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La génétique derrière les fleurs colorées de la digitale

Un aperçu des facteurs génétiques influençant la couleur des fleurs de digitale.

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Digitalis purpurea, communément appelé digitale, est une plante qui peut pousser pendant deux ans. Elle fait partie de la famille des Plantaginaceae et se trouve principalement en Europe, mais peut aussi pousser dans d'autres régions. La digitale est utilisée depuis longtemps pour ses effets bénéfiques sur les problèmes cardiaques, comme la fibrillation auriculaire et l'insuffisance cardiaque congestive. La plante est riche en composés chimiques appelés glycosides cardiaques, le principal étant la digoxine. Ces composés aident le cœur à mieux fonctionner en améliorant sa force et son efficacité.

Les scientifiques ont étudié la digitale pendant des années pour mieux comprendre sa composition chimique et son impact sur les humains. Ils ont aussi exploré des moyens de faire pousser davantage de plantes et d'augmenter la production de ses composés utiles grâce à des techniques de culture de tissus. Un enzyme important impliqué dans la production de digoxine s'appelle le cytochrome P450 CYP87A4. Découvrir tous les gènes qui contribuent à ce processus est crucial pour améliorer les techniques de production.

Apparence et Toxicité

En plus de ses usages médicinaux, la digitale est connue pour ses belles fleurs. La plante peut atteindre jusqu'à six pieds de haut et produit des fleurs violettes ou roses superbes qui poussent sur de longues hampes. Différentes espèces de Digitalis peuvent avoir une large gamme de couleurs et de formes de fleurs. Bien que la plante soit attirante, elle est aussi toxique car elle produit des composés spécialisés, y compris des cardénolides. Malgré tout, la digitale est souvent cultivée comme plante ornementale. Les couleurs des fleurs sont influencées par les Anthocyanines, qui résultent d'un processus spécifique impliquant la Biosynthèse des flavonoïdes. Ce processus commence avec un acide aminé appelé phénylalanine et passe par des voies connexes pour produire des anthocyanines.

Couleur des Fleurs et Facteurs Génétiques

La biosynthèse des flavonoïdes mène aussi à d'autres composés incolores et peut influencer la pigmentation d'une plante. Le processus peut être affecté par l'activité de différentes branches concurrentes de la voie de biosynthèse. Quand la biosynthèse des flavonols est très active, cela peut limiter les matériaux disponibles pour produire des anthocyanines, responsables de la couleur des fleurs. De petites variations dans le fonctionnement des enzymes concurrentes peuvent influencer le mélange final de flavonoïdes produits. L'expression des gènes impliqués dans les voies de biosynthèse joue un rôle clé dans le contrôle de la couleur des fleurs.

Différentes branches de biosynthèse des flavonoïdes sont principalement régulées par des protéines appelées Facteurs de transcription. Depuis des années, les chercheurs étudient la régulation de la biosynthèse des flavonoïdes pour comprendre comment l'activité des gènes est contrôlée chez les plantes. Les gènes responsables de la production d'anthocyanines sont activés par un complexe formé de trois types différents de protéines. Diverses combinaisons de ces protéines peuvent mener à des résultats différents en pigmentation florale. En plus, certaines protéines peuvent spécifiquement aider à transporter les anthocyanines vers leur lieu de stockage dans les cellules végétales.

Taches sur les Fleurs

Les fleurs de digitale n'ont pas une couleur uniforme mais affichent plutôt des taches sombres sur leurs pétales inférieurs. Ce motif se retrouve aussi chez d'autres espèces de plantes. Ces taches peuvent résulter de niveaux élevés d'anthocyanines qui s'accumulent dans ces zones. Entourant les taches, il peut y avoir des régions plus claires où le niveau de flavonols est élevé. La formation de ces taches pigmentées peut s'expliquer par un système où un activateur local travaille avec un répresseur latéral. Ce système permet un contrôle précis des motifs de couleur dans les pétales de fleurs.

Des recherches montrent que la distribution des anthocyanines non seulement attire les pollinisateurs, mais aide aussi à augmenter les taux de visite, rendant la reproduction des plantes plus réussie.

