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# Biologie# Immunologie

Vaccins : Déchiffrer la réponse immunitaire

Les scientifiques étudient les réponses immunitaires pour créer de meilleurs vaccins.

Kirsten Browne-Cole, Kyrin R. Hanning, Kevin Beijerling, Meghan Rousseau, Jacelyn Loh, William Kelton

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Les vaccins, c'est un peu comme un camp d'entraînement pour notre système immunitaire. Ils apprennent à nos corps à reconnaître et à combattre les germes. Quand on se vaccine, notre système immunitaire se met en route, produisant des cellules spéciales appelées Cellules B et T. Ces cellules aident à créer une défense contre des pathogènes spécifiques, qui sont les méchants qui peuvent nous rendre malades. Plus ces cellules fonctionnent bien, plus notre protection est forte.

Le rôle des Anticorps dans la vaccination

Les anticorps sont des protéines fabriquées par les cellules B. Ils se fixent aux pathogènes pour aider à les marquer pour destruction. Il y a deux types de régions sur les pathogènes que les anticorps peuvent cibler : les Épitopes linéaires et conformations. Les épitopes linéaires, c'est comme une ligne droite de lettres, tandis que les épitopes conformations, c'est comme un fouillis de lettres qui changent de forme quand la protéine se plie. Comprendre où ces petites protéines jouent peut aider les scientifiques à concevoir de meilleurs vaccins.

Réponse des anticorps et efficacité des vaccins

Un vaccin réussi provoque une réponse immunitaire forte et durable, surtout des cellules B et T. Les Cellules T reconnaissent des morceaux du pathogène présentés par d'autres cellules grâce à un processus d'aide. Les anticorps, eux, peuvent se lier directement au pathogène. En sachant comment les anticorps reconnaissent des parties d'un virus ou d'une bactérie, les scientifiques peuvent créer des vaccins qui encouragent des réponses immunitaires fortes ciblant des zones spécifiques, souvent appelées épitopes neutralisants.

Outils pour comprendre les réponses des anticorps

Les scientifiques ont des outils pour étudier ces réponses immunitaires. Ils utilisent des techniques de laboratoire ultra-rapides pour voir comment les vaccins fonctionnent. Une méthode populaire utilise quelque chose appelé affichage de phages, qui permet aux chercheurs de présenter différentes petites pièces d'un virus ou d'une bactérie (épitopes) et de voir lesquelles les anticorps attrapent. Cette méthode, c'est un peu comme mettre en place un buffet de petites protéines et regarder lesquelles plaisent le plus au système immunitaire.

Le défi de la cartographie des anticorps

Une des techniques les plus précises pour cartographier où se lient les anticorps s'appelle la cristallographie. Pense à ça comme prendre une photo de la porte verrouillée où l'anticorps s'insère. Mais cette méthode peut être lente et nécessiter beaucoup de ressources. Pour aller plus vite, les scientifiques utilisent aussi la technologie de séquençage rapide pour analyser les interactions des anticorps. Ils créent des bibliothèques de fragments de peptides à partir d'antigènes et voient comment bien ils se lient aux anticorps de personnes vaccinées.

Le parcours de TeeVax3

TeeVax3 est un candidat vaccin destiné à protéger contre le Streptocoque du groupe A, une bactérie qui peut causer divers troubles, y compris l'angine streptococcique. Malgré les efforts des scientifiques depuis des années, il n'y a pas encore de vaccin approuvé pour ce germes embêtant. Le défi réside dans la diversité des souches de la bactérie et le potentiel de déclencher des réponses immunitaires indésirables.

Pour y faire face, les scientifiques ont regroupé plusieurs antigènes différents de diverses souches dans la formule du vaccin TeeVax3. Des études sur des animaux ont montré que ces combinaisons peuvent produire des réponses immunitaires efficaces. Mais comprendre comment ces réponses immunitaires fonctionnent en détail est crucial.

Affichage de phages et isolation des anticorps

Dans leur quête pour étudier la réponse immunitaire de TeeVax3, les chercheurs ont créé une bibliothèque spéciale de fragments de peptides issus du vaccin. Ensuite, ils ont utilisé un système d'affichage de phages pour voir quelles pièces les anticorps de lapins vaccinés allaient attraper. Cela impliquait d'infecter des cellules avec des bactériophages spécialement modifiés qui transportent les antigènes, laissant les chercheurs filtrer pour trouver les meilleures pièces.

Analyser les données

Après avoir exploré la bibliothèque de peptides plusieurs fois, les chercheurs ont fait une surprise. Un pourcentage élevé de liaisons se concentrait sur l'extrémité N-terminale de l'antigène TeeVax3. Cette région contenait un tag épitope 6-His, souvent utilisé dans les processus de purification des protéines. Ils ont découvert que ce tag attirait une proportion importante d'anticorps, ce qui a surpris, puisque les tags épitopes sont généralement considérés comme non immunogènes.

