Nuevas fibras dietéticas y salud intestinal
Un estudio revela cómo los IMMPs pueden mejorar las bacterias buenas del intestino.
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Tabla de contenidos
El intestino humano es hogar de una gran variedad de organismos diminutos, incluyendo bacterias, virus y otros microbios. Estos organismos juegan un papel importante en mantenernos saludables. Trabajan juntos e interactúan entre ellos y con nuestros cuerpos. Entender cómo funcionan estas interacciones podría ayudarnos a encontrar formas de mejorar la salud intestinal y fortalecer nuestro sistema inmunológico.
Para cambiar la composición y actividad de las bacterias intestinales, la gente usa diferentes métodos. Algunas formas son suaves, como tomar suplementos dietéticos como prebióticos y probióticos o cambiar la dieta. Otras son más drásticas, como antibióticos o trasplantes fecales. Los prebióticos son tipos especiales de fibras que nuestros cuerpos no pueden digerir, pero que las buenas bacterias en nuestro intestino sí pueden. Estas fibras pueden ayudar a que las buenas bacterias crezcan y produzcan sustancias que son beneficiosas para nuestra salud.
Isomalto/Malto-Polisacáridos (IMMPs)
Se ha desarrollado un nuevo tipo de fibra prebiótica llamada isomalto/malto-polisacáridos (IMMPs). Estas fibras provienen del almidón y se crean alterando la estructura del almidón a través de un proceso específico. La estructura única de los IMMPs hace que sea difícil para nuestros cuerpos digerirlos en el intestino delgado, permitiendo que lleguen al intestino grueso. Ahí, pueden ser descompuestos por las bacterias intestinales.
Estudios anteriores en laboratorio han mostrado que cuando los IMMPs sirven como fuente de alimento para las bacterias intestinales, pueden llevar a la producción de ácidos grasos de cadena corta (SCFAs), que son compuestos beneficiosos para nuestra salud. En este estudio, analizamos cómo tres tipos de IMMPs afectan la composición y función de las bacterias intestinales cuando son fermentados usando muestras de heces de adultos sanos. También examinamos un cuarto tipo de IMMP que había sido sometido a un procesamiento adicional para eliminar algunas partes de almidón fácilmente digestibles.
Nuestros hallazgos mostraron que ciertos cambios en las bacterias intestinales, como un aumento en grupos como Bifidobacterium y Lactobacillus, estaban relacionados con la presencia de IMMPs. Estos cambios también se reflejaron en la actividad de genes específicos y en la producción de SCFAs.
Experimentos de Fermentación
Realizamos dos experimentos de laboratorio para ver cómo las diferentes IMMPs eran descompuestas por las bacterias intestinales con el tiempo. En el primer experimento, usamos IMMPs con diferentes cantidades de la estructura específica que nos interesaba. El segundo experimento analizó un IMMP con una alta cantidad de esa estructura y una versión procesada de uno de los otros IMMPs. Tomamos muestras en varios momentos para entender mejor cómo reaccionaban las bacterias intestinales a los diferentes tipos de fibra.
Se utilizaron controles de calidad y análisis estadísticos para asegurar la fiabilidad de nuestros resultados. Procesamos las muestras y analizamos los datos para ver cómo los diferentes grupos microbianos respondían a los diferentes IMMPs con el tiempo.
Estructura de la Comunidad y Patrones de Expresión
Los resultados mostraron que podíamos asignar un gran número de los genes expresados a grupos bacterianos específicos. La mayoría de los genes estaban relacionados con grupos bien conocidos como Bacteroidales, Clostridiales y Lactobacillales. Un género específico, Bacteroides, tenía el mayor número de genes asignados.
Al observar la expresión de estos genes con el tiempo, notamos varios patrones. Algunos genes estaban activos desde el principio, mientras que otros se activaron más tarde, lo que sugiere cambios en la actividad de las bacterias dependiendo del ambiente. En particular, las bacterias intestinales como Bacteroides se volvieron más activas después de que comenzó la fermentación, indicando que jugaron un papel importante en la descomposición de los IMMPs.
Co-Ocurrencia de Taxa
También queríamos ver cómo diferentes grupos bacterianos interactuaban entre sí durante el proceso de fermentación. Examinamos si ciertos grupos tendían a aparecer juntos en las muestras, especialmente en relación con los diferentes IMMPs. Nuestro análisis mostró que podíamos identificar grupos estables de bacterias que se comportaban de manera similar en diferentes condiciones.
Algunos grupos solo se encontraron al principio del experimento y no después. Otros grupos incluían bacterias beneficiosas bien conocidas como Bifidobacterium y Lactobacillus, que prosperaron en cultivos con IMMPs. En contraste, un grupo dominado por E. coli estaba presente principalmente sin IMMPs.
