手頃で持ち運びできるモバイルLAMP装置による遺伝子検査
MobileLAMPは、遺伝子検査のための簡単で低コストなソリューションを提供してるよ。
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目次
最近、等温増幅法っていう方法が、PCRっていう従来の技術に代わるシンプルな選択肢として注目を集めてるんだ。この等温法の中でも特に人気なのが、ループ媒介等温増幅法(LAMP)だよ。この技術は、使いやすくて結果がすぐに出るっていう利点があって、COVID-19やマラリア、HIV、結核に関連するテストでも好まれてる。
LAMPって何?
LAMPは、特定のDNAやRNAの配列をたくさんコピーする方法なんだ。このプロセスは感染症やその他の病状を診断するのに重要。LAMPのシンプルな設計は、従来の方法であるPCRと比べて部品が少なくて、特別な機材がなくても簡単に実施できるんだ。ただ、テストの成功に欠かせないプライマーを設計するのが難しいっていうデメリットもある。
良いインキュベーションデバイスが必要
LAMPの課題のひとつは、反応中に温度を一定に保つデバイスが必要ってこと。PCRは温度が変わるマシンが必要だけど、LAMPは一定の温度でやるのがベスト。今ある温度を保つデバイスは、複雑で高価なものが多くて、リソースの限られた場所では使いにくい。
MobileLAMPの開発
LAMPに適した機器の問題を解決するために、MobileLAMPデバイスが作られたんだ。この新しいデバイスは手頃で、持ち運びが簡単で、組み立ても楽。普通の5V USBの電源(携帯の充電器とか)で動かせるから、遠い場所でも使えるんだ。
MobileLAMPを作るのにかかる総コストは5ドル未満。必要なパーツ全部込みで、今ある他のLAMPデバイスと比べてもずっと安いよ。MobileLAMPの設計はシンプルだから、基本的なスキルがあれば誰でも作れるんだ。
MobileLAMPのパーツ
電気部品
MobileLAMPは、W1209という小さなサーモスタットモジュールを使ってて、安くて手に入りやすいんだ。このサーモスタットがLAMP反応に必要な温度を設定してコントロールするの。温度センサーがリアルタイムで熱を追跡して、反応が正しい温度で行われるようにしてくれる。
メカニカル部品
このデバイスは、熱源としてアルミブロックを使用していて、3Dプリンターでよく見かけるから安くて交換も簡単。設計には、熱源と反応チューブをしっかり固定できる穴が含まれてるんだ。
3Dプリントされたパーツ
MobileLAMPの多くのパーツは3Dプリントで作られていて、早く生産できるんだ。設計には、すべてをまとめるためのケースや、ユーザーがデバイスを操作するためのボタンも含まれてる。このパーツは手に入りやすい材料から作れるから、コストもさらに下げられる。
MobileLAMPの組み立て方
MobileLAMPを組み立てるには、まずケースの下部を置くところから始める。次に温度センサーと熱ブロックを入れて、全部ネジで固定。次に電気部品を配線して、回路図に従って接続が正しくできてるか確認する。
部品が接続できたら、ケースの上部を下部に置いて全部をしっかり固定する。このシンプルな組み立て方なら、誰でも簡単に自分のデバイスを作れるんだ。
MobileLAMPの使い方
操作手順
MobileLAMPを使うには、5Vの電源に接続する。ユーザーはデバイスにあるボタンを使って、希望する温度を設定できる。W1209モジュールが現在の温度を表示するから、適切な熱レベルに安定したかどうかがわかるんだ。
適切な温度に達したら、LAMP反応チューブを熱ブロックに置いてしっかり固定する。反応は指定された時間走らせ、その後チューブを取り外して、色の変化など目に見える変化をチェックする。これはターゲットの遺伝子材料の存在を示す。
MobileLAMPの利点
MobileLAMPは、既存のLAMPデバイスと比べていくつかの利点がある。低コストで、特にリソースの限られた地域ではより多くの人がアクセスできるようになる。設計がシンプルだから、すぐに使えるのも、緊急のテストが必要な状況では大事なポイントだよ。
さらに、ポータブルな点も大きな利点。標準のUSB電源で動けるから、家や職場、さらには遠隔地でも使える。これによって、従来のラボへのアクセスが制限されている地域でのテストの効率が上がるかもしれない。
それに、MobileLAMPはオープンソースで誰でもデザインを改良できるから、コミュニティの協力的な精神を育む。これがイノベーションを促進して、将来的にさらなる改善につながるかもしれない。
MobileLAMPの制限
たくさんの利点がある一方で、MobileLAMPにはいくつかの制限もある。特に目立つ制約は、一度に1つの反応チューブしか入れられないこと。つまり、ターゲットサンプルと一緒にコントロールサンプルを並行して走らせることができないから、結果の検証には不便なとこがある。
もう一つの制限は、反応室に加熱された蓋がないこと。商用デバイスでは、蒸発を防いで試薬が均一に混ざるように加熱された蓋が使われることが多いけど、ユーザーは液体の上に油を使ってこの問題を軽減することができる。でも、それには追加のステップが必要で、プロセスが面倒になることもある。
結論
MobileLAMPは、核酸検査の分野で有望な進展を示してる。低コストで使いやすく、ポータブルな特徴は、さまざまな状況での遺伝子材料の検査に貴重なツールを提供してくれる。制限もあるけど、そのデザインや実装が医療診断におけるアクセスの新たな可能性を開くんだ。MobileLAMPは、感染症のテストやモニタリングを改善する手助けをして、最終的には世界中の公衆衛生施策を支えることができるんだよ。
タイトル: MobileLAMP: A portable, low-cost, open-source device for isothermal nucleic acid amplification
概要: 1Isothermal amplification-based methods for pathogen DNA or RNA detection offer high sensitivity, rapid detection, and the potential for deployment in remote fields and home testing. Consequently, they are emerging as alternatives to PCR and saw a surge in research activity and deployment for the rapid detection of SARS-CoV-2 during the Covid-19 pandemic. The most common isothermal DNA detection methods rely on minimal reagents for DNA amplification and simple hardware that can maintain isothermal conditions and read-out a fluorescent or colorimetric signal. Many researchers globally are working on improving these components based on diverse end-user needs. In this work, we have recognized the need for an open-source hardware device for isothermal amplification, composed of off-the-shelf components that are easily accessible in any part of the world, is easily manufacturable in a distributed and scalable way using 3D printing, and that can be powered using a wide diversity of batteries and power sources. We demonstrate the easy assembly of our device design and demonstrate its efficacy using colorimetric LAMP for both RNA and DNA targets.
著者: Jennifer C Molloy, M. Bhupathi, S. Hegde, G. C. R. Devarapu
最終更新: 2024-02-16 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.13.580127
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.13.580127.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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