Lassa-Fieber: Eine anhaltende Herausforderung in Westafrika
Lassa-Fieber stellt in Westafrika ein grosses Gesundheitsrisiko dar, mit vielen Infektionen jedes Jahr.
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Inhaltsverzeichnis
Lassa-Fieber ist ne ernsthafte Krankheit, die durch ein Virus namens Lassa-Mammarenavirus (LASV) verursacht wird. Es betrifft hauptsächlich Menschen in Westafrika und führt jedes Jahr zu vielen Infektionen und Todesfällen. Die Weltgesundheitsorganisation erkennt an, dass LASV in acht Ländern Westafrikas vorhanden ist: Benin, Ghana, Guinea, Liberia, Mali, Sierra Leone, Togo und Nigeria.
Lassa-Fieber wird hauptsächlich durch Nagetiere verbreitet, insbesondere die Natal-Multimammate-Ratte. Aber auch andere Nagetierarten können das Virus tragen. Menschen können sich infizieren, wenn sie mit dem Kot oder Urin dieser Nagetiere in Kontakt kommen oder die Dämpfe einatmen. Es gibt zwar gelegentliche Berichte über Mensch-zu-Mensch-Übertragungen, aber die sind im Vergleich zu den Infektionen, die von Nagetieren kommen, ziemlich selten.
Die Auswirkungen des Lassa-Fiebers
Jedes Jahr infizieren sich schätzungsweise 900.000 Leute mit Lassa-Fieber, was zu mehreren Tausend Todesfällen in Westafrika führt. Viele, die sich mit dem Virus anstecken, suchen keine medizinische Hilfe, und es wird angenommen, dass ein grosser Teil der Infektionen keine Symptome zeigt oder nur milde Krankheitsverläufe hat. Daher ist es ziemlich schwierig, genau zu zählen, wie viele Fälle es gibt.
Die Symptome von Lassa-Fieber können mit anderen Krankheiten wie Malaria überlappen, was die Diagnose noch schwieriger macht. Ausserdem variiert die Verfügbarkeit von Tests zur Bestätigung von Lassa-Fieber stark von einem Gebiet zum anderen. Einige Krankenhäuser haben besseren Zugang zu diesen Tests als andere, was zu Unterschieden in den gemeldeten Fällen führen kann.
Die Rolle von Nagetieren bei der Verbreitung des Virus
Der Hauptträger des Virus ist die Natal-Multimammate-Ratte. Auch andere Nagetierarten wurden gefunden, die das Virus tragen. Menschen infizieren sich hauptsächlich durch Kontakt mit infizierten Nagetieren. Obwohl der regelmässige Kontakt mit infizierten Nagetieren der häufigste Weg ist, wie sich das Virus verbreitet, gab es einige Fälle, in denen das Virus von einer Person zur anderen überging, besonders in Krankenhausumgebungen.
Um besser zu verstehen, wie sich das Virus verbreitet, haben Wissenschaftler viele genetische Proben des Virus aus verschiedenen Orten untersucht. Diese Forschung hilft zu zeigen, wo das Virus vorhanden ist und die Beziehungen zwischen verschiedenen Stämmen des Virus in unterschiedlichen Regionen.
Daten sammeln und Proben analysieren
Wissenschaftler sammeln Genetische Daten von LASV aus einer öffentlichen Datenbank. Sie schauen sich das genetische Material an, das mit diesen Proben verknüpft ist, um zu verstehen, wo das Virus gemeldet wurde. Dazu gehört, fehlende Details darüber zu prüfen, wo und wann Proben gesammelt wurden. Um sicherzustellen, dass die Daten genau und vollständig sind, werden Proben mit erheblichen fehlenden Informationen von der Analyse ausgeschlossen.
Forscher suchen auch nach Mustern, woher die Proben stammen. Die Anzahl der gemeldeten menschlichen Fälle von Lassa-Fieber mit der Anzahl der Virusproben aus jedem Land zu vergleichen hilft, Regionen zu identifizieren, in denen mehr Forschung benötigt wird.
Verständnis von Sampling-Bias
Eine wichtige Erkenntnis ist, dass es eine starke Verbindung zwischen der Anzahl der gemeldeten menschlichen Fälle und der Anzahl der gesammelten Virusproben aus bestimmten Ländern gibt. Das bedeutet, dass Länder, die mehr menschliche Fälle melden, auch mehr Virusproben zur Verfügung haben. Wenn man sich jedoch die Proben von Nagetieren anschaut, scheint es wenig Korrelation zu geben, was darauf hindeutet, dass Nagetierdaten in Gebieten mit hohen menschlichen Fällen unterrepräsentiert sind.
Als Forscher die regionalen Daten untersuchten, stellten sie fest, dass mehr Proben tendenziell aus bestimmten Gebieten in Nigeria und Guinea stammen, wo mehr Aufwand und Fokus auf Forschung gelegt wurde. Das deutet darauf hin, dass in anderen Gebieten gründlicher gesammelt werden muss, um ein klareres Bild davon zu bekommen, wo Lassa-Fieber vorhanden ist.
Phylogenetische Analyse und Virus-Evolution
Eine weitere Analyse der genetischen Daten zeigt, dass Lassa-Fieber-Stämme oft basierend auf ihrem Fundort gruppiert werden. Das Virus hat verschiedene Linien, wobei einige in bestimmten Ländern verbreiteter sind. Zum Beispiel sind bestimmte Stämme hauptsächlich in Nigeria zu finden, während andere in Liberia und Guinea vorkommen.