Patrones de Expresión Génica Específicos
Al observar los datos de expresión génica, descubrimos que podíamos ver diferentes patrones de actividad dentro de los grupos bacterianos. Emergieron algunos patrones principales, con un patrón mostrando genes que solo estaban activos al principio y no después. Otro patrón estaba presente solo en el grupo de control después de 48 horas, mientras que el patrón más común incluía genes que se activaron a medida que la fermentación progresaba.
Estos patrones indicaron cómo algunas bacterias aumentaron su actividad en respuesta a la presencia de IMMPs. Por ejemplo, Bifidobacterium y Lactobacillus mostraron una mayor expresión génica cuando se expusieron a ciertos IMMPs, mientras que otras bacterias mostraron una actividad reducida en presencia de esos prebióticos.
Impacto en el Metabolismo
También analizamos cómo la presencia de IMMPs afectó el metabolismo general de las bacterias intestinales. Varios grupos mostraron una actividad aumentada en rutas metabólicas clave cuando estaban presentes los IMMPs. Por ejemplo, bacterias como Bifidobacterium y Lactobacillus intensificaron sus roles en descomponer azúcares y producir compuestos beneficiosos.
Bacteroides mostró una fuerte actividad en el metabolismo de diferentes sustratos, indicando su versatilidad en utilizar los recursos disponibles. Este grupo jugó un papel crucial en la descomposición de los IMMPs, especialmente durante las etapas posteriores del proceso de fermentación.
Descomposición de IMMPs
En nuestro análisis, nos enfocamos en identificar qué grupos bacterianos eran directamente responsables de descomponer los diferentes tipos de IMMPs. Examinamos genes específicos relacionados con el metabolismo de carbohidratos y encontramos que varios grupos bacterianos estaban involucrados en este proceso de descomposición.
El grupo Bacteroides fue particularmente eficaz en descomponer los IMMPs en azúcares más simples, mientras que otros grupos contribuyeron a la descomposición adicional. Nuestros datos mostraron que la descomposición de los IMMPs fue un esfuerzo coordinado entre múltiples bacterias, subrayando la importancia de la dinámica de la comunidad en el intestino.
Comparación con Otros Estudios
Para fortalecer nuestros hallazgos, comparamos nuestros resultados con otros proyectos de investigación en los que se estudiaron procesos de fermentación similares. Aunque nuestro enfoque tuvo algunas limitaciones, como el uso de muestras de heces mixtas, aún encontramos que nuestros resultados eran comparables a otros estudios que se enfocaron en microbiomas intestinales humanos saludables.
Los patrones generales en nuestros datos mostraron similitudes con los de otros experimentos, lo que sugiere que nuestros hallazgos aportan información valiosa sobre cómo las fibras dietéticas como los IMMPs pueden afectar la salud intestinal.
Conclusión
En resumen, este estudio destacó el potencial de nuevas fibras dietéticas como los IMMPs para influir positivamente en las bacterias intestinales. Al aumentar la abundancia y actividad de las bacterias beneficiosas, estos nuevos prebióticos podrían ofrecer beneficios para la salud y ayudar en la prevención de enfermedades.
Investigaciones futuras deberían seguir enfocándose en las interacciones entre diferentes comunidades microbianas y cómo se pueden usar los componentes dietéticos para optimizar la salud intestinal. El conocimiento adquirido aquí puede informar recomendaciones dietéticas y estrategias para mantener un microbioma intestinal equilibrado, que es esencial para la salud en general.
Título: Metatranscriptomic analysis indicates prebiotic effect of Isomalto/malto-polysaccharides on human colonic microbiota in-vitro
Resumen: Isomalto/malto-polysaccharides (IMMPs) are a novel type of soluble dietary fibres with a prebiotic potential promoting growth of beneficial microbes in the gut. However, the mode of action of IMMPs remains unknown. Previous studies on IMMPs showed an increase in total bacteria, especially lactobacilli, and higher production of short chain fatty acids (SCFA) when IMMPs were fed to rats or used during in vitro fermentation. Here we investigated with metatranscriptomics how IMMPs with different amounts of -(1[->]6) glycosidic linkages affected microbial function during incubation with human faecal inoculum. We showed that active microbial community dynamics during fermentation varied depending on the type of IMMP used and that the observed changes were reflected in the community gene expression profiles. Based on metatranscriptome analysis, members of Bacteroides, Lactobacillus and Bifidobacterium were the predominant degraders of IMMPs, and the increased gene expression in these bacteria correlated with high amounts of -(1[->]6) glycosidic linkages. We also noted an increase in relative abundance of these bacteria and an activation of pathways involved in SCFA synthesis. Our findings could provide a baseline for more targeted approaches in designing prebiotics for specific bacteria and to achieve more controlled modulation of microbial activity towards desired health outcomes.
Autores: Bastian V.H. Hornung, K. Borewicz, F. Gu, P. H. van der Zaal, H. A. Schols, P. J. Schaap, H. Smidt
Última actualización: 2024-02-05 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.31.573771
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.31.573771.full.pdf
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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