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Osservazioni dal Workflows Community Summit 2022

Gli esperti discutono delle sfide e dei progressi nei flussi di lavoro scientifici.

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Indice

I flussi di lavoro scientifici sono strumenti che aiutano scienziati e ricercatori a gestire esperimenti complessi. Questi flussi funzionano come una serie di passaggi collegati, permettendo ai ricercatori di eseguire analisi che coinvolgono grandi quantità di dati. Rendono più facile gestire tutto, dalla raccolta di dati all'elaborazione su computer potenti, conosciuti come calcolo ad alte prestazioni (HPC). Man mano che la scienza diventa più complessa e dipende dalla tecnologia, avere flussi di lavoro efficienti è fondamentale per fare scoperte.

Il Summit Comunitario 2022

A novembre 2022, si è tenuto un incontro importante conosciuto come il Summit della Comunità dei Flussi di Lavoro. Scienziati, sviluppatori e ricercatori di vari paesi si sono riuniti online per discutere il futuro dei flussi di lavoro scientifici. Questo summit si è concentrato sulle sfide e le esigenze che sorgono mentre i flussi di lavoro si evolvono.

Ci sono stati più di 100 partecipanti che hanno condiviso le loro esperienze e idee. Venivano da posti come Australia, Canada, Francia e Stati Uniti. L'obiettivo era collaborare e trovare soluzioni a problemi comuni nel calcolo scientifico.

Organizzazione del Summit

Il summit è stato organizzato da membri dedicati dell'Iniziativa della Comunità dei Flussi di Lavoro, un gruppo che mira a supportare i ricercatori e gli sviluppatori di flussi di lavoro. Forniscono risorse e promuovono la cooperazione tra i vari stakeholder. Questo summit è stato sostenuto da diversi progetti di ricerca che si concentrano sui flussi di lavoro e sul loro potenziale.

Argomenti di Discussione

Il summit ha presentato discussioni su vari argomenti rilevanti per i flussi di lavoro scientifici. Basandosi su incontri precedenti, la comunità aveva identificato sei aree importanti su cui concentrarsi nel 2022. Ogni argomento era guidato da un volontario che facilitava le discussioni.

Gli argomenti includevano:

  1. Specifiche, Standard e API
  2. Flussi di Lavoro AI
  3. Gestione dei Dati ad Alte Prestazioni
  4. Flussi di Lavoro In Situ
  5. Flussi di Lavoro Quantistici
  6. Flussi di Lavoro FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable)

Ogni sessione prevedeva presentazioni seguite da discussioni di gruppo per affrontare le sfide esistenti e proporre possibili soluzioni.

Specifiche, Standard e API

Una delle grandi sfide nei flussi di lavoro scientifici è la necessità di specifiche e standard chiari. Questi sono essenziali per garantire che diversi strumenti software possano comunicare e lavorare insieme in modo efficace. C'è una spinta per interfacce standard, conosciute come API, che possano collegare vari pezzi di software all'interno dei flussi di lavoro.

I partecipanti hanno discusso delle difficoltà che sorgono da standard variabili, che possono confondere gli utenti e ostacolare i progressi. Hanno esplorato modi per creare un vocabolario comune che tutti nel campo possano adottare.

Inoltre, c'è bisogno di una descrizione unificata di uno stack di flussi di lavoro, che serve da base per lo sviluppo di standard. Questo implica definire i diversi componenti dei flussi di lavoro, come la pianificazione delle attività e la gestione dei dati.

Flussi di Lavoro AI

L'intelligenza artificiale (AI) e l'apprendimento automatico (ML) stanno diventando parte integrante dei flussi di lavoro scientifici. Man mano che la potenza di calcolo aumenta, queste tecnologie consentono un'analisi e una modellazione dati migliori. I flussi di lavoro AI prevedono l'uso dell'AI per assistere nell'elaborazione e analisi dei dati in tempo reale.

I partecipanti hanno riconosciuto la complessità di integrare l'AI nei flussi di lavoro esistenti. Hanno evidenziato sfide come la gestione di grandi volumi di dati, il controllo delle versioni e la necessità di strumenti e framework adeguati. C'era un consenso sul fatto che sono necessari benchmark, o strumenti di misura delle prestazioni, per valutare i flussi di lavoro AI.

Inoltre, era importante categorizzare i flussi di lavoro AI in diversi tipi basati sulle loro applicazioni. Questa classificazione aiuta a comprendere i requisiti e le caratteristiche uniche di ciascun tipo.

