Analizzando il malripiegamento dell'α-Sinucleina nei modelli di Drosophila
La ricerca sul comportamento dell'α-sinucleina offre spunti sulle malattie neurodegenerative.
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Indice
Il mal ripiegamento di alcune proteine nel cervello è legato a diverse malattie che colpiscono il sistema nervoso. Una proteina significativa coinvolta in questi disturbi è l'α-sinucleina, associata a condizioni come la malattia di Parkinson, la demenza e altre. Questa proteina può aggregarsi per formare ammassi chiamati corpi di Lewy, che sono una caratteristica distintiva di queste malattie. Capire come si comporta l'α-sinucleina in diverse condizioni è fondamentale per avere una visione più chiara di questi disturbi.
Il Ruolo dell'α-Sinucleina
L'α-sinucleina si trova principalmente nelle cellule nervose ed è solitamente in forma solubile. Tuttavia, può trasformarsi in una forma insolubile quando si ripiega male o si aggrega. Questa trasformazione è un fattore significativo nelle malattie conosciute come sinucleinopatie. Nei cervelli sani, l'α-sinucleina gioca un ruolo nel rilascio dei neurotrasmettitori, ma quando si accumula nel suo stato mal ripiegato, può risultare dannosa.
La malattia di Parkinson è la più comune tra questi disturbi. I sintomi includono movimenti rallentati, rigidità e tremori. Le ricerche mostrano che le variazioni nella quantità e nella forma dell'α-sinucleina possono correlare con la progressione e la gravità della malattia.
Tecniche di Frammentazione
Per studiare l'α-sinucleina e il suo comportamento, gli scienziati usano spesso metodi biochimici per separare le diverse forme della proteina in base alla loro solubilità. Questo processo è conosciuto come frammentazione. L'obiettivo principale è capire quanta α-sinucleina esiste in stati solubili rispetto a quelli insolubili e valutare come questo cambi con l'età o la progressione della malattia.
Nel caso dei cervelli umani, i ricercatori hanno stabilito metodi per frazionare l'α-sinucleina in base alle sue proprietà chimiche. Questo approccio è stato adattato per essere utilizzato nei moscerini della frutta, che servono come organismo modello per studiare le malattie neurodegenerative.
L'Uso dei Modelli di Drosophila
I moscerini della frutta, o Drosophila melanogaster, sono utili per studiare gli effetti dell'α-sinucleina perché la loro genetica è facile da manipolare. I ricercatori possono introdurre geni umani, inclusi quelli responsabili della produzione di α-sinucleina, nel genoma del moscerino. Questo consente loro di osservare come queste proteine influenzano la funzione cerebrale e il comportamento.
Studiando l'α-sinucleina nei moscerini della frutta, i ricercatori hanno appreso molto sugli effetti dannosi della proteina, particolarmente sui neuroni produttori di dopamina. Questi neuroni sono critici per il movimento e sono noti per essere particolarmente vulnerabili in malattie come il Parkinson.
L'Esperimento
In questo studio, gli scienziati hanno sviluppato un protocollo multi-step per separare e analizzare l'α-sinucleina nei Drosophila. L'obiettivo era determinare quanta proteina fosse presente in diversi stati di solubilità e se la Sonificazione-un processo che utilizza onde sonore per rompere le cellule-potesse influenzare questi stati.
Design Sperimentale
I moscerini che esprimevano α-sinucleina umana sono stati cresciuti fino a un'età specifica, quindi raccolti per l'analisi. Sono stati rapidamente congelati per preservare la loro condizione prima che le loro teste venissero separate e omogeneizzate. Questa omogeneizzazione aiuta a rompere le cellule per rilasciare i loro contenuti per ulteriori analisi.
I ricercatori hanno poi usato una tecnica chiamata ultracentrifugazione, che separa i diversi componenti in base alla loro densità. Questo passaggio è stato suddiviso in tre frazioni in base a quanto bene le proteine si dissolvono in varie soluzioni, come TBS (una soluzione salina), SDS (un detergente forte) e RIPA (un tampone contenente più detergenti).
Risultati
I risultati hanno mostrato che la maggior parte dell'α-sinucleina nei moscerini era rilevabile nelle frazioni solubili, principalmente quando si usava SDS o RIPA come solventi. Lo studio si è concentrato su come i diversi detergenti influenzassero il recupero dell'α-sinucleina e se la sonificazione precedente cambiasse la sua solubilità.
Effetti dei Detergenti
I detergenti giocano un ruolo chiave nella solubilità delle proteine. Lo studio ha trovato che l'uso di solo SDS consentiva la valutazione più precisa dell'α-sinucleina nelle sue varie forme. RIPA e NP-40, altri due detergenti, erano anch'essi efficaci ma sembravano solubilizzare praticamente tutta l'α-sinucleina, rendendo difficile valutare accuratamente le forme insolubili.
