Simple Science

La science de pointe expliquée simplement

# Biologie# Génétique

Le rôle de SKR-1 dans l'assemblage des chromosomes

Une étude révèle l'importance de SKR-1 dans l'organisation des chromosomes pendant la méiose.

― 8 min lire


SKR-1 : Clé deSKR-1 : Clé del'assemblage deschromosomesla méiose.avant le rôle essentiel de SKR-1 dansDe nouvelles découvertes mettent en
Table des matières

Le Complexe synaptonémal (SC) est une structure qui aide à organiser les Chromosomes pendant un processus appelé Méiose, crucial pour la reproduction sexuelle. Ça fonctionne en alignant les chromosomes de chaque parent et en contrôlant les échanges de matériel génétique entre eux. Ce processus garantit que les chromosomes se séparent correctement quand les cellules se divisent. Les scientifiques ont découvert le SC il y a plus de soixante ans en utilisant un type d'imagerie puissant appelé microscopie électronique.

Le SC se compose de deux structures parallèles, appelées éléments latéraux ou axiaux, séparées par des éléments qui forment ce qu’on appelle la région centrale du SC. Même si le SC est présent chez de nombreuses créatures qui se reproduisent sexuellement, ses composants individuels peuvent avoir des apparences assez différentes d'un organisme à l'autre, ce qui suggère une histoire évolutive complexe.

Le Rôle des Composants du SC

Beaucoup d'éléments du SC travaillent ensemble et dépendent les uns des autres pour un assemblage correct sur les chromosomes, ce qui peut compliquer les études sur leurs fonctions. Récemment, des chercheurs ont pu identifier certains composants du SC chez des bactéries, suggérant que ces parties sont étroitement interconnectées pour construire la structure complète du SC. Cependant, les scientifiques n'ont cartographié que quelques points d'interaction entre ces composants, et comme ces composants peuvent varier énormément dans leurs séquences, ça soulève des questions sur le fait que ces points soient des caractéristiques universelles du SC.

Découverte de Nouveaux Protéines du SC

Dernièrement, deux nouvelles protéines impliquées dans le SC ont été trouvées chez un petit ver appelé C. elegans. Ces protéines, connues sous le nom de SKR-1 et SKR-2, font partie d'une plus grande famille de protéines impliquées dans divers processus cellulaires, y compris la croissance et la reproduction cellulaire. Alors que SKR-1 et SKR-2 sont essentiels pour la structure du SC chez C. elegans, une autre protéine de la même famille, appelée CUL-1, ne semble pas nécessaire pour l'assemblage du SC.

Cette découverte suggère que SKR-1 et SKR-2 jouent un rôle unique en tant que composants du SC, mettant en évidence la complexité de la façon dont différentes protéines interagissent et fonctionnent.

Questions sur le Rôle de SKR-1

Les chercheurs ont commencé à enquêter sur deux questions principales concernant SKR-1 : d'abord, son rôle en tant qu'élément structurel du SC est-il présent chez d'autres espèces de vers apparentées ? Ensuite, est-ce que SKR-1 partage un schéma évolutif similaire avec d'autres protéines du SC ? Dans une espèce de ver apparentée, Pristionchus pacificus, les scientifiques ont identifié une version de SKR-1, appelée Ppa-SKR-1, qui aide aussi à former le SC.

Les études ont montré que Ppa-SKR-1 est crucial pour assembler le SC chez P. pacificus, indiquant que son rôle a été préservé pendant au moins cent millions d'années, remontant à l'ancêtre commun de P. pacificus et C. elegans. Fait intéressant, la structure principale de SKR-1 reste largement inchangée au fil du temps, ce qui est différent de beaucoup d'autres protéines du SC qui ont évolué de manière plus drastique.

Identification de SKR-1 chez P. pacificus

C. elegans et P. pacificus sont tous deux des vers hermaphrodites avec des systèmes Reproductifs et des structures chromosomiques similaires, ce qui les rend de bons sujets pour des études comparatives. Bien que P. pacificus ait peu de protéines en commun avec C. elegans, les chercheurs ont pu identifier Ppa-SKR-1 comme un probable homologue de SKR-1.

En analysant les séquences génétiques, les scientifiques ont confirmé que Ppa-SKR-1 est bien lié à SKR-1 chez C. elegans, fournissant une base solide pour étudier son rôle plus en profondeur.

La Localisation de Ppa-SKR-1

Les chercheurs ont utilisé des techniques avancées pour marquer Ppa-SKR-1 et observer où il se déplace pendant la méiose. Ils ont découvert que Ppa-SKR-1 apparaît sur l'ensemble des chromosomes lors des premières étapes de la méiose, similaire au comportement d'autres protéines du SC. Cette présence constante suggère un rôle important pour Ppa-SKR-1 dans la formation du SC.

En regardant de plus près la structure du SC, ils ont remarqué que Ppa-SKR-1 est positionné au centre du SC, ce qui est essentiel pour sa fonction. Cette localisation centrale s’aligne bien avec d'autres composants du SC, y compris Ppa-SYP-1, indiquant que Ppa-SKR-1 fonctionne comme il se doit.

L'Importance de la Dimerisation dans Ppa-SKR-1

La fonction de protéines comme SKR-1 dépend souvent de leur capacité à se coupler entre elles, un processus appelé dimerisation. Chez C. elegans, les chercheurs ont découvert que lorsque SKR-1 ne peut pas dimeriser, il ne parvient pas à former le SC, indiquant que cette interaction est nécessaire pour sa fonction là-bas.