Gestione dei Dati ad Alte Prestazioni

Una gestione efficiente dei dati è vitale nei flussi di lavoro scientifici, soprattutto per quelli che coinvolgono calcolo ad alte prestazioni. I ricercatori devono spostare i dati rapidamente ed efficacemente per garantire operazioni senza intoppi. Il summit si è concentrato sulle sfide della gestione delle enormi quantità di dati generate negli esperimenti moderni.

I flussi di lavoro in situ, che elaborano i dati man mano che vengono prodotti, sono stati un argomento significativo di discussione. Questi flussi mirano a ridurre la necessità di un'archiviazione eccessiva dei dati e migliorare l'analisi immediata. I partecipanti hanno condiviso le loro esperienze con sfide come la compressione dei dati e l'integrazione di diversi tipi di dati.

La necessità di strumenti di gestione dei dati ad alte prestazioni era evidente. Soluzioni che possono ottimizzare il trasporto e l'elaborazione dei dati possono migliorare l'efficacia complessiva dei flussi di lavoro scientifici.

Flussi di Lavoro In Situ

I flussi di lavoro in situ sono progettati per elaborare i dati da simulazioni o strumenti in tempo reale, piuttosto che memorizzare tutti i dati per un uso successivo. Questo approccio riduce il carico sui sistemi di archiviazione dei dati e accelera l'analisi. Il summit ha discusso come questi flussi si siano evoluti e i diversi metodi utilizzati oggi.

I partecipanti hanno esplorato la necessità di una migliore gestione dei dati prodotti durante l'analisi in situ. Questo include trovare modi efficaci per organizzare, trasportare e analizzare i dati man mano che diventano disponibili. L'uso di dati in streaming e flussi di lavoro basati su eventi è stato evidenziato come una tendenza in crescita.

Con l'aumento della domanda di elaborazione dei dati in tempo reale, stabilire standard per i flussi di lavoro in situ diventa essenziale.

Flussi di Lavoro Quantistici

Il calcolo quantistico è un campo emergente con il potenziale di rivoluzionare i flussi di lavoro scientifici. Attualmente, la maggior parte dei flussi di lavoro opera utilizzando calcoli classici. Tuttavia, con i progressi nella tecnologia quantistica, c'è la necessità di combinare efficacemente entrambe le forme di calcolo.

Il summit ha messo in evidenza le sfide affrontate nell'integrare il calcolo quantistico nei flussi di lavoro esistenti. Sono stati discussi argomenti come garantire la compatibilità tra sistemi classici e quantistici, gestire gli scambi di dati e affrontare la disponibilità limitata delle risorse quantistiche.

Man mano che il calcolo quantistico cresce, sarà cruciale sviluppare strumenti e framework che possano colmare il divario tra HPC classico e sistemi quantistici.

Flussi di Lavoro FAIR

I principi FAIR sottolineano l'importanza di rendere i dati e i flussi di lavoro scopribili, accessibili, interoperabili e riutilizzabili. Nel contesto dei flussi di lavoro scientifici, applicare questi principi aiuta a garantire che i ricercatori possano condividere facilmente i loro metodi e risultati.

I partecipanti hanno esaminato modi per creare repository e registri per flussi di lavoro che rispettino i principi FAIR. Hanno discusso la necessità di catturare metadati, documentare i dettagli dell'esecuzione dei flussi di lavoro e promuovere l'uso di identificatori persistenti per gli oggetti di flusso di lavoro.

L'obiettivo è creare sistemi che non solo archiviano flussi di lavoro ma che li rendano anche facili da trovare e utilizzare per altri progetti di ricerca.

Flussi di Lavoro Cross-Facility e Computing Continuum

Man mano che la ricerca scientifica diventa più collaborativa, c'è una crescente necessità di flussi di lavoro che possano operare tra diverse strutture. Questi flussi di lavoro cross-facility permettono un miglior utilizzo delle risorse collegando vari luoghi di calcolo.

I flussi di lavoro continuum coinvolgono diverse fasi di calcolo, come il calcolo edge, soluzioni cloud e HPC. Il summit ha esplorato le sfide della gestione dei dati e delle risorse in più ambienti e di garantire che i flussi di lavoro possano adattarsi a sistemi diversi.

I partecipanti hanno riconosciuto la necessità di strumenti che aiutino a coordinare le attività e gestire i flussi di dati tra queste diverse strutture. Hanno anche discusso la necessità di design flessibili che possano adattarsi a diverse capacità di calcolo.

Conclusione

Il Summit della Comunità dei Flussi di Lavoro 2022 ha fornito preziosi spunti sulle attuali sfide e direzioni future per i flussi di lavoro scientifici. I partecipanti hanno condiviso le loro conoscenze ed esperienze, concentrandosi su come migliorare la collaborazione tra ricercatori, sviluppatori e strutture.

