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# Biologie# Biologie cellulaire

Réponse au stress mitochondrial : voies clés révélées

L'étude explore le rôle de l'ISR dans la santé mitochondriale en période de stress.

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Les mitochondries sont de petites structures dans nos cellules qui jouent un rôle clé dans la production d'énergie, la gestion des graisses et le contrôle des signaux de mort cellulaire. Pour effectuer ces tâches efficacement, les mitochondries doivent garder l'équilibre de leurs protéines, ce qu'on appelle la protéostasie mitochondriale. Cet équilibre est maintenu par diverses protéines responsables de l'importation, du repliement et de la dégradation des nombreuses protéines qui résident dans les mitochondries. S'il y a un déséquilibre causé par des changements génétiques, des facteurs environnementaux ou le vieillissement, cela peut entraîner des problèmes dans les mitochondries. Cette dysfonction est liée à diverses maladies, comme le cancer, les troubles métaboliques et les maladies affectant le système nerveux. Donc, comprendre comment la protéostasie mitochondriale est gérée en réponse au stress est super important.

Signaux de stress et protéostasie mitochondriale

Quand les cellules sont en stress, plusieurs voies de signalisation peuvent s'activer pour aider à gérer la protéostasie mitochondriale. L'une de ces voies s'appelle la réponse au stress des protéines repliées mitochondriales (UPRmt), qui a attiré beaucoup d'attention. Découverte à l'origine chez un petit ver appelé C. elegans, l'UPRmt est aussi présente dans les cellules mammifères. Dans ces cellules, l'UPRmt interagit avec un réseau plus large de réponses au stress connu sous le nom de réponse intégrée au stress (ISR). L'ISR inclut quatre protéines clés qui réagissent à différents types de stress, comme les infections, le manque d'acides aminés, et les problèmes au sein du réticulum endoplasmique, une structure cellulaire impliquée dans la production et le traitement des protéines.

Quand ces protéines de réponse au stress sont activées, elles provoquent une interruption temporaire de la production de nouvelles protéines tout en activant certains facteurs de transcription, comme ATF4, pour aider à gérer le stress cellulaire.

Rôle de l'ISR dans la protéostasie mitochondriale

L'ISR joue un rôle important dans la régulation de la protéostasie mitochondriale. Quand la signalisation de l'ISR est activée, cela déclenche la production de plusieurs protéines qui aident à maintenir la santé mitochondriale. Par exemple, elle active la chaperonne HSP70 HSPA9 et une protéine de contrôle qualité appelée LON. De plus, l'ISR est aussi impliquée dans la manière dont les protéines sont importées dans les mitochondries et régule la production d'énergie, la gestion des graisses et la forme des mitochondries. Cela souligne l'importance de l'ISR pour aider les mitochondries à répondre au stress.

Mécanisme d'activation de l'ISR par le stress mitochondrial

Des études récentes ont identifié le processus par lequel le stress mitochondrial active l'ISR. Quand les mitochondries subissent du stress, une protéine appelée DELE1 s'accumule dans le cytoplasme. DELE1 peut former des grappes et se lier à la protéine ISR HRI, déclenchant une réaction en chaîne qui mène à l'activation de la signalisation de l'ISR. D'autres protéines ISR peuvent aussi être activées par le stress mitochondrial, mettant en lumière le rôle central de l'ISR dans la gestion de la santé mitochondriale lors de situations stressantes.

Autres voies affectées par le stress mitochondrial

Bien que l'ISR soit critique, d'autres voies de réponse au stress peuvent aussi être activées en réponse à des problèmes dans les mitochondries. Une de ces voies est la Réponse au choc thermique (HSR), qui influence la production de chaperonnes mitochondriales comme HSP60. L'activation de HSF1, un facteur de transcription lié à l'HSR, se produit quand l'importation de protéines mitochondriales est réduite, ce qui indique que HSF1 est essentiel pour l'adaptation mitochondriale au stress. De plus, des perturbations de la fonction mitochondriale peuvent activer une autre protéine appelée Nrf2, qui est impliquée dans la gestion du stress oxydatif.

