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Faire avancer la culture du soja grâce à l'analyse des traits

La recherche se concentre sur la prédiction des rendements de soja sous différentes conditions de lumière.

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Le soja est une culture super importante cultivée partout dans le monde. C'est la quatrième culture la plus produite à l'échelle mondiale et elle joue un rôle majeur dans l'agriculture. Au Brésil, le soja est essentiel car il sert de base pour plein de produits alimentaires et d'aliments pour animaux. Le Brésil est devenu l'un des principaux producteurs et exportateurs de soja, travaillant en étroite collaboration avec les États-Unis, qui ensemble représentent une grosse partie du marché mondial du soja. Le succès de la culture du soja au Brésil est en grande partie dû à la sélection végétale.

Le besoin de pratiques agricoles améliorées

Avec la demande croissante de nourriture, les agriculteurs cherchent des moyens de produire plus avec moins de ressources et de s'adapter aux changements climatiques. Des études récentes ont montré que le soja est intégré dans diverses méthodes agricoles, comme le planter à côté du maïs, dans des systèmes agroforestiers, et en culture intercalaires. Cependant, l’un des principaux défis est de choisir les bonnes Variétés de soja. Différents systèmes agricoles, surtout ceux qui incluent d'autres plantes ou arbres, peuvent affecter les plants de soja en ce qui concerne leur croissance et leur production. Par exemple, quand d'autres plantes fournissent de l'ombre, ça peut réduire la quantité de lumière disponible pour les sojas, impactant ainsi leur rendement.

Défis dans la sélection du soja

Dans la sélection du soja, une tâche majeure est de découvrir quels Traits des plantes sont les plus importants pour obtenir de bons Rendements. Cette info aide les sélectionneurs à prendre des décisions plus rapides et plus intelligentes. Même si c'est utile de regarder beaucoup de traits en même temps, déterminer lesquels sont les plus prédictifs peut être compliqué. Pour y faire face, les agriculteurs et les chercheurs utilisent des techniques informatiques avancées comme les réseaux de neurones artificiels et les arbres de décision. Ces outils peuvent trouver des relations complexes entre différents traits et comment ils impactent le rendement.

Utilisation de la technologie pour l'analyse des traits

Une méthode pour évaluer l'importance des traits repose sur des algorithmes qui analysent comment différents traits contribuent au rendement. En examinant les connexions entre les traits avec ces algorithmes, les chercheurs peuvent identifier quels traits comptent le plus. Cette approche a été efficace dans des études précédentes pour prévoir les rendements et comprendre comment différents facteurs affectent la culture du soja.

Dans ce contexte, notre recherche avait deux objectifs : d'abord, prédire combien de grains de soja seraient produits sous différentes conditions d'Ombrage ; ensuite, identifier quels traits étaient les plus importants pour faire des prévisions précises.

Aperçu de l'expérience

Les expériences se sont déroulées au Brésil, où différentes variétés de soja ont été testées sous diverses conditions lumineuses. La recherche a évalué seize variétés commerciales de soja, la plupart étant des variétés indéterminées.

Au cours des expériences, nous avons utilisé différents niveaux d'ombre, comme plein soleil, 25 % d'ombre et 48 % d'ombre. Les plants ont été cultivés dans des serres et dans des champs ouverts avec des filets spéciaux pour contrôler la quantité de lumière qu'ils recevaient, nous permettant d'étudier les effets de la lumière réduite sur leur performance.

Mesure des traits

Quand les sojas ont atteint une certaine étape de croissance, plusieurs traits ont été mesurés pour évaluer leur santé et leur potentiel de rendement. Ces traits incluaient :

  • La superficie foliaire, qui indique combien de lumière la plante peut capter pour la photosynthèse.
  • Le contenu en chlorophylle, qui aide à comprendre la capacité de la plante à produire de la nourriture.
  • La température du feuillage, qui donne des infos sur le stress des plantes et l’efficacité dans l'utilisation de l'eau.
  • La hauteur et le diamètre des plantes, qui peuvent indiquer la santé globale et le potentiel de rendement.

Chacun de ces traits nous donne des infos précieuses sur la performance des plants dans différentes situations d'ombrage.

