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# Biologie# Biophysique

Nouvelle méthode pour étudier le cholestérol et les membranes

Une nouvelle méthode pour ajuster les niveaux de cholestérol dans les liposomes pour des études de protéines.

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Les membranes biologiques sont des structures super importantes dans toutes les cellules vivantes. Elles ont des propriétés spéciales comme la fluidité, l'épaisseur et leur capacité à être compressées. Ces propriétés jouent un grand rôle dans le fonctionnement des Protéines à l'intérieur des membranes. Un lipide clé qu'on trouve dans beaucoup de cellules animales, c'est le Cholestérol. Il aide à réguler le comportement des membranes, y compris leur rigidité et la facilité avec laquelle des substances peuvent passer à travers.

Le cholestérol n'est pas réparti uniformément dans la membrane ; on le trouve en différentes quantités de chaque côté. En modifiant la façon dont les lipides sont empaquetés, le cholestérol peut rendre la membrane plus épaisse et moins compressible. Quand les parties d'une protéine qui traversent la membrane ne correspondent pas à l'épaisseur de la membrane, les protéines ont tendance à s'agglutiner. Ça aide à réduire la tension énergétique sur la membrane.

Certaines protéines, comme les scramblases lipidiques, profitent de ces distorsions dans la membrane pour faciliter l'échange de lipides. Ces protéines peuvent déplacer des substances grasses d'un côté de la membrane à l'autre, ou elles peuvent aider à déplacer des parties d'elles-mêmes qui aiment l'eau à travers le noyau lipidique de la membrane. La capacité d'une membrane à être compressée semble influencer le fonctionnement de ces protéines.

Cependant, c'est dur de déterminer comment chaque propriété de la membrane est importante pour une protéine spécifique. C'est parce que les propriétés des membranes sont liées, et changer une chose peut affecter d'autres. De plus, beaucoup de propriétés des membranes ne peuvent pas être mesurées facilement. Enfin, reconstituer des protéines de membrane dans des membranes complexes qui ont du cholestérol et ne sont pas uniformes, c'est un gros défi. C'est surtout vrai pour les protéines qui dépendent de la distorsion de la membrane pour bien fonctionner. Mettre des protéines avec des épaisseurs mismatched dans des membranes riches en cholestérol peut entraîner des problèmes comme l'agglutination et la distribution inégale des protéines et des lipides.

Pour relever ces défis, de nouvelles méthodes sont nécessaires pour étudier les protéines de membrane dans des conditions contrôlées.

Nouvelle Approche Expérimentale

On a développé une nouvelle méthode pour modifier les niveaux de cholestérol dans de petites Liposomes, qui sont de petites bulles faites de lipides. On utilise une substance appelée méthyl-β-cyclodextrine (mβCD) dans un dispositif de dialyse. MβCD est un sucre qui peut s'accrocher au cholestérol, donc il peut soit délivrer soit enlever du cholestérol des liposomes.

Utiliser mβCD nous permet de garder les liposomes dans une zone séparée tout en changeant les niveaux de cholestérol autour d'eux. Ça facilite le retrait de mβCD après avoir délivré du cholestérol, ce qui nous permet de mesurer comment le cholestérol est inséré dans les liposomes.

On a commencé par tester cette méthode sur des liposomes faits d'un lipide commun appelé POPC. Les liposomes ont été placés dans un bain avec mβCD chargé de cholestérol. On a mesuré combien de cholestérol était absorbé par les liposomes au fil du temps. On a constaté que la quantité de cholestérol augmentait considérablement après seulement quelques heures.

On a aussi testé si le cholestérol pouvait être enlevé des liposomes en utilisant du mβCD vide dans un nouveau bain. Encore une fois, on a observé une baisse claire des niveaux de cholestérol pendant ce processus.

Note sur la Spectroscopie C-Laurdan

Pour faire ça, on a utilisé un colorant spécial appelé C-Laurdan qui change de couleur selon l'empaquetage des lipides dans la membrane. Ce changement de couleur nous donne des indices sur comment le cholestérol affecte la structure de la membrane.

Garder les Liposomes Intacts

Quand on utilise mβCD, il est crucial que les liposomes ne se cassent pas. Si on ajoute trop de mβCD, ça peut dissoudre complètement les liposomes. Dans nos expériences, on a gardé le ratio de lipides à mβCD suffisamment bas pour que les liposomes restent intacts pendant l'échange de cholestérol.

Pour vérifier l'intégrité des liposomes, on les a chargés avec un colorant fluorescent appelé carboxyfluorescéine (CF). Tant que les liposomes restaient intacts, le colorant restait enfermé et ne fluorescait pas beaucoup. Si la membrane se brisait, la fluorescence augmenterait. Tout au long de nos expériences, on a observé seulement de petits changements de fluorescence, ce qui suggère que les liposomes sont restés intacts.

Taux de Livraison de Cholestérol

Ensuite, on a regardé comment changer la température affectait la rapidité avec laquelle le cholestérol pouvait être livré aux liposomes. On a testé à différentes températures et on a trouvé qu'à des températures plus élevées, le cholestérol entrait dans les liposomes beaucoup plus vite.

On a aussi vérifié comment la taille des trous dans la membrane de dialyse (qui permet à mβCD de passer) impactait la livraison de cholestérol. Des trous plus grands permettaient un transfert de cholestérol plus rapide, tandis que des trous plus petits le ralentissaient.

