ウガンダでの新興ウイルス感染症：増え続ける懸念

東アフリカは多くの植物や動物がいるけど、動物から人間にうつるウイルスもたくさんあるんだ。ウガンダでは、エボラやマールブルグみたいなウイルスがここ10年で深刻なアウトブレイクを引き起こしたことが何度もあった。他にも黄熱病やリフトバレー熱も見られてるし、蚊などの昆虫を通じて広がるウイルスもたくさんある。中にはウガンダで初めて確認されたウイルスもあるんだ。

人々の旅行やビジネスの発展が進むにつれて、これらのウイルスが広がるリスクも高まってる。多くの感染は診断されないままで、テストが足りないから危険なウイルスが広がる可能性がある。時にはこれらの感染がマラリアや他の細菌感染だと思われてしまうこともあって、それが抗生物質耐性の細菌の増加につながることもある。この研究は、熱を伴う未診断のウイルス感染について調べてる。

#急性熱性疾患（AFI）って何？

急性熱性疾患、つまりAFIは、サブサハラアフリカの病院に人が訪れる一般的な理由だけど、マラリアのケースは健康キャンペーンのおかげで減ってるんだ。実際、感染症はこの地域での生産性の損失につながることがある。研究によると、ウイルス感染がAFIのケースの大部分を占める可能性があるけど、これまでの研究では既知のウイルスしか見ていなかったから見逃されてたかもしれない。

ウイルスの広がりを防ぐためには、その影響をもっと理解する必要がある。科学者がサンプル中のウイルスを特定するのに役立つツールが、メタゲノミクス次世代シーケンシング（mNGS）っていうもので、事前にウイルスについての知識がなくても、幅広いウイルスを検出できる。今回の研究では、標準的なテストで原因が見つからなかったウガンダのAFI患者に対してmNGSを使ったんだ。

#研究参加者

この研究では、ウガンダの3つの医療センターから1,200人以上の患者が含まれた。患者たちは研究に参加することに同意し、研究チームだけが知ってるユニークな識別番号が与えられた。2歳以上で、2～7日間の熱があるか、他の病気に似た症状がある患者が選ばれた。明らかに診断がついている人は除外された。初めて医者にかかったときに血液サンプルを取り、2～3週間後に再度採取した。マラリアやチフスなどの他の一般的な病気を除外するためにさまざまなテストが行われた。最終的に210人の患者は診断がつかず、彼らの血液はmNGSを使って再テストされた。

#研究の成果

(a) 患者がリクルートされた研究場所と彼らが持つウイルスが記録された。(b) 様々な種類のウイルスは、 zoonoses、肝炎ウイルス、呼吸器ウイルスなどのカテゴリに分けられた。

#倫理的承認

研究の開始前に、ウガンダウイルス研究所とウガンダ国立科学技術評議会から倫理的承認を受けた。

#サンプルの分析方法

分析のために、研究者たちは血液サンプルからRNAを抽出し、DNAに変換した。DNAライブラリを作成し、先進的な機器を使ってこれらのサンプルをシーケンスした。そして、シーケンスデータを分析してウイルスの遺伝物質を探した。

#ウイルス検査の結果

診断されなかった患者の中で、15％がウイルス感染の兆候を示した。年齢データは大半が子供だった。多くの患者は、病気になる前に蚊や他の昆虫に刺されていた。出血症状を報告した人もいたけど、出血を引き起こすウイルスは確認されなかった。

#検出されたウイルス

ウイルス感染が確認された35人の患者から、いくつかの異なるタイプのウイルスが特定された。クリミア・コンゴ出血熱や黄熱病のような出血熱を引き起こすウイルスも含まれてる。呼吸器ウイルス、肝臓に問題を引き起こすウイルスも見つかったし、免疫不全の感染も一部の患者で検出された。

#特定のケース

一例では、クリミア・コンゴ出血熱に感染した患者がいた。この患者は軽い症状で特別な治療なしに回復した。他のケースでは、疑わしいアウトブレイクの際に黄熱病やデング熱が確認され、さらなるテストで確認された。

もう一つ注目すべき発見は、ウガンダで報告されていなかった子供からレ・ダンテックウイルス（LDV）が検出されたこと。このウイルスが実際に存在していて、活発な脅威を示唆するかもしれないことが確認された。

#胃腸および呼吸器感染

重度のウイルス感染に加えて、胃腸や呼吸器の疾患を引き起こす一般的なウイルスも患者から検出された。多くのウイルスが見つかったことは、ウガンダでの感染症の重大な負担を示しているかもしれない。

#ワクチンの重要性

この研究は、ウガンダでのワクチン接種の改善が必要だってことを強調してる。ワクチンで予防できる病気がまだ一般的に見られる。ウガンダには麻疹や肝炎に対するワクチンプログラムがあるけど、十分にワクチン接種されてないから、アウトブレイクのリスクが高まってる。

#診断の課題

この研究は大きな問題を指摘してる：多くのウイルス病はマラリアのような一般的な病気と似た症状を示すことがある。これが誤診や不適切な治療につながることがあり、ウイルス感染に抗生物質が使われることがあって、抗生物質耐性のリスクを高める。

AFIケースの複雑さにもかかわらず、ウイルスの原因をもっと認識することが、感染拡大防止に向けた公衆衛生の取り組みを助けるかもしれない。

#研究の限界

発見は重要だけど、限界もある。体が回復し始めると血液サンプルではウイルスの存在が示されなくなることがある。他のサンプルタイプ、例えば便や呼吸器サンプルを含めることで、さらに多くの感染を見つける可能性があるかもしれない。

#結論

この研究は、ウガンダの大きな健康問題を浮き彫りにして、未診断の熱の多くがウイルス感染に関連していることを示してる。mNGSのような先進的な検査方法を使うことで、隠れた感染が明らかになる。多くの症状のウイルス性を認識することで、ウガンダは治療プロトコルの改善、ワクチン接種の増加、さらなるアウトブレイクの防止に向けたステップを踏むことができる。

この結果は、ウガンダでのウイルス病をよりよく理解し、対処する必要があることを示してる。この研究は、多様な感染症の脅威に直面している地域での健康対策を導くために科学研究が重要であることを思い出させるものでもある。