La presenza di sonificazione ha aumentato la solubilità dell'α-sinucleina in alcuni casi. La sonificazione rompe gli aggregati, permettendo a più proteina di dissolversi nella soluzione. Tuttavia, questo complica l'analisi poiché sfuma le linee tra stati solubili e insolubili.
Riepilogo dei Risultati di Solubilità
La ricerca ha indicato che, usando SDS, l'α-sinucleina si trovava per lo più nella frazione solubile, ma c'erano ancora quantità considerevoli nella frazione insolubile. Al contrario, usando RIPA o NP-40, quasi tutta l'α-sinucleina era solubile, portando a una potenziale sottovalutazione della sua insolubilità.
Controllo dell'α-Tubulina
Per assicurarsi che il metodo di Frazionamento funzionasse in modo efficace, i ricercatori hanno misurato anche l'α-tubulina, una proteina di controllo che dovrebbe rimanere solubile. I risultati hanno mostrato che l'α-tubulina si comportava in modo coerente attraverso tutte le frazioni, confermando che il metodo era valido.
Implicazioni della Sonificazione
Lo studio ha anche valutato l'impatto della sonificazione sull'α-sinucleina. È stato trovato che questo processo aumentava la quantità di proteina rilevata nella frazione solubile, il che potrebbe indicare che può rompere aggregati più grandi. Tuttavia, questa scoperta pone una sfida per i ricercatori, poiché l'interpretazione degli stati di solubilità potrebbe essere influenzata dall'uso della sonificazione.
Conclusione
I risultati di questo studio sottolineano l'importanza di selezionare i metodi e le condizioni giuste quando si indaga il comportamento dell'α-sinucleina. I risultati evidenziano che la scelta del detergente, l'uso della sonificazione e il design sperimentale complessivo giocano ruoli cruciali nel determinare la solubilità e lo stato dell'α-sinucleina.
Il lavoro dimostra che i Drosophila sono un modello prezioso per studiare le sinucleinopatie e offre intuizioni che potrebbero informare future ricerche e strategie terapeutiche per malattie come il Parkinson. Comprendere come analizzare con precisione l'α-sinucleina nei sistemi modello potrebbe aprire la strada a migliori opzioni di trattamento e a uno sviluppo di farmaci più efficace.
Direzioni Future
La ricerca continua utilizzando modelli di Drosophila sarà essenziale per chiarire ulteriormente i meccanismi dietro l'aggregazione dell'α-sinucleina e i suoi effetti sulla salute neuronale. Studi futuri potrebbero esplorare come diversi fattori ambientali, background genetici e proteine aggiuntive interagiscono con l'α-sinucleina.
Migliorando i protocolli e le metodologie per studiare la solubilità e l'aggregazione delle proteine, i ricercatori saranno meglio equipaggiati per affrontare le sfide poste dalle malattie neurodegenerative e per sviluppare interventi più efficaci.
Titolo: Biochemical fractionation of human α-Synuclein in a Drosophila model of synucleinopathies
Estratto: Synucleinopathies are a group of central nervous system pathologies that are characterized by neuronal accumulation of misfolded and aggregated -synuclein in proteinaceous depositions known as Lewy Bodies (LBs). The transition of -synuclein from its physiological to pathological form has been associated with several post-translational modifications such as phosphorylation and an increasing degree of insolubility, which also correlate with disease progression in post-mortem specimens from human patients. Neuronal expression of -synuclein in model organisms, including Drosophila melanogaster, has been a typical approach employed to study its physiological effects. Biochemical analysis of -synuclein solubility via high-speed ultracentrifugation with buffers of increasing detergent strength offers a potent method for identification of -synuclein biochemical properties and the associated pathology stage. Unfortunately, the development of a robust and reproducible method for evaluation of human -synuclein solubility isolated from Drosophila tissues has remained elusive. Here, we tested different detergents for their ability to solubilize human -synuclein carrying the pathological mutation A53T from brains of aged flies. We also assessed the effect of sonication on solubility of human -synuclein and optimized a protocol to discriminate relative amounts of soluble/insoluble human -synuclein from dopaminergic neurons of the Drosophila brain. Our data established that, using a 5% SDS buffer, the 3-step protocol distinguishes between cytosolic soluble proteins in fraction 1, detergent-soluble proteins in fraction 2 and insoluble proteins in fraction 3. This protocol shows that sonication breaks down -synuclein insoluble complexes from the fly brain, making them soluble in the SDS buffer and enriching fraction 2 of the protocol.
Autori: Alfonso Martin-Pena, K. Imomnazarov, J. Lopez-Scarim, I. Bagheri, V. Joers, M. G. Tansey
Ultimo aggiornamento: 2024-02-13 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.05.579034
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.05.579034.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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