Séquençage et Analyse du Génome

Les scientifiques ont récemment séquencé le génome de D. purpurea pour mieux comprendre les voies métaboliques impliquées dans la production de composés bénéfiques. Ils ont collecté des graines de plantes à fleurs rouges et blanches pour analyser leur composition génétique. Les plantes ont été cultivées dans des conditions contrôlées pour garantir des échantillons de haute qualité pour l'extraction de l'ADN. Après avoir obtenu l'ADN, diverses méthodes ont été utilisées pour séquencer les données, ce qui a mené à l'assemblage d'un génome détaillé.

Les chercheurs visaient à trouver des différences entre les gènes des plantes rouges et blanches, en se concentrant particulièrement sur ceux impliqués dans la production de pigments. Les données de séquençage ont révélé la présence de gènes spécifiques responsables de la voie de biosynthèse des anthocyanines.

Gènes d'Intérêt

Ces gènes codent pour des enzymes nécessaires à la production d'anthocyanines, les pigments responsables de la couleur des fleurs. L'étude s'est concentrée sur l'identification des gènes actifs dans les pétales de fleurs et la détermination de leur fonction. Les facteurs de transcription qui contrôlent l'activité de ces gènes ont également été examinés.

Certains gènes identifiés sont connus pour réguler la biosynthèse des anthocyanines, tandis que d'autres améliorent le processus. Chacun de ces gènes joue un rôle essentiel dans la détermination de la couleur des fleurs. L'analyse de l'expression génique a montré quels gènes étaient actifs dans les pétales et où ils se trouvaient dans le génome.

Investigation des Différences de Pigmentation

En comparant les plantes à fleurs rouges et blanches, les chercheurs ont trouvé des différences notables dans les séquences de gènes qui pourraient expliquer le manque de pigmentation dans les fleurs blanches. Une découverte importante était une grande insertion dans le gène ANS des plantes à fleurs blanches. Cette insertion conduit probablement à une perte de fonction du gène, empêchant la production d'anthocyanines, qui est cruciale pour la couleur rouge des fleurs.

Une autre différence significative a été trouvée dans le gène MYB5, qui a également joué un rôle dans la pigmentation. Ce gène présentait une délétion dans les plantes à fleurs blanches, indiquant qu'il pourrait affecter la capacité de la fleur à produire de la couleur.

Conclusion

L'étude de la digitale et de sa composition génétique éclaire les processus complexes impliqués dans la production de couleur des fleurs. Comprendre les gènes et les voies en jeu aide non seulement à expliquer la beauté frappante de ces plantes, mais souligne aussi leur importance en médecine. En enquêtant sur les variations entre les fleurs rouges et blanches, les chercheurs peuvent travailler vers de meilleures méthodes de production et gagner des insights en génétique végétale qui peuvent s'appliquer à d'autres espèces aussi.

Les résultats sur la biosynthèse des anthocyanines et les différences de pigments fournissent une base pour de futures recherches sur comment les plantes s'adaptent visuellement et fonctionnellement à leur environnement. Les études futures pourraient aider à développer de nouvelles cultivars à fleurs et à améliorer la valeur ornementale de la digitale tout en garantissant la sécurité concernant sa toxicité.

Source originale

Titre: Genome sequence of the ornamental plant Digitalis purpurea reveals the molecular basis of flower color and morphology variation

Résumé: Digitalis purpurea (foxglove) is a widely distributed ornamental plant and the producer of the biomedical compound digoxin. Here, we present a long read sequencing-based genome sequence of a red flowering D. purpurea plant and a corresponding prediction of gene models. The high assembly continuity is indicated by the N50 of 4.3 Mbp and the completeness is supported by discovery of about 96% complete BUSCO genes. This genomic resource paves the way for an in-depth investigation of the flower pigmentation of D. purpurea. Structural genes of the anthocyanin biosynthesis and the corresponding transcriptional regulators were identified. The comparison of red and white flowering plants revealed a large insertion in the anthocyanidin synthase gene in white flowering plants that most likely renders this gene non-functional and could explain the loss of anthocyanin pigmentation. In addition, the anthocyanin biosynthesis activator MYB5 shows a 18 bp deletion in white flowering plants that results in the loss of 6 amino acids in the protein. Furthermore, we found a large insertion in the DpTFL1/CEN gene to be responsible for the development of large terminal flowers.

Auteurs: Boas Pucker, J. M. Horz, K. Wolff, R. Friedhoff

Dernière mise à jour: 2024-08-15 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.14.580303

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.14.580303.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

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