Comprendre le biais des anticorps

En creusant davantage, les scientifiques ont réalisé que la plupart des anticorps se liaient effectivement au tag 6-His. Pour approfondir, ils ont fait des expériences pour comparer à quel point les anticorps reconnaissaient l'antigène TeeVax3 avec et sans le tag. Ils ont trouvé que la présence du tag augmentait considérablement la reconnaissance des anticorps, ce qui suggère qu'il aurait pu être plus immunogène que prévu.

Le bon, le mauvais et les tags épitopes

Ayant réalisé que le tag 6-His était un peu trop populaire, les chercheurs ont ri. Ce qui devait être juste une aide s'est révélé être la vedette de la soirée ! Ça leur a montré que parfois, ce qu'on pense inoffensif peut finir par voler la vedette. C'est un rappel que les scientifiques doivent soigneusement vérifier leurs conceptions lors du développement de vaccins.

Enlever le tag a aidé à clarifier comment les anticorps se comportaient réellement. En digérant l'antigène TeeVax3 et en se débarrassant du tag, ils pouvaient voir combien de la réponse des anticorps était authentique et combien était boostée à cause de la personnalité charmante du tag.

Cartographie des peptides pour affiner

En réalisant que certaines régions attiraient beaucoup d'attention, les scientifiques ont décidé de décomposer encore plus les choses. Ils ont créé de petits peptides synthétiques pour voir précisément quelles parties du tag 6-His étaient attrayantes pour les anticorps. Ils ont fabriqué des peptides de différentes longueurs, retirant progressivement les couches pour identifier la séquence spécifique qui attirait l'œil du système immunitaire.

Les résultats ont montré que le peptide plus long avait des signaux de liaison plus élevés. Étonnamment, à mesure que les peptides devenaient plus courts, la liaison diminuait, c'est un peu comme essayer de déchiffrer un message qui se réduit de plus en plus jusqu'à ce qu'il ne reste que quelques lettres.

La vue d'ensemble du développement des vaccins

Ce travail minutieux montre à quel point la réponse immunitaire peut être complexe et pourquoi les vaccins ont besoin d'une conception soignée. En cartographiant comment différentes parties d'un vaccin fonctionnent, les chercheurs peuvent améliorer les futurs vaccins. S'ils peuvent comprendre ce qui rend une réponse immunitaire efficace, ils peuvent développer une meilleure protection contre les maladies.

L'importance de la recherche continue

Alors que la science continue d'avancer, les outils et méthodes pour enquêter sur les réponses immunitaires deviennent plus rapides et plus efficaces. Comprendre les réponses des anticorps est essentiel pour fabriquer des vaccins qui fonctionnent pour tout le monde.

Avec une recherche et un développement continus, on peut espérer voir des percées dans les conceptions de vaccins qui protègeront contre diverses maladies, y compris celles causées par des pathogènes coriaces comme le Streptocoque du groupe A.

Conclusion

Dans le monde des vaccins, le système immunitaire est un paysage complexe mais fascinant. Les scientifiques apprennent constamment comment les anticorps interagissent avec différentes parties des pathogènes et comment optimiser ces réponses pour une meilleure efficacité des vaccins. Avec des méthodes comme l'affichage de phages et la cartographie des peptides, ils mettent les pièces du puzzle ensemble et repoussent les frontières de la science médicale. Et tout comme un comédien qui tombe par accident sur une blague, parfois, des découvertes inattendues mènent aux plus grands éclats de rire - et aux meilleures avancées !

Source originale

Titre: A rapid approach for linear epitope vaccine profiling reveals unexpected epitope tag immunogenicity

Résumé: Antibody epitope profiling is essential for assessing the robustness of vaccine-induced immune responses, particularly while in development. Despite advancements in computational tools, high throughput experimental epitope validation remains an important step. Here, we describe a readily accessible method for rapid linear epitope profiling using phage-displayed oligo pools in combination with Nanopore deep sequencing. We applied this approach to TeeVax3, a Group A Streptococcus vaccine candidate, to investigate the antibody response generated in a pre-clinical rabbit model and assess antigen immunogenicity. Surprisingly, we found a strong bias in antibody binding response towards the N-terminal epitope tag used for purification. These tags are widely reported to have low immunogenicity and are frequently left uncleaved in pre-clinical studies. We further confirmed that the observed immune response against the epitope tag dominated even the conformational binding response and, using synthetic peptides, narrowed the epitope down to a set of 10 residues inclusive of the Histidine residues. Our findings highlight the importance of epitope-tag removal in pre-clinical studies and demonstrate the utility of rapid nanopore sequencing for early-stage vaccine evaluation.

Auteurs: Kirsten Browne-Cole, Kyrin R. Hanning, Kevin Beijerling, Meghan Rousseau, Jacelyn Loh, William Kelton

Dernière mise à jour: 2024-12-12 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.08.627427

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.08.627427.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

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