Dall'affrontare questioni di standardizzazione e gestione dei dati all'integrazione dell'AI e del calcolo quantistico, è chiaro che il campo dei flussi di lavoro scientifici si sta evolvendo rapidamente. La continua collaborazione e discussione all'interno della comunità sarà cruciale per plasmare il futuro della ricerca scientifica e della scoperta.

Promuovendo un forte focus comunitario, è possibile affrontare la complessità del calcolo scientifico moderno e migliorare l'efficienza e l'efficacia dei flussi di lavoro attraverso varie discipline.

Fonte originale

Titolo: Workflows Community Summit 2022: A Roadmap Revolution

Estratto: Scientific workflows have become integral tools in broad scientific computing use cases. Science discovery is increasingly dependent on workflows to orchestrate large and complex scientific experiments that range from execution of a cloud-based data preprocessing pipeline to multi-facility instrument-to-edge-to-HPC computational workflows. Given the changing landscape of scientific computing and the evolving needs of emerging scientific applications, it is paramount that the development of novel scientific workflows and system functionalities seek to increase the efficiency, resilience, and pervasiveness of existing systems and applications. Specifically, the proliferation of machine learning/artificial intelligence (ML/AI) workflows, need for processing large scale datasets produced by instruments at the edge, intensification of near real-time data processing, support for long-term experiment campaigns, and emergence of quantum computing as an adjunct to HPC, have significantly changed the functional and operational requirements of workflow systems. Workflow systems now need to, for example, support data streams from the edge-to-cloud-to-HPC enable the management of many small-sized files, allow data reduction while ensuring high accuracy, orchestrate distributed services (workflows, instruments, data movement, provenance, publication, etc.) across computing and user facilities, among others. Further, to accelerate science, it is also necessary that these systems implement specifications/standards and APIs for seamless (horizontal and vertical) integration between systems and applications, as well as enabling the publication of workflows and their associated products according to the FAIR principles. This document reports on discussions and findings from the 2022 international edition of the Workflows Community Summit that took place on November 29 and 30, 2022.

Autori: Rafael Ferreira da Silva, Rosa M. Badia, Venkat Bala, Debbie Bard, Peer-Timo Bremer, Ian Buckley, Silvina Caino-Lores, Kyle Chard, Carole Goble, Shantenu Jha, Daniel S. Katz, Daniel Laney, Manish Parashar, Frederic Suter, Nick Tyler, Thomas Uram, Ilkay Altintas, Stefan Andersson, William Arndt, Juan Aznar, Jonathan Bader, Bartosz Balis, Chris Blanton, Kelly Rosa Braghetto, Aharon Brodutch, Paul Brunk, Henri Casanova, Alba Cervera Lierta, Justin Chigu, Taina Coleman, Nick Collier, Iacopo Colonnelli, Frederik Coppens, Michael Crusoe, Will Cunningham, Bruno de Paula Kinoshita, Paolo Di Tommaso, Charles Doutriaux, Matthew Downton, Wael Elwasif, Bjoern Enders, Chris Erdmann, Thomas Fahringer, Ludmilla Figueiredo, Rosa Filgueira, Martin Foltin, Anne Fouilloux, Luiz Gadelha, Andy Gallo, Artur Garcia Saez, Daniel Garijo, Roman Gerlach, Ryan Grant, Samuel Grayson, Patricia Grubel, Johan Gustafsson, Valerie Hayot-Sasson, Oscar Hernandez, Marcus Hilbrich, AnnMary Justine, Ian Laflotte, Fabian Lehmann, Andre Luckow, Jakob Luettgau, Ketan Maheshwari, Motohiko Matsuda, Doriana Medic, Pete Mendygral, Marek Michalewicz, Jorji Nonaka, Maciej Pawlik, Loic Pottier, Line Pouchard, Mathias Putz, Santosh Kumar Radha, Lavanya Ramakrishnan, Sashko Ristov, Paul Romano, Daniel Rosendo, Martin Ruefenacht, Katarzyna Rycerz, Nishant Saurabh, Volodymyr Savchenko, Martin Schulz, Christine Simpson, Raul Sirvent, Tyler Skluzacek, Stian Soiland-Reyes, Renan Souza, Sreenivas Rangan Sukumar, Ziheng Sun, Alan Sussman, Douglas Thain, Mikhail Titov, Benjamin Tovar, Aalap Tripathy, Matteo Turilli, Bartosz Tuznik, Hubertus van Dam, Aurelio Vivas, Logan Ward, Patrick Widener, Sean Wilkinson, Justyna Zawalska, Mahnoor Zulfiqar

Ultimo aggiornamento: 2023-03-31 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://arxiv.org/abs/2304.00019

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2304.00019

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia arxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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