいな特定の転写因子も活性化されて、細胞のストレスを管理する手助けをするんだ。
ISRのミトコンドリアプロテオスタシスにおける役割
ISRはミトコンドリアプロテオスタシスの調整に重要な役割を果たしてる。ISRシグナルが活性化されると、ミトコンドリアの健康を保つための複数のタンパク質が生産されるんだ。たとえば、HSP70シャペロンのHSPA9や、品質管理タンパク質のLONが活性化される。さらに、ISRはタンパク質がミトコンドリアに取り込まれる方法にも関与していて、エネルギー生産や脂肪管理、ミトコンドリアの形状も調整してる。これにより、ミトコンドリアがストレスに応じて反応するのを助けるISRの重要性が強調されるんだ。
ミトコンドリアストレスによるISR活性化のメカニズム
最近の研究で、ミトコンドリアストレスがISRを活性化するプロセスが特定された。ミトコンドリアがストレスを受けると、DELE1っていうタンパク質が細胞質に蓄積する。DELE1はクラスターを形成することができて、ISRタンパク質のHRIに結合して、ISRシグナルの活性化に繋がる連鎖反応を開始するんだ。他のISRタンパク質もミトコンドリアストレスによって活性化されることができるから、ストレスの多い状況でミトコンドリアの健康を管理する上でのISRの中心的な役割が強調される。
ミトコンドリアストレスによって影響を受ける他の経路
ISRが重要だけど、ミトコンドリアに問題がある時には他のストレス応答経路も活性化されることがある。そんな経路の一つが熱ショック応答(HSR)で、HSP60のようなミトコンドリアシャペロンの生産に影響を与えるんだ。ミトコンドリアのタンパク質取り込みが減少する時に活性化される転写因子HSF1は、ミトコンドリアがストレスに適応するために必要不可欠ってことが示されてる。加えて、ミトコンドリア機能の乱れは酸化ストレスを管理するのに関与するNRF2っていう別のタンパク質も活性化する可能性がある。
ストレス経路の活性化を調査する
遺伝子の変化がミトコンドリアプロテオスタシスにどのように影響するかを探るために、遺伝子セットプロファイリングアプローチが使用された。この方法は、特定の遺伝子がどのように表現を変えるかを調べるもので、ISRやHSR、酸化ストレス応答の経路に関連するストレス応答遺伝子に焦点を当てて、研究で使われるK562細胞にて実施された。
プロファイリングアプローチでは、ミトコンドリアの健康に関連する特定の遺伝子がターゲットとして破壊されると、ISRだけが顕著に活性化されることが示された。この発見は様々な実験でも確認されて、ミトコンドリアの乱れの後に活性化される主要な経路としてISRが特定された。他の経路は同様の反応を示さなかったよ。
プロテオスタシス機能障害のメカニズム
詳しく言うと、ミトコンドリア内のタンパク質が遺伝子欠失の対象になると、ISRターゲット遺伝子の表現が明らかに増加した。観察によると、遺伝子削除の効率が変わる場合でも、HSPA9やHSPE1のようなミトコンドリアプロテオスタシス因子の喪失に応じてISRが一貫して活性化されることがわかった。
遺伝子発現の変化の比較分析によって、異なるミトコンドリアプロテオスタシス因子がISRに与える影響に類似点があることが示されて、共通の応答メカニズムが示唆された。さらに探求した結果、これらの攪乱が似たようなストレス応答に関与する遺伝子の表現の変化を引き起こすことがわかった。
ミトコンドリアタンパク質の遺伝子欠失
研究者たちは、さまざまなミトコンドリアタンパク質を含めて分析を拡張した。数多くのミトコンドリアタンパク質が欠失したK562細胞の広範な調査によって、ISRが主要な経路として活性化され続けることが確認された。他のストレス応答経路は、この場合には顕著に活性化されなかった。
面白いことに、以前はストレス経路に結びついていなかった遺伝子もISRを活性化することがわかった。これは、ミトコンドリアの健康の乱れがより広い反応を引き起こし、ISRが重要な役割を果たす可能性を示してるんだ。
結論
ミトコンドリアプロテオスタシスの研究は、細胞のストレスに対してISRが重要なシグナル経路であることを浮き彫りにしてる。ミトコンドリアの健康の乱れに対する細胞の反応に注目することで、ISRがミトコンドリアの機能と全体的な細胞の健康を維持するために重要であることがより明確になる。これに関するさらなる研究は、ミトコンドリア機能不全に関連するさまざまな病気を理解し、可能性として治療するための新しい戦略を見つける手助けになるかもしれない。ISRに関する得られた知見を活かすことで、さまざまな健康状態のミトコンドリアの問題をターゲットにする新しい戦略の可能性があるんだ。
タイトル: Mapping Stress-Responsive Signaling Pathways Induced by Mitochondrial Proteostasis Perturbations
概要: Imbalances in mitochondrial proteostasis are associated with pathologic mitochondrial dysfunction implicated in etiologically-diverse diseases. This has led to considerable interest in defining the biological mechanisms responsible for regulating mitochondria in response to mitochondrial stress. Numerous stress responsive signaling pathways have been suggested to regulate mitochondria in response to proteotoxic stress, including the integrated stress response (ISR), the heat shock response (HSR), and the oxidative stress response (OSR). Here, we define the specific stress signaling pathways activated in response to mitochondrial proteostasis stress by monitoring the expression of sets of genes regulated downstream of each of these signaling pathways in published Perturb-seq datasets from K562 cells CRISPRi-depleted of individual mitochondrial proteostasis factors. Interestingly, we find that the ISR is preferentially activated in response to mitochondrial proteostasis stress, with no other pathway showing significant activation. Further expanding this study, we show that broad depletion of mitochondria-localized proteins similarly shows preferential activation of the ISR relative to other stress-responsive signaling pathways. These results both establish our gene set profiling approach as a viable strategy to probe stress responsive signaling pathways induced by perturbations to specific organelles and identify the ISR as the predominant stress-responsive signaling pathway activated in response to mitochondrial proteostasis disruption.
著者: Luke Wiseman, Z. Khattar, N. Madrazo, E. Powers, J. D. Rosarda
最終更新: 2024-02-01 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.30.577830
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.30.577830.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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