Der Zeitpunkt, wann diese Stämme in menschlichen Populationen auftauchten, kann auch aus den genetischen Daten abgeleitet werden. Forschungen deuten darauf hin, dass das Virus möglicherweise länger unter Menschen zirkuliert als zuvor gedacht. Zu verstehen, wie sich das Virus im Laufe der Zeit und über verschiedene Regionen ausgebreitet hat, ist wichtig, um zukünftige Ausbrüche zu bekämpfen.
Die Bedeutung umfassender Daten
Diese Studie betont die Notwendigkeit, mehr vollständige Daten über Lassa-Fieber zu sammeln. Während sich viel Forschung auf menschliche Fälle und Proben konzentriert, gibt es einen erheblichen Mangel an Daten von Nagetier-Hosts, die für das Verständnis des gesamten Landschaft des Virus wichtig sind. Eine breitere Palette von Proben aus nicht-menschlichen Quellen würde helfen, Lücken in unserem aktuellen Wissen über die Evolution und Verbreitung des Virus zu schliessen.
Zusätzlich wird festgestellt, dass viele der verfügbaren genetischen Sequenzen aus spezifischen Forschungsprogrammen stammen, die sich auf Lassa-Fieber konzentrieren, was auf einen möglichen Bias zugunsten bestimmter Regionen mit höherer Forschungsaktivität hindeutet. Das schafft Herausforderungen bei der effektiven Analyse der Ausbreitung und Evolution des Virus in allen endemischen Gebieten.
Empfehlungen für zukünftige Forschung
Um das Verständnis von Lassa-Fieber und seiner Übertragung zu verbessern, ist es entscheidend, die Forschungsanstrengungen auszuweiten. Die Anzahl der gesammelten Nagetierproben zu erhöhen, wird helfen, ein klareres Bild von der genetischen Vielfalt des Virus zu bekommen. Forscher sollten auch versuchen, die Sammelbemühungen zwischen menschlichen und Nagetierquellen auszugleichen, um die aktuellen Bias in den Daten zu reduzieren.
Ein grösserer Fokus auf unterforschte Länder wird auch helfen, ein umfassenderes Verständnis dafür zu gewährleisten, wie sich das Virus verbreitet. Der einzigartige Kontext und die Situation jedes Landes können beeinflussen, wie Lassa-Fieber auftritt und sich verbreitet, was inklusive Forschung entscheidend für die Entwicklung effektiver Reaktionsstrategien macht.
Insgesamt ist es wichtig, die Überwachungs- und Forschungsbemühungen sowohl in menschlichen Populationen als auch in Nagetierreservoirs zu verstärken, während das Verständnis von Lassa-Fieber weiterhin wächst. Eine verbesserte Datenerfassung unterstützt letztlich bessere Management- und Reaktionsstrategien für diese ernste Krankheit.
Titel: Current sampling and sequencing biases of Lassa mammarenavirus limit inference from phylogeography and molecular epidemiology in Lassa fever endemic regions.
Zusammenfassung: Lassa fever (LF) is a potentially lethal viral haemorrhagic infection of humans caused by Lassa mammarenavirus (LASV). It is an important endemic zoonotic disease in West Africa with growing evidence for increasing frequency and sizes of outbreaks. Phylogeographic and molecular epidemiology methods have projected expansion of the Lassa fever endemic zone in the context of future global change. The Natal multimammate mouse (Mastomys natalensis) is the predominant LASV reservoir, with few studies investigating the role of other animal species. To explore host sequencing biases, all LASV nucleotide sequences and associated metadata available on GenBank (n = 2,298) were retrieved. Most data originated from Nigeria (54%), Guinea (20%) and Sierra Leone (14%). Data from non-human hosts (n = 703) were limited and only 69 sequences encompassed complete genes. We found a strong positive correlation between the number of confirmed human cases and sequences at the country level (r = 0.93 (95% Confidence Interval = 0.71 - 0.98), p < 0.001) but no correlation exists between confirmed cases and the number of available rodent sequences (r = -0.019 (95% C.I. -0.71 - 0.69), p = 0.96). Spatial modelling of sequencing effort highlighted current biases in locations of available sequences, with increased effort observed in Southern Guinea and Southern Nigeria. Phylogenetic analyses showed geographic clustering of LASV lineages, suggestive of isolated events of human-to-rodent transmission and the emergence of currently circulating strains of LASV from the year 1498 in Nigeria. Overall, the current study highlights significant geographic limitations in LASV surveillance, particularly, in non-human hosts. Further investigation of the non-human reservoir of LASV, alongside expanded surveillance, are required for precise characterisation of the emergence and dispersal of LASV. Accurate surveillance of LASV circulation in non-human hosts is vital to guide early detection and initiation of public health interventions for future Lassa fever outbreaks.
Autoren: Liã Bárbara Arruda, H. B. Free, D. Simons, R. Ansumana, L. Elton, N. Haider, I. Honeyborne, D. Asogun, T. D. McHugh, F. Ntoumi, A. Zumla, R. Kock
Letzte Aktualisierung: 2023-06-22 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.20.23291686
Quell-PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.20.23291686.full.pdf
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