Dans leurs études, les chercheurs ont également identifié un point critique sur Ppa-SKR-1 nécessaire pour la dimerisation. Ils ont créé une mutation spécifique dans Ppa-SKR-1 pour examiner plus en profondeur sa fonction. Étonnamment, la version mutée a quand même permis aux vers de croître normalement, indiquant que ce point sur la protéine est principalement crucial pour construire le SC tout en ne nuisant pas à d'autres fonctions essentielles.

Observation du Progrès Méiotique

Pour confirmer si la méiose fonctionne correctement, les chercheurs ont compté le total des descendants produits par différents types de vers. Ils ont trouvé que les vers avec le Ppa-SKR-1 standard produisaient un nombre similaire de descendants que les vers de type sauvage, montrant que ça fonctionnait correctement. Toutefois, les vers avec le Ppa-SKR-1 muté ont produit très peu de descendants, suggérant des problèmes significatifs avec la méiose.

En étudiant les paires de chromosomes pendant la méiose, ils ont découvert que les vers avec la mutation avaient du mal à former des connexions correctes entre les chromosomes, entraînant plus de régions d'ADN que prévu. Cette découverte a suggéré des problèmes avec le couplage des chromosomes ou la formation de croisements, soulignant le faible nombre de descendants.

Examen de l'Assemblage des Chromosomes

En examinant la structure des chromosomes, il était clair que les vers avec le Ppa-SKR-1 muté ne pouvaient pas former le SC. Leurs cellules méiotiques ont passé plus de temps prolongé dans les premières étapes où le SC devrait se former. L'absence de SC signifie que ces chromosomes ne pouvaient pas fonctionner ensemble comme ils le devraient, menant aux problèmes observés en matière de reproduction.

L'absence d'un assemblage correct du SC a été confirmée lorsque les chercheurs ont cherché la présence d'autres protéines du SC. Notamment, ces protéines étaient presque absentes chez les vers avec la mutation, soutenant encore l'idée que Ppa-SKR-1 est essentiel pour l'assemblage et la stabilité du SC.

Le Chemin Évolutif Unique de SKR-1

Les chercheurs ont constaté que SKR-1 a un chemin évolutif différent par rapport à d'autres protéines du SC. Alors que beaucoup de protéines du SC ont divergé de manière significative dans leurs séquences, SKR-1 est resté beaucoup plus stable tant chez C. elegans que chez P. pacificus. Cette stabilité est particulièrement évidente dans les parties de la protéine SKR-1 qui interagissent avec d'autres protéines, suggérant que ces interactions pourraient être critiques pour sa fonction.

Alors que beaucoup de protéines du SC contiennent des structures spécifiques appelées domaines enroulés, SKR-1 ne semble pas avoir ces éléments. Cette différence indique que SKR-1 pourrait interagir avec d'autres protéines du SC de manière unique, ce qui pourrait expliquer sa signature évolutive distincte.

Conclusion

En résumé, les chercheurs ont révélé que SKR-1 est un composant structurel crucial du SC chez P. pacificus. Il fonctionne de manière similaire à son homologue chez C. elegans, aidant à former le SC et permettant des fonctions méiotique correctes. L'enquête sur le rôle de SKR-1 a éclairé ses origines anciennes et son importance évolutive de longue date. D'autres études pourraient continuer à découvrir son interaction complexe avec d'autres protéines et son rôle en biologie reproductive. Cette recherche en cours approfondit notre compréhension de la méiose et des relations intriquées entre diverses protéines qui contribuent à ce processus biologique essentiel.

Source originale

Titre: Skp1 is a conserved structural component of the meiotic synaptonemal complex

Résumé: SummaryDuring sexual reproduction, the parental chromosomes align along their length and exchange genetic information. These processes depend on a chromosomal interface called the synaptonemal complex. The structure of the synaptonemal complex is conserved across eukaryotes, but, surprisingly, the components that make it up are dramatically different in different organisms. Here we find that a protein well known for its role in regulating protein degradation has been moonlighting as a structural component of the synaptonemal complex in the nematode Pristionchus pacificus, and that it has likely carried out both of these functions for more than 100 million years. The synaptonemal complex (SC) is a meiotic interface that assembles between parental chromosomes and is essential for the formation of gametes. While the dimensions and ultrastructure of the SC are conserved across eukaryotes, its protein components are highly divergent. Recently, an unexpected component of the SC has been described in the nematode C. elegans: the Skp1-related proteins SKR-1/2, which are components of the Skp1, Cullin, F-box (SCF) ubiquitin ligase. Here, we find that the role of SKR-1 in the SC is conserved in nematodes. The P. pacificus Skp1 ortholog, Ppa-SKR-1, colocalizes with other SC proteins throughout meiotic prophase, where it occupies the middle of the SC. Like in C. elegans, the dimerization interface of Ppa-SKR-1 is required for its SC function. A dimerization mutant, Ppa-skr-1F105E, fails to assemble SC and is almost completely sterile. Interestingly, the evolutionary trajectory of SKR-1 contrasts with other SC proteins. Unlike most SC proteins, SKR-1 is highly conserved in nematodes. Our results suggest that the structural role of SKR-1 in the SC has been conserved since the common ancestor of C. elegans and P. pacificus, and that rapidly evolving SC proteins have maintained the ability to interact with SKR-1 for at least 100 million years.

Auteurs: Ofer Rog, L. E. Kursel, K. Goktepe

Dernière mise à jour: 2024-06-28 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.24.600447

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.24.600447.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

Plus d'auteurs

Articles similaires