Investigation de l'activation des voies de stress

Pour explorer comment la protéostasie mitochondriale est affectée par des changements génétiques, une approche de profilage des ensembles de gènes a été utilisée. Cette méthode consistait à examiner comment des gènes spécifiques modifient leur expression lorsque certaines voies de stress sont activées. L'accent était mis sur les gènes réagissant au stress impliqués dans des voies comme l'ISR, l'HSR et la réponse au stress oxydatif dans les cellules K562, un type de lignée cellulaire humaine utilisée en recherche.

L'approche de profilage a montré que lorsque des gènes spécifiques liés à la santé mitochondriale étaient ciblés pour être perturbés, seule l'ISR montrait une activation significative. Cette découverte a été confirmée à travers diverses expériences et indiquait que l'ISR est la principale voie activée suite à des perturbations mitochondriales, contrairement à d'autres voies qui ne présentaient pas de réponses similaires.

Mécanismes de disruption de la protéostasie

Plus en détail, lorsque des protéines dans les mitochondries étaient ciblées pour déplétion génique, il y avait une augmentation notable de l'expression des gènes cibles de l'ISR. Les observations montraient que même lorsque l'efficacité de la délétion génique variait, l'ISR était constamment activée en réponse à la perte de facteurs de protéostasie mitochondriale, comme HSPA9 et HSPE1.

Une analyse comparative des changements d'expression génique a révélé des similitudes dans la manière dont différents facteurs de protéostasie mitochondriale affectaient l'ISR, suggérant un mécanisme de réponse partagé. Une exploration plus approfondie a montré que ces perturbations entraînaient des changements dans l'expression de gènes impliqués dans des réponses au stress similaires.

Déplétion génétique des protéines mitochondriales

Les chercheurs ont élargi leur analyse pour inclure diverses protéines mitochondriales. Un examen plus large des cellules K562 dépourvues de nombreuses protéines mitochondriales a confirmé que l'ISR restait la principale voie activée. D'autres voies de réponse au stress ne montraient pas d'activation significative dans ces cas.

Fait intéressant, des gènes qui n'avaient pas été précédemment liés aux voies de stress ont aussi été trouvés pour activer l'ISR. Cela suggère que les perturbations de la santé mitochondriale peuvent déclencher des réponses plus larges, avec l'ISR jouant un rôle crucial.

Conclusion

L'étude de la protéostasie mitochondriale met en évidence l'importance de l'ISR comme une voie de signalisation vitale face au stress cellulaire. En se concentrant sur la manière dont les cellules réagissent à la perturbation de la santé mitochondriale, il devient plus clair que l'ISR est critique pour maintenir la fonction mitochondriale et le bien-être cellulaire global. De futures recherches dans ce domaine promettent de mieux comprendre et éventuellement traiter diverses maladies liées à la dysfonction mitochondriale. En s'appuyant sur les connaissances acquises concernant l'ISR, il y a un potentiel pour de nouvelles stratégies visant à cibler les problèmes mitochondriaux dans diverses conditions de santé.

Source originale

Titre: Mapping Stress-Responsive Signaling Pathways Induced by Mitochondrial Proteostasis Perturbations

Résumé: Imbalances in mitochondrial proteostasis are associated with pathologic mitochondrial dysfunction implicated in etiologically-diverse diseases. This has led to considerable interest in defining the biological mechanisms responsible for regulating mitochondria in response to mitochondrial stress. Numerous stress responsive signaling pathways have been suggested to regulate mitochondria in response to proteotoxic stress, including the integrated stress response (ISR), the heat shock response (HSR), and the oxidative stress response (OSR). Here, we define the specific stress signaling pathways activated in response to mitochondrial proteostasis stress by monitoring the expression of sets of genes regulated downstream of each of these signaling pathways in published Perturb-seq datasets from K562 cells CRISPRi-depleted of individual mitochondrial proteostasis factors. Interestingly, we find that the ISR is preferentially activated in response to mitochondrial proteostasis stress, with no other pathway showing significant activation. Further expanding this study, we show that broad depletion of mitochondria-localized proteins similarly shows preferential activation of the ISR relative to other stress-responsive signaling pathways. These results both establish our gene set profiling approach as a viable strategy to probe stress responsive signaling pathways induced by perturbations to specific organelles and identify the ISR as the predominant stress-responsive signaling pathway activated in response to mitochondrial proteostasis disruption.

Auteurs: Luke Wiseman, Z. Khattar, N. Madrazo, E. Powers, J. D. Rosarda

Dernière mise à jour: 2024-02-01 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.30.577830

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.30.577830.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

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