Analyse des données pour les prévisions

Pour améliorer l'efficacité de nos prévisions, nous avons organisé les données collectées lors des expériences. En utilisant des méthodes d'apprentissage automatique, nous avons pu analyser comment chaque trait contribuait au rendement du soja selon les différents scénarios d'exposition au soleil. Nous avons utilisé plusieurs modèles pour évaluer cela, y compris :

  • Multilayer Perceptron (MLP) : Un type de réseau de neurones qui aide à estimer la contribution de chaque trait.
  • Radial Basis Function Network (RBF) : Une autre méthode de réseau de neurones axée sur la recherche des meilleures prévisions basées sur les entrées de traits.
  • Arbres de décision, forêts aléatoires et bagging : Ce sont diverses techniques d'apprentissage automatique pour aider à analyser les données.

Résultats et conclusions

Les résultats de notre analyse ont montré que différentes méthodes de prédiction fonctionnaient mieux sous différents niveaux d'ombre. Par exemple, les modèles de Forêts Aléatoires étaient les plus précis en plein soleil, tandis que les réseaux de neurones étaient plus performants dans des conditions ombragées. Les analyses ont indiqué que certains traits, comme la superficie foliaire, le diamètre des plantes et la fluorescence maximale, étaient cruciaux pour prédire le rendement, surtout quand la lumière était limitée.

Comprendre l'importance des traits

Les traits jugés les plus importants variaient selon les conditions de lumière. Par exemple, en plein soleil, des traits comme le diamètre des plantes, les niveaux de chlorophylle et la superficie foliaire étaient de bons indicateurs de rendement. Cependant, au fur et à mesure que l'ombre augmentait, des traits comme le nombre de gousses et le nombre de graines par gousse devenaient plus critiques.

Ces informations sont précieuses car elles aident les sélectionneurs à choisir des variétés de soja qui prospéreront dans des conditions spécifiques. Par exemple, dans des environnements ombragés, choisir des plants avec plus de graines par gousse peut mener à de meilleurs rendements, même si les plants sont exposés à moins de lumière.

Implications pratiques pour les agriculteurs

Les agriculteurs peuvent utiliser ces insights pour améliorer leurs stratégies de production de soja. En comprenant quels traits contribuent au rendement dans diverses conditions environnementales, ils peuvent prendre des décisions plus éclairées sur quelles variétés de soja planter. C'est particulièrement important alors que les pratiques agricoles s'adaptent à de nouveaux défis comme le changement climatique et les limitations de ressources.

Conclusion

En résumé, notre recherche met en lumière l'importance d'utiliser des techniques avancées pour analyser les traits de soja et leur contribution au rendement. Différentes méthodologies offrent diverses forces, surtout sous des conditions lumineuses changeantes. Avec les avancées continues en apprentissage automatique et analyse computationnelle, les agriculteurs et sélectionneurs peuvent optimiser la production de soja, menant à des pratiques agricoles plus durables.

En se concentrant sur les bons traits et en utilisant la technologie efficacement, la communauté agricole peut améliorer les rendements des cultures, répondre à la demande alimentaire croissante et s'adapter aux défis posés par le changement climatique. Ce travail bénéficie non seulement aux agriculteurs, mais contribue aussi à la sécurité alimentaire mondiale.

Source originale

Titre: Trait prediction through computational intelligence and machine learning applied to soybean (Glycine max) breeding in shaded environments

Résumé: This study aims to identify more relevant predictors traits, considering different prediction approaches in soybean under different shading levels in the field, using methodologies based on artificial intelligence and machine learning. The experiments were carried out under different shading levels in a greenhouse and in the field, using sixteen cultivars. We have evaluated grain yield, which was used as a response trait, and 22 other attributes as explanatory traits. Three levels of shading were used to restrict photosynthetically active radiation (RPAR): 0%, 25%, and 48%. At full sun level (0% RPAR), the traits that presented better predictive performances using a multilayer perceptron were specific leaf area, plant height and number of pods. In the three levels of shading, the plant height trait exhibited the best performance for the radial base function network. Plant height showed the best predictive efficiency for grain yield at 25% and 48% RPAR, for all machine learning methodologies. Computational intelligence and machine learning methodologies have proven to be efficient in predicting soybean grain yield, regardless of shading level.

Auteurs: Antônio Carlos da Silva Júnior, A. C. da Silva Junior, W. G. d. Costa, A. G. Guimaraes, W. M. Moura, L. L. Bhering, C. D. Cruz, R. O. Batista, J. B. Santos, W. F. Campos, A. B. Evaristo

Dernière mise à jour: 2024-02-01 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.31.578252

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.31.578252.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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