Transfert de Cholestérol Entre Liposomes

On voulait ensuite voir si notre dispositif pouvait être utilisé pour transférer le cholestérol entre deux ensembles de liposomes différents. On a utilisé une version fluorescente du cholestérol appelée déhydroergostérol (DHE) pour suivre le transfert. En déplaçant DHE des liposomes donneurs vers des liposomes récepteurs, on a vu une diminution de la fluorescence chez les donneurs et une augmentation chez les récepteurs.

Cela a montré que notre méthode permettait un transfert efficace des stérols entre différents liposomes, soulignant la polyvalence de notre configuration expérimentale.

Analyser l'Oléomérisation des Protéines

On était aussi intéressés par comment changer les niveaux de cholestérol pourrait affecter les protéines qui traversent la membrane. On s'est concentrés sur une protéine spécifique appelée Ire1, qui est impliquée dans la détection des changements dans la membrane. Elle peut devenir dimérisée, ce qui signifie que deux de ses unités se rejoignent, quand la membrane devient plus rigide ou plus épaisse.

En utilisant notre installation pour ajuster les niveaux de cholestérol dans les liposomes contenant Ire1, on a observé qu'à mesure que le cholestérol était introduit, la dimérisation d'Ire1 augmentait. Quand on a retiré le cholestérol, la dimérisation a diminué. Ça montre que la présence de cholestérol peut influencer de manière significative le comportement de ces protéines.

Avantages de Notre Méthode

Notre technique offre une façon simple de modifier les niveaux de cholestérol dans les liposomes, ce qui peut être utile pour diverses études scientifiques. Certains avantages de notre méthode incluent :

  1. Haute Récupération : On peut facilement récupérer les liposomes après les expériences.
  2. Séparation des Échantillons : Les différentes populations de liposomes restent séparées tout au long de l'expérience.
  3. Polyvalence : Notre approche peut fonctionner avec différents types de membranes et n'est pas limitée qu'aux liposomes.

Limitations à Considérer

Bien que cette méthode ait beaucoup d'avantages, il y a quelques limitations. D'abord, l'échange de lipides prend du temps, donc seules les protéines stables qui peuvent supporter des durées plus longues peuvent être étudiées. Deuxièmement, il peut y avoir un transfert involontaire de différents lipides avec le cholestérol.

Conclusion

On a établi une nouvelle méthode qui permet la modification réversible des niveaux de cholestérol dans les liposomes. Cette méthode peut aider les chercheurs à étudier l'impact du cholestérol sur les protéines membranaires de manière contrôlée. En ajustant les niveaux de cholestérol, les scientifiques peuvent obtenir des informations sur comment les protéines se comportent dans différents environnements membranaires. Cette avancée améliore notre capacité à comprendre la dynamique des membranes et les interactions des protéines, qui sont cruciales pour de nombreux processus biologiques.

Source originale

Titre: Reversible tuning of membrane sterol levels by cyclodextrin in a dialysis setting

Résumé: Large unilamellar vesicles (LUVs) are popular membrane models for studying the impact of lipids and bilayer properties on the structure and function of individual membrane proteins. The functional reconstitution of transmembrane in liposomes can be challenging, especially, if the hydrophobic thickness of the protein does not match the thickness of the surrounding lipid bilayer. During the reconstitution procedure Such hydrophobic mismatch causes low yields and protein aggregation, which are exacerbated in sterol-rich membranes featuring low membrane compressibility. Here, we explore new approaches to reversibly tune membrane sterol contents proteoliposomes after their formation. Both cholesterol delivery and extraction are mediated by methyl-{beta}-cyclodextrin in a dialysis setting, which maintains (proteo)liposomes in a confined compartment. This makes it possible to reversibly tune the cholesterol level without losing membrane material simply by placing the dialysis cassette in a new bath containing either empty or cholesterol-loaded methyl-{beta}-cyclodextrin. Cholesterol delivery and removal is monitored with the solvatochromic probe C-Laurdan, which reports on lipid packing. Using Forster-resonance energy transfer, we show that cholesterol delivery to proteoliposomes induces the oligomerization of a membrane property sensor, while the subsequent removal of cholesterol demonstrates the full reversibility. We propose that tuning membrane compressibility by methyl-{beta}-cyclodextrin-meditated cholesterol delivery and removal in a dialysis setup provides a new handle to study its impact on membrane protein structure, function, and dynamics. Statement of significanceGenerating complex, sterol-rich, biomimetic membranes for studying the structure and function of reconstituted membrane proteins is challenging. As an important step towards asymmetric, sterol-rich, complex model membrane systems, we have established a procedure to control the membrane sterol level of liposomes and proteoliposomes using methyl-{beta}-cyclodextrin in a dialysis setup. We demonstrate the feasibility of this approach by C-Laurdan and dehydroergosterol fluorescence spectroscopy and gain control over the membrane sterol content. We explore several parameters that affect the rate of cholesterol delivery and show that the oligomerization of a membrane property sensor, which is on the unfolded protein response sensor protein Ire1, is controlled by the sterol content of the surrounding lipid bilayer.

Auteurs: Cynthia Alsayyah, Emmanuel Rodrigues, Julia Hach, Mike F. Renne, Robert Ernst

Dernière mise à jour: 2024-09-30 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.28.615506

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.28.615506.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

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